seq1 = pF1KB4895.tfa, 1347 bp
seq2 = pF1KB4895/gi568815575f_101311989.tfa (gi568815575f:101311989_101513335), 201347 bp

>pF1KB4895 1347
>gi568815575f:101311989_101513335 (ChrX)

1-1347  (100001-101347)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCTGAGCACGGAAGGCAGGGAGGGGTTCGTGGTGAAGGTCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCTGAGCACGGAAGGCAGGGAGGGGTTCGTGGTGAAGGTCAGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTACCCTGGTCCTGCTCAGCCGATGAAGTGATGCGCTTCTTCTCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTACCCTGGTCCTGCTCAGCCGATGAAGTGATGCGCTTCTTCTCTGATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAGATCCAAAATGGCACATCAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAAGATCCAAAATGGCACATCAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCAGACCAAGTGGTGAAGCATTTGTTGAACTTGAATCTGAAGAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCAGACCAAGTGGTGAAGCATTTGTTGAACTTGAATCTGAAGAGGAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAATTGGCTTTGAAGAAGGACAGAGAAACCATGGGACACAGATACGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAATTGGCTTTGAAGAAGGACAGAGAAACCATGGGACACAGATACGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGTATTCAAGTCTAACAGTGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGTATTCAAGTCTAACAGTGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTCCGAATAGCCCTGATACTGCCAACGATGGCTTCGTCCGGCTTAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTCCGAATAGCCCTGATACTGCCAACGATGGCTTCGTCCGGCTTAGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTCCCATTTGGCTGTAGCAAGGAAGAGATTGTTCAGTTCTTTTCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACTCCCATTTGGCTGTAGCAAGGAAGAGATTGTTCAGTTCTTTTCAGGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAAATTGTGCCAAATGGGATGACACTGCCAGTGGACTTTCAGGGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGAAATTGTGCCAAATGGGATGACACTGCCAGTGGACTTTCAGGGGCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCACAGGGGAAGCCTTTGTGCAGTTTGCTTCACAGGAGATAGCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCACAGGGGAAGCCTTTGTGCAGTTTGCTTCACAGGAGATAGCTGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCCTTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGTACATTGAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCCTTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGTACATTGAGATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAAGAGTAGCCGAGCTGAAGTTCGAACCCACTATGATCCCCCTCGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAAGAGTAGCCGAGCTGAAGTTCGAACCCACTATGATCCCCCTCGAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCATGGCTATGCAGCGGCCAGGTCCCTATGATAGGCCGGGGGCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCATGGCTATGCAGCGGCCAGGTCCCTATGATAGGCCGGGGGCTGGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGGGTATAATAGCATTGGCAGAGGAGCTGGGTTTGAAAGGATGAGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGGGTATAATAGCATTGGCAGAGGAGCTGGGTTTGAAAGGATGAGGCGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTGCCTATGGTGGAGGGTATGGAGGCTATGATGACTATGGTGGCTATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTGCCTATGGTGGAGGGTATGGAGGCTATGATGACTATGGTGGCTATAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GATGGATATGGCTTTGGGTCTGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GATGGATATGGCTTTGGGTCTGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTTTCAGGAATGTCTGATCATAGATACGGAGATGGTGGGTCCAGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTTTCAGGAATGTCTGATCATAGATACGGAGATGGTGGGTCCAGTTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGAGCACCACAGGGCACTGTGTACACATGAGGGGGTTACCTTACAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGAGCACCACAGGGCACTGTGTACACATGAGGGGGTTACCTTACAGAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACTGAGAATGATATTTATAATTTCTTCTCACCTCTTAATCCCATGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACTGAGAATGATATTTATAATTTCTTCTCACCTCTTAATCCCATGAGAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACATATTGAAATTGGACCCGATGGCAGAGTTACCGGTGAGGCAGATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACATATTGAAATTGGACCCGATGGCAGAGTTACCGGTGAGGCAGATGTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AATTTGCTACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGGCAAAAGACAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AATTTGCTACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGGCAAAAGACAAAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AATATGCAACACAGATATGTGGAGCTCTTCTTAAATTCTACTGCAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AATATGCAACACAGATATGTGGAGCTCTTCTTAAATTCTACTGCAGGAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AAGTGGGGGTGCTTACGATCACAGCTATGTAGAACTTTTTTTGAATTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AAGTGGGGGTGCTTACGATCACAGCTATGTAGAACTTTTTTTGAATTCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CAGCAGGGGCAAGTGGTGGCGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CAGCAGGGGCAAGTGGTGGCGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGGATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GGCTTATCCAACCAGTCTAGTTATGGAGGTCCTGCTAGCCAGCAGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GGCTTATCCAACCAGTCTAGTTATGGAGGTCCTGCTAGCCAGCAGCTGAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGGTGGTTATGGAGGTGGTTATGGTGGTCAGAGCAGTATGAGTGGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGGTGGTTATGGAGGTGGTTATGGTGGTCAGAGCAGTATGAGTGGATATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1301 ACCAAGTTCTGCAGGAAAACTCCAGTGACTATCAGTCAAACCTTGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACCAAGTTCTGCAGGAAAACTCCAGTGACTATCAGTCAAACCTTGCT