seq1 = pF1KB5017.tfa, 1014 bp
seq2 = pF1KB5017/gi568815584r_68689536.tfa (gi568815584r:68689536_68892938), 203403 bp

>pF1KB5017 1014
>gi568815584r:68689536_68892938 (Chr14)

(complement)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-1014  (102447-103403)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCACCACCCTCGTGTCTGCCACCATCTTCGACTTGAGCGAAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCACCACCCTCGTGTCTGCCACCATCTTCGACTTGAGCGAAGTTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGCAAG         GGTAACAAGATGCTCAACTATAGTGCTCCCAGTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGCAAGGTA...CAGGGTAACAAGATGCTCAACTATAGTGCTCCCAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGGGGGTTGCCTGCTGGACAGAAAGGCAGTGGGCACCCCTGCTGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102481 CAGGGGGTTGCCTGCTGGACAGAAAGGCAGTGGGCACCCCTGCTGGTGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCTTCCCTCGGAGGCACTCAGTCACCCTGCCCAGCTCCAAGTTCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102531 GGCTTCCCTCGGAGGCACTCAGTCACCCTGCCCAGCTCCAAGTTCCACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAACCAGCTCCTCAGCAGCCTCAAGGGTGAGCCAGCCCCCGCTCTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102581 GAACCAGCTCCTCAGCAGCCTCAAGGGTGAGCCAGCCCCCGCTCTGAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCGAGACAGCCGCTTCCGAGACCGCTCCTTCTCGGAAGGGGGCGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102631 CGCGAGACAGCCGCTTCCGAGACCGCTCCTTCTCGGAAGGGGGCGAGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCTGCCCACCCAGAAGCAGCCCGGGGGCGGCCAGGTCAACTCCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102681 CTGCTGCCCACCCAGAAGCAGCCCGGGGGCGGCCAGGTCAACTCCAGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTACAAGACGGAGCTGTGCCGCCCCTTTGAGGAAAACGGTGCCTGTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102731 CTACAAGACGGAGCTGTGCCGCCCCTTTGAGGAAAACGGTGCCTGTAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACGGGGACAAGTGCCAGTTCGCACACGGCATCCACGAGCTCCGCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102781 ACGGGGACAAGTGCCAGTTCGCACACGGCATCCACGAGCTCCGCAGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACCCGCCACCCCAAGTACAAGACGGAGCTGTGCCGCACCTTCCACACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102831 ACCCGCCACCCCAAGTACAAGACGGAGCTGTGCCGCACCTTCCACACCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGGCTTTTGCCCCTACGGGCCCCGCTGCCACTTCATCCACAACGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102881 CGGCTTTTGCCCCTACGGGCCCCGCTGCCACTTCATCCACAACGCTGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGCGCCGTGCCCTGGCCGGGGCCCGGGACCTCTCCGCTGACCGTCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102931 AGCGCCGTGCCCTGGCCGGGGCCCGGGACCTCTCCGCTGACCGTCCCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTCCAGCATAGCTTTAGCTTTGCTGGGTTTCCCAGTGCCGCTGCCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102981 CTCCAGCATAGCTTTAGCTTTGCTGGGTTTCCCAGTGCCGCTGCCACCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CGCTGCCACCGGGCTGCTGGACAGCCCCACGTCCATCACCCCACCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103031 CGCTGCCACCGGGCTGCTGGACAGCCCCACGTCCATCACCCCACCCCCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTCTGAGCGCCGATGACCTCCTGGGCTCACCTACCCTGCCCGATGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103081 TTCTGAGCGCCGATGACCTCCTGGGCTCACCTACCCTGCCCGATGGCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AATAACCCTTTTGCCTTCTCCAGCCAGGAGCTGGCAAGCCTCTTTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103131 AATAACCCTTTTGCCTTCTCCAGCCAGGAGCTGGCAAGCCTCTTTGCCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TAGCATGGGGCTGCCCGGGGGTGGCTCCCCGACCACCTTCCTCTTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103181 TAGCATGGGGCTGCCCGGGGGTGGCTCCCCGACCACCTTCCTCTTCCGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CCATGTCCGAGTCCCCTCACATGTTTGACTCTCCCCCCAGCCCTCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103231 CCATGTCCGAGTCCCCTCACATGTTTGACTCTCCCCCCAGCCCTCAGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCTCTCTCGGACCAGGAGGGCTACCTGAGCAGCTCCAGCAGCAGCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103281 TCTCTCTCGGACCAGGAGGGCTACCTGAGCAGCTCCAGCAGCAGCCACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGGCTCAGACTCCCCGACCTTGGACAACTCAAGACGCCTGCCCATCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103331 TGGCTCAGACTCCCCGACCTTGGACAACTCAAGACGCCTGCCCATCTTCA

   1000     .    :    .    :
    992 GCAGACTTTCCATCTCAGATGAC
        |||||||||||||||||||||||
 103381 GCAGACTTTCCATCTCAGATGAC