seq1 = pF1KB5029.tfa, 1644 bp
seq2 = pF1KB5029/gi568815576r_36411546.tfa (gi568815576r:36411546_36626121), 214576 bp

>pF1KB5029 1644
>gi568815576r:36411546_36626121 (Chr22)

(complement)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-169  (100413-100458)   100% ->
170-306  (101390-101526)   100% ->
307-392  (102142-102227)   100% ->
393-465  (102841-102913)   100% ->
466-578  (105434-105546)   100% ->
579-711  (106585-106717)   100% ->
712-859  (107212-107359)   100% ->
860-990  (108691-108821)   100% ->
991-1076  (109332-109417)   100% ->
1077-1206  (109515-109644)   100% ->
1207-1349  (113520-113662)   100% ->
1350-1633  (114336-114619)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAAGTTCATGACACCCGTGATCCAGGACAACCCCTCAGGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAAAGTTCATGACACCCGTGATCCAGGACAACCCCTCAGGCTGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCCTGTGCGGTTCCCGAGCAGTTTCGGGATATGCCCTACCAGCCGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCCTGTGCGGTTCCCGAGCAGTTTCGGGATATGCCCTACCAGCCGTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAAGGAGATCGGCTAGGAAAG         GTTGCAGACTGGACAGGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 GCAAAGGAGATCGGCTAGGAAAGGTA...TAGGTTGCAGACTGGACAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCACATACCAAGATAAGAGGTACACAA         ATAAGTACTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100431 GCCACATACCAAGATAAGAGGTACACAAGTA...CAGATAAGTACTCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCAGTTTGGTGGTGGAAGTCAATATGCTTATTTCCATGAGGAGGATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101403 TCAGTTTGGTGGTGGAAGTCAATATGCTTATTTCCATGAGGAGGATGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTAGCTTCCAGCTGGTGGATACAGCGCGCACACAGAAGACGGCCTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101453 GTAGCTTCCAGCTGGTGGATACAGCGCGCACACAGAAGACGGCCTACCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGGAATCGAATGAGATTTGCCCAG         AGGAACCTCCGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101503 CGGAATCGAATGAGATTTGCCCAGGTA...CAGAGGAACCTCCGCAGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAAGATCGTCGGAACATGTTGCAGTTCAACCTGCAGATCCTGCCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102159 CAAAGATCGTCGGAACATGTTGCAGTTCAACCTGCAGATCCTGCCTAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTGCCAAACAGAAAGAGAG         AGAACGCATTCGACTGCAGAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102209 GTGCCAAACAGAAAGAGAGGTG...CAGAGAACGCATTCGACTGCAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGTTCCAGAAACAATTTGGGGTTAGGCAGAAATGGGATCAGAAATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102863 AAGTTCCAGAAACAATTTGGGGTTAGGCAGAAATGGGATCAGAAATCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 G         AAACCCCGAGACTCTTCAGTTGAAGTTCGTAGTGATTGGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102913 GGTA...CAGAAACCCCGAGACTCTTCAGTTGAAGTTCGTAGTGATTGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AAGTGAAAGAGGAAATGGATTTTCCTCAGTTGATGAAGATGCGCTACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105474 AAGTGAAAGAGGAAATGGATTTTCCTCAGTTGATGAAGATGCGCTACTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAAGTATCAGAGCCACAGGACAT         TGAGTGTTGTGGGGCCCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105524 GAAGTATCAGAGCCACAGGACATGTA...CAGTGAGTGTTGTGGGGCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGAATACTACGACAAAGCCTTTGACCGCATCACCACGAGGAGTGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106603 AGAATACTACGACAAAGCCTTTGACCGCATCACCACGAGGAGTGAGAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CACTGCGGAGCATCAAGCGCATCTTCCACACTGTCACCACCACAGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106653 CACTGCGGAGCATCAAGCGCATCTTCCACACTGTCACCACCACAGACGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCTGTCATCCGCAAG         CTGGCAAAAACTCAGGGGAATGTGTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106703 CCTGTCATCCGCAAGGTG...CAGCTGGCAAAAACTCAGGGGAATGTGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGCCACTGATGCCATCCTGGCCACGCTGATGAGCTGTACCCGCTCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107238 TGCCACTGATGCCATCCTGGCCACGCTGATGAGCTGTACCCGCTCAGTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ATTCCTGGGATATTGTCGTCCAGAGAGTTGGGTCCAAACTCTTCTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107288 ATTCCTGGGATATTGTCGTCCAGAGAGTTGGGTCCAAACTCTTCTTTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAGAGAGACAACTCTGACTTTG         ACCTCCTGACAGTGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 107338 AAGAGAGACAACTCTGACTTTGGTA...CAGACCTCCTGACAGTGAGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GACTGCCAATGAGCCCCCTCAAGATGAAGGTAATTCCTTCAATTCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108710 GACTGCCAATGAGCCCCCTCAAGATGAAGGTAATTCCTTCAATTCACCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCAACCTGGCCATGGAGGCAACCTACATCAACCACAATTTCTCCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108760 GCAACCTGGCCATGGAGGCAACCTACATCAACCACAATTTCTCCCAGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TGCTTGAGAATG         GGGAAGGAAAGATACAACTTCCCCAACCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 108810 TGCTTGAGAATGGTG...CAGGGGAAGGAAAGATACAACTTCCCCAACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AAACCCGTTTGTGGAGGACGACATGGATAAGAATGAAATCGCCTCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109361 AAACCCGTTTGTGGAGGACGACATGGATAAGAATGAAATCGCCTCTGTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CGTACCG         TTACCGCAGGTGGAAGCTTGGAGATGATATTGAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109411 CGTACCGGTA...CAGTTACCGCAGGTGGAAGCTTGGAGATGATATTGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CTTATTGTCCGTTGTGAGCACGATGGCGTCATGACTGGAGCCAACGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109549 CTTATTGTCCGTTGTGAGCACGATGGCGTCATGACTGGAGCCAACGGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AGTGTCCTTCATCAACATCAAGACACTCAATGAGTGGGATTCCAGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 109599 AGTGTCCTTCATCAACATCAAGACACTCAATGAGTGGGATTCCAGGGTG.

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1207      CACTGTAATGGCGTTGACTGGCGTCAGAAGCTGGACTCTCAGCGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109649 ..CAGCACTGTAATGGCGTTGACTGGCGTCAGAAGCTGGACTCTCAGCGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GGGGCTGTCATTGCCACGGAGCTGAAGAACAACAGCTACAAGTTGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113565 GGGGCTGTCATTGCCACGGAGCTGAAGAACAACAGCTACAAGTTGGCCCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GTGGACCTGCTGTGCTTTGCTGGCTGGATCTGAGTACCTCAAGCTTGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 113615 GTGGACCTGCTGTGCTTTGCTGGCTGGATCTGAGTACCTCAAGCTTGGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1350        TTATGTGTCTCGGTACCACGTGAAAGACTCCTCACGCCACGTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113665 G...TAGTTATGTGTCTCGGTACCACGTGAAAGACTCCTCACGCCACGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ATCCTAGGCACCCAGCAGTTCAAGCCTAATGAGTTTGCCAGCCAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114379 ATCCTAGGCACCCAGCAGTTCAAGCCTAATGAGTTTGCCAGCCAGATCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CCTGAGCGTGGAGAATGCCTGGGGCATTTTACGCTGCGTCATTGACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114429 CCTGAGCGTGGAGAATGCCTGGGGCATTTTACGCTGCGTCATTGACATCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GCATGAAGCTGGAGGAGGGCAAATACCTCATCCTCAAGGACCCCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114479 GCATGAAGCTGGAGGAGGGCAAATACCTCATCCTCAAGGACCCCAACAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CAGGTCATCCGTGTCTACAGCCTCCCTGATGGCACCTTCAGCTCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114529 CAGGTCATCCGTGTCTACAGCCTCCCTGATGGCACCTTCAGCTCTGATGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AGATGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114579 AGATGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAG