seq1 = pF1KB4905.tfa, 1056 bp
seq2 = pF1KB4905/gi568815584f_24215652.tfa (gi568815584f:24215652_24416707), 201056 bp

>pF1KB4905 1056
>gi568815584f:24215652_24416707 (Chr14)

1-1056  (100001-101056)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACACTACATCTTCTGCAGCACCCCCCTCACTAGGTGTAGAGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACACTACATCTTCTGCAGCACCCCCCTCACTAGGTGTAGAGTTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCCTGCTGGCTATCATCCTGCTGTCAGTGGCGCTGGCTGTGGGGCTTC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTCTGCTGGCTATCATCCTGCTGTCAGTGGCGCTGGCTGTGGGGCTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGCAACAGCTTTGTGGTGTGGAGTATCCTGAAAAGGATGCAGAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGCAACAGCTTTGTGGTGTGGAGTATCCTGAAAAGGATGCAGAAGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGTCACTGCCCTGATGGTGCTGAACCTGGCCCTGGCCGACCTGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGTCACTGCCCTGATGGTGCTGAACCTGGCCCTGGCCGACCTGGCCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTGCTCACTGCTCCCTTTTTCCTTCACTTCCTGGCCCAAGGCACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTGCTCACTGCTCCCTTTTTCCTTCACTTCCTGGCCCAAGGCACCTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTTTTGGACTGGCTGGTTGCCGCCTGTGTCACTATGTCTGCGGAGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTTTTGGACTGGCTGGTTGCCGCCTGTGTCACTATGTCTGCGGAGTCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTACGCCAGCGTCCTGCTTATCACGGCCATGAGTCTAGACCGCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTACGCCAGCGTCCTGCTTATCACGGCCATGAGTCTAGACCGCTCACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCGGTGGCCCGCCCCTTTGTGTCCCAGAAGCTACGCACCAAGGCGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCGGTGGCCCGCCCCTTTGTGTCCCAGAAGCTACGCACCAAGGCGATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCGGCGGGTGCTGGCAGGCATCTGGGTGTTGTCCTTTCTGCTGGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCGGCGGGTGCTGGCAGGCATCTGGGTGTTGTCCTTTCTGCTGGCCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCGTCCTCGCGTACCGCACAGTAGTGCCCTGGAAAACGAACATGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCGTCCTCGCGTACCGCACAGTAGTGCCCTGGAAAACGAACATGAGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTGCTTCCCGCGGTACCCCAGCGAAGGGCACCGGGCCTTCCATCTAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTGCTTCCCGCGGTACCCCAGCGAAGGGCACCGGGCCTTCCATCTAATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCGAGGCTGTCACGGGCTTCCTGCTGCCCTTCCTGGCTGTGGTGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCGAGGCTGTCACGGGCTTCCTGCTGCCCTTCCTGGCTGTGGTGGCCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TACTCGGACATAGGGCGTCGGCTACAGGCCCGGCGCTTCCGCCGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TACTCGGACATAGGGCGTCGGCTACAGGCCCGGCGCTTCCGCCGCAGCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCGCACCGGCCGCCTGGTGGTGCTCATCATCCTGACCTTCGCCGCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCGCACCGGCCGCCTGGTGGTGCTCATCATCCTGACCTTCGCCGCCTTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGCTGCCCTACCACGTGGTGAACCTGGCTGAGGCGGGCCGCGCGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCTGCCCTACCACGTGGTGAACCTGGCTGAGGCGGGCCGCGCGCTGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGCCAGGCCGCCGGGTTAGGGCTCGTGGGGAAGCGGCTGAGCCTGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGCCAGGCCGCCGGGTTAGGGCTCGTGGGGAAGCGGCTGAGCCTGGCCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAACGTGCTCATCGCACTCGCCTTCCTGAGCAGCAGCGTGAACCCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAACGTGCTCATCGCACTCGCCTTCCTGAGCAGCAGCGTGAACCCCGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTACGCGTGCGCCGGCGGCGGCCTGCTGCGCTCGGCGGGCGTGGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTACGCGTGCGCCGGCGGCGGCCTGCTGCGCTCGGCGGGCGTGGGCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTCGCCAAGCTGCTGGAGGGCACGGGCTCCGAGGCGTCCAGCACGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTCGCCAAGCTGCTGGAGGGCACGGGCTCCGAGGCGTCCAGCACGCGCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGGGGGCAGCCTGGGCCAGACCGCTAGGAGCGGCCCCGCCGCTCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CGGGGGCAGCCTGGGCCAGACCGCTAGGAGCGGCCCCGCCGCTCTGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCGGCCCTTCCGAGAGCCTCACTGCCTCCAGCCCTCTCAAGTTAAACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCGGCCCTTCCGAGAGCCTCACTGCCTCCAGCCCTCTCAAGTTAAACGAA

   1050     .
   1051 CTGAAC
        ||||||
 101051 CTGAAC