seq1 = pF1KB4878.tfa, 1533 bp
seq2 = pF1KB4878/gi568815576r_17081486.tfa (gi568815576r:17081486_17309677), 228192 bp

>pF1KB4878 1533
>gi568815576r:17081486_17309677 (Chr22)

(complement)

1-322  (100001-100322)   100% ->
323-542  (102388-102607)   100% ->
543-753  (105905-106115)   100% ->
754-881  (117868-117995)   100% ->
882-972  (119646-119736)   100% ->
973-1081  (121231-121339)   100% ->
1082-1239  (126917-127074)   100% ->
1240-1442  (127656-127858)   100% ->
1443-1533  (128102-128192)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGGTGGATGGCCCATCTGAGCGGCCAGCCCTGTGCTTCTTGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGGTGGATGGCCCATCTGAGCGGCCAGCCCTGTGCTTCTTGCTGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGTGGCAATGTCTTTCTTCGGCTCAGCTCTATCCATAGATGAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGTGGCAATGTCTTTCTTCGGCTCAGCTCTATCCATAGATGAAACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGCGCATCTGTTGTTGAAAGAAAAGATGATGCGGCTGGGGGGGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGCGCATCTGTTGTTGAAAGAAAAGATGATGCGGCTGGGGGGGCGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCTGAACACCAAGGAGGAGCTGGCCAATGAGAGGCTCATGACGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCTGAACACCAAGGAGGAGCTGGCCAATGAGAGGCTCATGACGCTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATCGCTGAGATGAAGGAGGCCATGAGGACCCTGATATTCCCACCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AATCGCTGAGATGAAGGAGGCCATGAGGACCCTGATATTCCCACCCAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCACTTTTTCCAGGCCAAGCATCTCATTGAGAGAAGTCAAGTGTTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCACTTTTTCCAGGCCAAGCATCTCATTGAGAGAAGTCAAGTGTTTAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTCTAAGGATGATGCCAAAAG         GGGCTGCCTTGCACCTCCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100301 ATTCTAAGGATGATGCCAAAAGGTA...CAGGGGCTGCCTTGCACCTCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGACATTGGCATCGTGACTATGGACTGGCTGGTGAGGAATGTCACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102407 TGACATTGGCATCGTGACTATGGACTGGCTGGTGAGGAATGTCACCTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGCCTCACTGCCACATCTGTTTCACCCCAAGGGGGATCATGCAGTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102457 GGCCTCACTGCCACATCTGTTTCACCCCAAGGGGGATCATGCAGTTCAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTTGCTCACCCAACTCCCCGTCCATCAGAAAAATGTTCCAAGTGGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102507 TTTGCTCACCCAACTCCCCGTCCATCAGAAAAATGTTCCAAGTGGATTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCTGGAGGATTATCGGAAGCGGGTGCAGAACGTCACTGAGTTTGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102557 GCTGGAGGATTATCGGAAGCGGGTGCAGAACGTCACTGAGTTTGATGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 G         CTTGCTGAGGAATTTCACTCTGGTGACCCAGCACCCGGAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102607 GGTG...CAGCTTGCTGAGGAATTTCACTCTGGTGACCCAGCACCCGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGATTTACACAAACCAAAATGTTGTCTGGTCGAAATTTGAAACCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105945 GTGATTTACACAAACCAAAATGTTGTCTGGTCGAAATTTGAAACCATCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTTCACCATCTCTGGTCTCATCCATTACGCACCAGTGTTCAGAGACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105995 CTTCACCATCTCTGGTCTCATCCATTACGCACCAGTGTTCAGAGACTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCTTCCGGAGCATGCAGGAGTTCTACGAGGACAACGTGCTCTACATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106045 TCTTCCGGAGCATGCAGGAGTTCTACGAGGACAACGTGCTCTACATGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATCAGAGCCAGGCTGCTGCCG         GTGTATGAGCTCAGTGGAGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106095 ATCAGAGCCAGGCTGCTGCCGGTG...CAGGTGTATGAGCTCAGTGGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCACCATGACGAAGAGTGGTCAGTGAAGACTTACCAGGAAGTAGCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117888 GCACCATGACGAAGAGTGGTCAGTGAAGACTTACCAGGAAGTAGCTCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGTTTGTGGAAACTCACCCTGAGTTTATTGGAATCAAAATCATTTATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117938 AGTTTGTGGAAACTCACCCTGAGTTTATTGGAATCAAAATCATTTATTCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GATCACAG         ATCCAAAGATGTGGCTGTCATCGCAGAATCCAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 117988 GATCACAGGTG...CAGATCCAAAGATGTGGCTGTCATCGCAGAATCCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCGAATGGCCATGGGGCTCCGAATCAAGTTCCCCACGGTGGTGGCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119679 CCGAATGGCCATGGGGCTCCGAATCAAGTTCCCCACGGTGGTGGCAGGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TTGACCTG         GTGGGGCATGAGGACACTGGCCACTCCTTGCAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 119729 TTGACCTGGTA...CAGGTGGGGCATGAGGACACTGGCCACTCCTTGCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GACTACAAGGAAGCTCTGATGATCCCCGCCAAGGATGGCGTTAAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121264 GACTACAAGGAAGCTCTGATGATCCCCGCCAAGGATGGCGTTAAGCTGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TTACTTCTTCCACGCCGGAGAAACAG         ACTGGCAGGGTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 121314 TTACTTCTTCCACGCCGGAGAAACAGGTG...CAGACTGGCAGGGTACTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCATAGACAGGAACATTCTGGATGCTCTGATGCTGAACACTACCAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126932 CCATAGACAGGAACATTCTGGATGCTCTGATGCTGAACACTACCAGAATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GGCCATGGATTTGCTTTGAGCAAACACCCCGCAGTCAGGACTTACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126982 GGCCATGGATTTGCTTTGAGCAAACACCCCGCAGTCAGGACTTACTCCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GAAAAAGGACATCCCCATAGAAGTCTGTCCCATCTCTAACCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 127032 GAAAAAGGACATCCCCATAGAAGTCTGTCCCATCTCTAACCAGGTA...C

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1240   GTGCTGAAACTGGTGTCTGACTTGAGGAACCACCCTGTAGCCACTCTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127654 AGGTGCTGAAACTGGTGTCTGACTTGAGGAACCACCCTGTAGCCACTCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ATGGCCACTGGGCACCCCATGGTGATCAGCTCTGATGACCCAGCTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127704 ATGGCCACTGGGCACCCCATGGTGATCAGCTCTGATGACCCAGCTATGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGGTGCCAAAGGCTTGTCCTATGATTTCTATGAGGTCTTCATGGGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127754 TGGTGCCAAAGGCTTGTCCTATGATTTCTATGAGGTCTTCATGGGCATTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 GGGGGATGAAGGCTGACCTGAGGACCCTCAAACAGCTGGCCATGAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127804 GGGGGATGAAGGCTGACCTGAGGACCCTCAAACAGCTGGCCATGAACTCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 ATCAA         GTACAGTACCCTGTTGGAGAGTGAGAAAAATACTTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127854 ATCAAGTG...CAGGTACAGTACCCTGTTGGAGAGTGAGAAAAATACTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CATGGAAATCTGGAAGAAGAGATGGGATAAGTTCATAGCAGATGTGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128138 CATGGAAATCTGGAAGAAGAGATGGGATAAGTTCATAGCAGATGTGGCTA

   1600     .
   1529 CAAAG
        |||||
 128188 CAAAG