seq1 = pF1KB4911.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KB4911/gi568815578f_58211042.tfa (gi568815578f:58211042_58459700), 248659 bp

>pF1KB4911 582
>gi568815578f:58211042_58459700 (Chr20)

1-36  (98936-98971)   100% ->
37-116  (100002-100081)   100% ->
117-198  (132677-132758)   100% ->
199-270  (142232-142303)   100% ->
271-377  (142391-142497)   100% ->
378-487  (143115-143224)   100% ->
488-582  (148565-148659)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTGAGGGAGCTCAAAGTGTGTCTGCTCGGG         GATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  98936 ATGGCGCTGAGGGAGCTCAAAGTGTGTCTGCTCGGGGTG...CAGGATAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGGTGTAGGTAAATCGAGTATTGTGTGGCGGTTTGTGGAAGACAGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100007 AGGTGTAGGTAAATCGAGTATTGTGTGGCGGTTTGTGGAAGACAGTTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCCAAACATCAACCCAACAATAGG         GGCATCTTTTATGACC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100057 ATCCAAACATCAACCCAACAATAGGGTA...TAGGGCATCTTTTATGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAGACTGTCCAGTACCAAAATGAGCTACATAAATTCCTAATCTGGGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132693 AAGACTGTCCAGTACCAAAATGAGCTACATAAATTCCTAATCTGGGATAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGCTGGACAAGAACGA         TTTCGTGCCTTAGCACCAATGTACT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 132743 AGCTGGACAAGAACGAGTA...CAGTTTCGTGCCTTAGCACCAATGTACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATCGAGGGTCGGCTGCAGCTATAATCGTTTATGATATCACAAAAGAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 142257 ATCGAGGGTCGGCTGCAGCTATAATCGTTTATGATATCACAAAAGAAGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    271       GAGACATTTTCAACATTAAAGAATTGGGTGAAAGAGCTTCGACA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142307 ...CAGGAGACATTTTCAACATTAAAGAATTGGGTGAAAGAGCTTCGACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GCATGGCCCACCTAATATTGTAGTTGCCATTGCAGGAAATAAATGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142435 GCATGGCCCACCTAATATTGTAGTTGCCATTGCAGGAAATAAATGTGATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTATCGATGTAAG         AGAAGTCATGGAGAGAGATGCAAAGGAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 142485 TTATCGATGTAAGGTA...CAGAGAAGTCATGGAGAGAGATGCAAAGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TACGCCGACTCTATTCATGCAATTTTTGTAGAGACCAGCGCAAAAAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143143 TACGCCGACTCTATTCATGCAATTTTTGTAGAGACCAGCGCAAAAAACGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GATAAACATAAATGAACTCTTTATAGAAATTA         GTCGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 143193 GATAAACATAAATGAACTCTTTATAGAAATTAGTG...TAGGTCGAAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTCCATCCACTGACGCCAACCTGCCATCTGGCGGTAAGGGCTTCAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148574 TTCCATCCACTGACGCCAACCTGCCATCTGGCGGTAAGGGCTTCAAACTC

    600     .    :    .    :    .    :    .
    547 CGAAGACAGCCTTCAGAGCCAAAGCGGAGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148624 CGAAGACAGCCTTCAGAGCCAAAGCGGAGCTGCTGC