seq1 = pF1KB4920.tfa, 2283 bp
seq2 = pF1KB4920/gi568815581r_16451859.tfa (gi568815581r:16451859_16667731), 215873 bp

>pF1KB4920 2283
>gi568815581r:16451859_16667731 (Chr17)

(complement)

1-403  (100001-100403)   100% ->
404-501  (101110-101207)   100% ->
502-628  (103907-104033)   100% ->
629-715  (104500-104586)   100% ->
716-2283  (114306-115873)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTAGCCTCAAGCAAGAGGATGAACAGTTCTTCACGTTCTCAAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTAGCCTCAAGCAAGAGGATGAACAGTTCTTCACGTTCTCAAATCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTAAGGTGGAAGTCAGACAAGGCTCAGAGTGGACCCTACAATGTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTAAGGTGGAAGTCAGACAAGGCTCAGAGTGGACCCTACAATGTTGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAAATCCTTACTTCAAGATTCTTGCGTGACACTGAGACCTGTCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAAATCCTTACTTCAAGATTCTTGCGTGACACTGAGACCTGTCGACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AATTTTAGGAATTTTCCATACCCAGACCTGGCTGGTCCTCGAAAGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AATTTTAGGAATTTTCCATACCCAGACCTGGCTGGTCCTCGAAAGGCATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGTCAACTCCGAGAGCTCTGCCTTAAGTGGCTGAGACCTGAGATTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGTCAACTCCGAGAGCTCTGCCTTAAGTGGCTGAGACCTGAGATTCACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAAAGGAACAAATTTTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAATTCCTGACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAAAGGAACAAATTTTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAATTCCTGACCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCCTGGTGAGGTTAGGACTTGGGTAAAGTCCCAGTATCCAGAGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCCTGGTGAGGTTAGGACTTGGGTAAAGTCCCAGTATCCAGAGAGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGAGGAAGCAGTGACTCTGGTGGAGGATTTGACTCAGATTCTAGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGAGGAAGCAGTGACTCTGGTGGAGGATTTGACTCAGATTCTAGAAGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAG         CTCCTCAAAACTCTACCCTTTCCCAAGATACCCCAGAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAGGTG...TAGCTCCTCAAAACTCTACCCTTTCCCAAGATACCCCAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAAGACCCCAGAGGAAAACATGCTTTCCAGACAGGATGGCTAAATGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101148 GAAGACCCCAGAGGAAAACATGCTTTCCAGACAGGATGGCTAAATGACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGTGACCAAA         GAATCGATGACATTCAAAGATGTGGCTGTAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101198 GGTGACCAAAGTG...TAGGAATCGATGACATTCAAAGATGTGGCTGTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACATCACCCAGGAGGACTGGGAGTTAATGCGTCCTGTGCAGAAGGAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103938 ACATCACCCAGGAGGACTGGGAGTTAATGCGTCCTGTGCAGAAGGAATTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TACAAGACTGTGACGTTACAGAACTATTGGAACATGGTTTCTCTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103988 TACAAGACTGTGACGTTACAGAACTATTGGAACATGGTTTCTCTGGGTA.

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629      GACTTACAGTGTACAGACCAACTGTGATTCCCATATTGGAAGAAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104038 ..CAGGACTTACAGTGTACAGACCAACTGTGATTCCCATATTGGAAGAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CATGGATGGTGATAAAAGAAATTTTAGAAGGCCCTAGTCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104545 CATGGATGGTGATAAAAGAAATTTTAGAAGGCCCTAGTCCAGGTG...CA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    716  AATGGGAAACTAAAGCCCAAGCATGTACTCCAGTGGAGGATATGTCTAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114305 GAATGGGAAACTAAAGCCCAAGCATGTACTCCAGTGGAGGATATGTCTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ACTCACAAAGGAAGAAACCCATACCATCAAATTAGAAGACTCATATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114355 ACTCACAAAGGAAGAAACCCATACCATCAAATTAGAAGACTCATATGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACGATGATAGACTAGAGAGGCGAGGAAAAGGTGGCTTCTGGAAAATTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114405 ACGATGATAGACTAGAGAGGCGAGGAAAAGGTGGCTTCTGGAAAATTCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACTGATGAAAGAGGTTTCAGTTTGAAGTCAGTCCTTTCACAAGAATATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114455 ACTGATGAAAGAGGTTTCAGTTTGAAGTCAGTCCTTTCACAAGAATATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TCCTACAGAAGAATGTCTTAGTAAATATGATATATATAGAAATAATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114505 TCCTACAGAAGAATGTCTTAGTAAATATGATATATATAGAAATAATTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AAAAGCATTCAAACCTAATTGTACAGTTTGATACCCAATTAGATAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114555 AAAAGCATTCAAACCTAATTGTACAGTTTGATACCCAATTAGATAATAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ACTTCTGTGTATAATGAAGGCAGGGCAACCTTCAATCATGTCTCATATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114605 ACTTCTGTGTATAATGAAGGCAGGGCAACCTTCAATCATGTCTCATATGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 TATTGTACATAGGAAAATACTTCCTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114655 TATTGTACATAGGAAAATACTTCCTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGTAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TGTGTGGGAAAAAATTTAGGAAATACCCATCCCTCCTGAAACACCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114705 TGTGTGGGAAAAAATTTAGGAAATACCCATCCCTCCTGAAACACCAAAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 ACCCATGCCAAAGAGAAATCGTATGAATGTGAAGAATGTGGGAAAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114755 ACCCATGCCAAAGAGAAATCGTATGAATGTGAAGAATGTGGGAAAGAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TAGGCATATCTCATCCCTTATTGCACATCAGAGAATGCACACTGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114805 TAGGCATATCTCATCCCTTATTGCACATCAGAGAATGCACACTGGAGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AACCATATGAATGCCACCAGTGTGGTAAAGCCTTCAGCCAGCGTGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114855 AACCATATGAATGCCACCAGTGTGGTAAAGCCTTCAGCCAGCGTGCACAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CTTACTATACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114905 CTTACTATACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TGACTGTGGGAAAGACTTCAGTCAGCGTGCACACCTTACCATCCATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114955 TGACTGTGGGAAAGACTTCAGTCAGCGTGCACACCTTACCATCCATCAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 GGACACATACTGGAGAGAAACCATATAAATGCTTGGAATGTGGTAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115005 GGACACATACTGGAGAGAAACCATATAAATGCTTGGAATGTGGTAAAACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 TTCAGTCATAGTTCATCACTGATTAATCATCAGAGAGTTCATACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115055 TTCAGTCATAGTTCATCACTGATTAATCATCAGAGAGTTCATACTGGAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 AAAACCTTATATATGCAATGAATGTGGGAAGACTTTCAGTCAGAGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115105 AAAACCTTATATATGCAATGAATGTGGGAAGACTTTCAGTCAGAGTACAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 ACCTTCTTCAGCATCAAAAAATACATACTGGGAAGAAACCATATAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115155 ACCTTCTTCAGCATCAAAAAATACATACTGGGAAGAAACCATATAAATGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 AATGAATGTTGGAAAGTGTTTAGTCAGAGTACTTACCTTATTCGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115205 AATGAATGTTGGAAAGTGTTTAGTCAGAGTACTTACCTTATTCGACATCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 GAGAATTCATTCTGGAGAGAAGTGTTATAAATGTAATGAATGTGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115255 GAGAATTCATTCTGGAGAGAAGTGTTATAAATGTAATGAATGTGGAAAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 CCTTTGCTCATTCCTCAACCCTTATTCAACATCAAACCACTCACACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115305 CCTTTGCTCATTCCTCAACCCTTATTCAACATCAAACCACTCACACTGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 GAGAAATCCTATATATGTAATATATGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115355 GAGAAATCCTATATATGTAATATATGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGAGTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 AAATCTTACTCAACATCATAGAACACATACTGGAGAGAAACCATATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115405 AAATCTTACTCAACATCATAGAACACATACTGGAGAGAAACCATATAAAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 GCAGTGTGTGTGGGAAAGCATTCAGCCAGAGTGTGCACCTTACTCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115455 GCAGTGTGTGTGGGAAAGCATTCAGCCAGAGTGTGCACCTTACTCAACAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 CAGAGGATTCATAATGGAGAAAAACCCTTTAAATGCAATATATGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115505 CAGAGGATTCATAATGGAGAAAAACCCTTTAAATGCAATATATGTGGGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 AGCATATAGACAAGGCGCAAATCTTACTCAGCATCAAAGGATTCATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115555 AGCATATAGACAAGGCGCAAATCTTACTCAGCATCAAAGGATTCATACTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2015 GAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCATTTATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115605 GAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCATTTATTCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2065 TCATCACTTAATCAACATCAGAGAACTCATACTGGAGAGAGACCCTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115655 TCATCACTTAATCAACATCAGAGAACTCATACTGGAGAGAGACCCTATAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2115 ATGTAATGAATGTGATAAGGATTTTAGCCAGAGAACATGCCTTATTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115705 ATGTAATGAATGTGATAAGGATTTTAGCCAGAGAACATGCCTTATTCAAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2165 ACCAGAGAATTCACACAGGAGAGAAACCCTATGCATGTCGTATATGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115755 ACCAGAGAATTCACACAGGAGAGAAACCCTATGCATGTCGTATATGTGGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2215 AAAACCTTCACCCAGAGTACAAACCTTATTCAGCATCAACGTGTTCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115805 AAAACCTTCACCCAGAGTACAAACCTTATTCAGCATCAACGTGTTCATAC

   2300     .    :    .
   2265 AGGTGCCAAACATCGTAAT
        |||||||||||||||||||
 115855 AGGTGCCAAACATCGTAAT