seq1 = pF1KB4992.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KB4992/gi568815596f_26922219.tfa (gi568815596f:26922219_27126345), 204127 bp

>pF1KB4992 843
>gi568815596f:26922219_27126345 (Chr2)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-267  (101114-101259)   99% ->
268-469  (101878-102079)   100% ->
470-624  (103365-103519)   100% ->
625-777  (103662-103814)   100% ->
778-843  (104062-104127)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGTCAATGTGTACTCCACATCTGTGACCAGTGAAAATCTGAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGTCAATGTGTACTCCACATCTGTGACCAGTGAAAATCTGAGTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCATGATATGCTTGCATGGGTCAACGACTCCCTGCACCTCAACTATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCATGATATGCTTGCATGGGTCAACGACTCCCTGCACCTCAACTATACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATAGAACAGCTTTGTTCAG         GGGCAGCCTACTGCCAGTTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 AGATAGAACAGCTTTGTTCAGGTA...CAGGGGCAGCCTACTGCCAGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGACATGCTCTTCCCCGGCTGTGTGCACTTGAGGAAAGTGAAGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101134 ATGGACATGCTCTTCCCCGGCTGTGTGCACTTGAGGAAAGTGAAGTTCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCCAAACTAGAGCATGAATACATCCACAACTTCAAGGTGCTGCAAGCAG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101184 GGCCAAACTAGAGCACGAATACATCCACAACTTCAAGGTGCTGCAAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTTTCAAGAAGATGGGTGTTGACAAA         ATCATTCCTGTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101234 CTTTCAAGAAGATGGGTGTTGACAAAGTA...CAGATCATTCCTGTAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAATTAGTGAAAGGAAAATTCCAAGATAATTTTGAGTTTATTCAGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101893 AAATTAGTGAAAGGAAAATTCCAAGATAATTTTGAGTTTATTCAGTGGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAAGAAATTCTTTGACGCAAACTATGATGGAAAGGATTACAACCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101943 TAAGAAATTCTTTGACGCAAACTATGATGGAAAGGATTACAACCCTCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGCGCGGCAGGGCCAGGACGTAGCGCCACCTCCTAACCCAGGTGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101993 TGGCGCGGCAGGGCCAGGACGTAGCGCCACCTCCTAACCCAGGTGATCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCTTCAACAAATCCAAGAAACTCATTGGCACAGCAG         TTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102043 ATCTTCAACAAATCCAAGAAACTCATTGGCACAGCAGGTA...CAGTTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACAGAGGACGTCCCCCACAGGCCCAAAAAACATGCAGACCTCTGGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103369 ACAGAGGACGTCCCCCACAGGCCCAAAAAACATGCAGACCTCTGGCCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGAGCAATGTGGCCCCCCCCTGCATTCTCCGGAAGAATCCTCCATCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103419 TGAGCAATGTGGCCCCCCCCTGCATTCTCCGGAAGAATCCTCCATCAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGAAATGGCGGCCATGAGACTGATGCCCAAATTCTTGAACTCAACCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103469 CGAAATGGCGGCCATGAGACTGATGCCCAAATTCTTGAACTCAACCAACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 G         CTGGTGGACTTGAAGCTGACAGTGGATGGGCTGGAGAAGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103519 GGTG...CAGCTGGTGGACTTGAAGCTGACAGTGGATGGGCTGGAGAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AACGTGACTTCTACTTCAGCAAACTTCGTGACATCGAGCTCATCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103702 AACGTGACTTCTACTTCAGCAAACTTCGTGACATCGAGCTCATCTGCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAGCATGAAAGTGAAAACAGCCCTGTTATCTCAGGCATCATTGGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103752 GAGCATGAAAGTGAAAACAGCCCTGTTATCTCAGGCATCATTGGCATCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTATGCCACAGAG         GAAGGATTCGCACCCCCTGAGGACGATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103802 CTATGCCACAGAGGTG...CAGGAAGGATTCGCACCCCCTGAGGACGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .
    806 AGATTGAAGAGCATCAACAAGAAGACCAGGACGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104090 AGATTGAAGAGCATCAACAAGAAGACCAGGACGAGTAC