seq1 = pF1KB4917.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KB4917/gi568815587r_691918.tfa (gi568815587r:691918_894904), 202987 bp

>pF1KB4917 969
>gi568815587r:691918_894904 (Chr11)

(complement)

1-20  (99899-99918)   100% ->
21-146  (100004-100129)   100% ->
147-202  (100392-100447)   100% ->
203-293  (101286-101376)   100% ->
294-412  (101917-102035)   100% ->
413-587  (102178-102352)   100% ->
588-742  (102447-102601)   100% ->
743-818  (102688-102763)   100% ->
819-969  (102837-102987)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGATAAGCAGATCAG         CCTGCCAGCCAAGCTCATCAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  99899 ATGGCTGATAAGCAGATCAGGTC...CAGCCTGCCAGCCAAGCTCATCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGGCGGCATCGCCGGGCTGATCGGTGTCACCTGCGTGTTTCCCATCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100025 TGGCGGCATCGCCGGGCTGATCGGTGTCACCTGCGTGTTTCCCATCGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGCCAAGACCAGGCTGCAGAACCAGCAGAACGGCCAGCGCGTGTACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100075 TGGCCAAGACCAGGCTGCAGAACCAGCAGAACGGCCAGCGCGTGTACACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCAT         GTCCGACTGCCTCATCAAGACCGTCCGCTCCGAGGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100125 AGCATGTG...CAGGTCCGACTGCCTCATCAAGACCGTCCGCTCCGAGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTACTTCGGCATGTACCGGG         GAGCTGCTGTGAACTTGACCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100428 CTACTTCGGCATGTACCGGGGTG...CAGGAGCTGCTGTGAACTTGACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCGTCACCCCCGAGAAGGCCATCAAGCTGGCAGCCAACGACTTCTTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101307 TCGTCACCCCCGAGAAGGCCATCAAGCTGGCAGCCAACGACTTCTTCCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CATCAGCTCTCTAAGGACGG         GCAGAAGCTGACCCTGCTTAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101357 CATCAGCTCTCTAAGGACGGGTG...CAGGCAGAAGCTGACCCTGCTTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AGAGATGCTGGCGGGCTGTGGGGCTGGCACCTGCCAGGTGATCGTGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101938 AGAGATGCTGGCGGGCTGTGGGGCTGGCACCTGCCAGGTGATCGTGACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CGCCCATGGAGATGCTGAAGATCCAGCTGCAGGATGCAGGGCGCATTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101988 CGCCCATGGAGATGCTGAAGATCCAGCTGCAGGATGCAGGGCGCATTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    413        CCGCCCAGAGGAAGATCCTGGCTGCCCAGGGCCAGCTCTCGGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102038 G...CAGCCGCCCAGAGGAAGATCCTGGCTGCCCAGGGCCAGCTCTCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CCAGGGGGGTGCCCAGCCCTCAGTGGAGGCTCCAGCTGCCCCTCGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102221 CCAGGGGGGTGCCCAGCCCTCAGTGGAGGCTCCAGCTGCCCCTCGGCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CGGCCACCCAGCTGACCCGCGACCTGCTGCGGAGCCGTGGCATTGCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102271 CGGCCACCCAGCTGACCCGCGACCTGCTGCGGAGCCGTGGCATTGCCGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTCTACAAGGGACTCGGGGCCACGCTGCTCAG         GGATGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102321 CTCTACAAGGGACTCGGGGCCACGCTGCTCAGGTA...CAGGGATGTCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTTCTCTGTGGTGTACTTCCCGCTCTTTGCCAACCTGAACCAGCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102456 CTTCTCTGTGGTGTACTTCCCGCTCTTTGCCAACCTGAACCAGCTGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCCCGGCGTCCGAGGAGAAGTCGCCTTTCTACGTGTCCTTCCTGGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102506 GCCCGGCGTCCGAGGAGAAGTCGCCTTTCTACGTGTCCTTCCTGGCCGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TGTGTGGCTGGGAGTGCCGCCGCTGTGGCCGTCAACCCCTGTGATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 102556 TGTGTGGCTGGGAGTGCCGCCGCTGTGGCCGTCAACCCCTGTGATGGTC.

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    743      TGGTGAAGACGCGGCTCCAGTCACTTCAGCGAGGCGTCAACGAGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102606 ..CAGTGGTGAAGACGCGGCTCCAGTCACTTCAGCGAGGCGTCAACGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACACCTACTCTGGGATCCTGGACTGTGCCAG         GAAGATCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102733 ACACCTACTCTGGGATCCTGGACTGTGCCAGGTG...CAGGAAGATCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CGGCACGAGGGCCCCTCGGCCTTCCTGAAGGGCGCCTACTGCCGCGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102847 CGGCACGAGGGCCCCTCGGCCTTCCTGAAGGGCGCCTACTGCCGCGCGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGTCATCGCGCCCCTTTTCGGCATCGCACAGGTGGTCTACTTCCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102897 GGTCATCGCGCCCCTTTTCGGCATCGCACAGGTGGTCTACTTCCTGGGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCGCGGAGTCCCTGCTGGGGCTGCTGCAGGACCCCCAGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102947 TCGCGGAGTCCCTGCTGGGGCTGCTGCAGGACCCCCAGGCC