Result of SIM4 for
pF1KB4875
seq1 = pF1KB4875.tfa, 3126 bp
seq2 = pF1KB4875/gi568815587f_65540922.tfa (gi568815587f:65540922_65750712), 209791 bp
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0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCCATGTGGGCCGGCGGTGTGGGGAGCCCTCGGCGGGGCATGGCCCC
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100001 ATGCCCATGTGGGCCGGCGGTGTGGGGAGCCCTCGGCGGGGCATGGCCCC
50 . : . : . : . : . :
51 TGCGTCCACAGATGACCTCTTTGCCCGCAAGCTGCGCCAGCCAGCAAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TGCGTCCACAGATGACCTCTTTGCCCGCAAGCTGCGCCAGCCAGCAAGGC
100 . : . : . : . : . :
101 CCCCGCTGACACCGCACACCTTCGAGCCGAGGCCAGTCCGGGGCCCACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CCCCGCTGACACCGCACACCTTCGAGCCGAGGCCAGTCCGGGGCCCACTC
150 . : . : . : . : . :
151 CTGCGCAGCGGCAGCGATGCAGGCGAGGCCAGGCCCCCCACGCCAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CTGCGCAGCGGCAGCGATGCAGGCGAGGCCAGGCCCCCCACGCCAGCCAG
200 . : . : . : . : . :
201 CCCCCGTGCCCGTGCCCACAGCCACGAAGAGGCCAGCCGACCTGCAGCCA
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100201 CCCCCGTGCCCGTGCCCACAGCCACGAAGAGGCCAGCCGACCTGCAGCCA
250 . : . : . : . : . :
251 CTTCCACCCGGCTCTTCACTGACCCGCTGGCACTGCTGGGGCTGCCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 CTTCCACCCGGCTCTTCACTGACCCGCTGGCACTGCTGGGGCTGCCAGCA
300 . : . : . : . : . :
301 GAGGAACCAGAGCCTGCCTTCCCACCAGTGCTTGAGCCTCGATGGTTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 GAGGAACCAGAGCCTGCCTTCCCACCAGTGCTTGAGCCTCGATGGTTTGC
350 . : . : . : . : . :
351 CCACTATGACGTGCAAAGCCTGCTCTTTGATTGGGCTCCGAGGTCTCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 CCACTATGACGTGCAAAGCCTGCTCTTTGATTGGGCTCCGAGGTCTCAGG
400 . : . : . : . : . :
401 GGATGGGGAGCCACTCAGAGGCCAGCTCTGGGACCCTGGCTTCAGCCGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 GGATGGGGAGCCACTCAGAGGCCAGCTCTGGGACCCTGGCTTCAGCCGAG
450 . : . : . : . : . :
451 GACCAGGCTGCCAGCTCGGACCTGCTGCATGGGGCACCTGGCTTTGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 GACCAGGCTGCCAGCTCGGACCTGCTGCATGGGGCACCTGGCTTTGTGTG
500 . : . : . : . : . :
501 TGAGCTCGGGGGTGAGGGTGAGCTAGGCCTGGGTGGACCAGCATCCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 TGAGCTCGGGGGTGAGGGTGAGCTAGGCCTGGGTGGACCAGCATCCCCAC
550 . : . : . : . : . :
551 CTGTGCCCCCTGCACTGCCCAACGCGGCCGTGTCCATCCTGGAGGAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 CTGTGCCCCCTGCACTGCCCAACGCGGCCGTGTCCATCCTGGAGGAGCCA
600 . : . : . : . : . :
601 CAGAACCGAACCTCGGCCTACAGCCTGGAGCACGCAGACCTGGGTGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 CAGAACCGAACCTCGGCCTACAGCCTGGAGCACGCAGACCTGGGTGCTGG
650 . : . : . : . : . :
651 CTACTACCGCAAATACTTCTATGGCAAAG AACATCAGAACT
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
100651 CTACTACCGCAAATACTTCTATGGCAAAGGTG...CAGAACATCAGAACT
700 . : . : . : . : . :
692 TCTTCGGGATGGACGAGTCGCTGGGCCCGGTGGCAGTGAGCCTGCGGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101341 TCTTCGGGATGGACGAGTCGCTGGGCCCGGTGGCAGTGAGCCTGCGGCGG
750 . : . : . : . : . :
742 GAGGAGAAGGAGGGCAGCGGAGGGGGCACCCTGCACAGCTACCGCGTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101391 GAGGAGAAGGAGGGCAGCGGAGGGGGCACCCTGCACAGCTACCGCGTCAT
800 . : . : . : . : . :
792 CGTGCGGACCACGCAG CTCCGGACACTCCGTGGCACCATCT
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
101441 CGTGCGGACCACGCAGGTG...CAGCTCCGGACACTCCGTGGCACCATCT
850 . : . : . : . : . :
833 CGGAGGACGCGCTGCCGCCGGGGCCCCCACGGGGTCTGTCCCCAAGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101567 CGGAGGACGCGCTGCCGCCGGGGCCCCCACGGGGTCTGTCCCCAAGGAAA
900 . : . : . : . : . :
883 CTTCTGGAGCACGTGGCGCCGCAGCTGAGCCCCAGCTGCCTGCGCCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101617 CTTCTGGAGCACGTGGCGCCGCAGCTGAGCCCCAGCTGCCTGCGCCTGGG
950 . : . : . : . : . :
933 CTCAGCTTCACCCAAGGTACCACGGACGCTGCTCACACTGGATGAGCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101667 CTCAGCTTCACCCAAGGTACCACGGACGCTGCTCACACTGGATGAGCAAG
1000 . : . : . : . : . :
983 TG CTGAGCTTCCAACGCAAGGTGGGCATCCTGTACTGCCGG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101717 TGGTG...CAGCTGAGCTTCCAACGCAAGGTGGGCATCCTGTACTGCCGG
1050 . : . : . : . : . :
1024 GCGGGCCAGGGCTCGGAGGAGGAGATGTACAACAACCAGGAGGCGGGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104073 GCGGGCCAGGGCTCGGAGGAGGAGATGTACAACAACCAGGAGGCGGGACC
1100 . : . : . : . : . :
1074 GGCCTTCATGCAGTTTCTCACCTTGCTGGGCGATGTGGTGCGGCTCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104123 GGCCTTCATGCAGTTTCTCACCTTGCTGGGCGATGTGGTGCGGCTCAAAG
1150 . : . : . : . : . :
1124 GCTTTGAGAGTTACCGGGCCCAGCTAGACACCAAAA CGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
104173 GCTTTGAGAGTTACCGGGCCCAGCTAGACACCAAAAGTG...CAGCGGAT
1200 . : . : . : . : . :
1165 TCCACAGGCACGCACTCCCTCTACACCACATACCAGGACCACGAGATCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104938 TCCACAGGCACGCACTCCCTCTACACCACATACCAGGACCACGAGATCAT
1250 . : . : . : . : . :
1215 GTTCCACGTGTCCACGATGCTGCCTTACACCCCTAATAACCAGCAGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
104988 GTTCCACGTGTCCACGATGCTGCCTTACACCCCTAATAACCAGCAGCAGG
1300 . : . : . : . : . :
1264 CTCCTCCGGAAGCGCCACATTGGCAACGACATTGTGACCATC
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105038 TG...TAGCTCCTCCGGAAGCGCCACATTGGCAACGACATTGTGACCATC
1350 . : . : . : . : . :
1306 GTGTTCCAGGAGCCTGGCAGCAAGCCCTTCTGCCCCACCACCATCCGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105342 GTGTTCCAGGAGCCTGGCAGCAAGCCCTTCTGCCCCACCACCATCCGCTC
1400 . : . : . : . : . :
1356 GCACTTCCAGCACGTGTTCCTAGTGGTGCGGGCACACACACCCTGCACGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105392 GCACTTCCAGCACGTGTTCCTAGTGGTGCGGGCACACACACCCTGCACGC
1450 . : . : . : . : . :
1406 CACACACCACCTACAG GGTGGCCGTGAGCCGCACCCAGGAC
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105442 CACACACCACCTACAGGTG...CAGGGTGGCCGTGAGCCGCACCCAGGAC
1500 . : . : . : . : . :
1447 ACCCCTGCCTTCGGGCCAGCTCTGCCTGCTGGCGGAGGCCCCTTCGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105560 ACCCCTGCCTTCGGGCCAGCTCTGCCTGCTGGCGGAGGCCCCTTCGCAGC
1550 . : . : . : . : . :
1497 CAACGCCGACTTCCGGGCCTTCCTGCTGGCCAAAGCGCTGAATGGTGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105610 CAACGCCGACTTCCGGGCCTTCCTGCTGGCCAAAGCGCTGAATGGTGAGC
1600 . : . : . : . : . :
1547 AGGCGGCCGGCCACGCGCGCCAGTTCCACGCCATGGCCACGCGCACCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105660 AGGCGGCCGGCCACGCGCGCCAGTTCCACGCCATGGCCACGCGCACCCGC
1650 . : . : . : . : . :
1597 CAGCAGTACCTGCAAGACCTGGCCACCAACGAGGTGACCACTACGTCGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105710 CAGCAGTACCTGCAAGACCTGGCCACCAACGAGGTGACCACTACGTCGCT
1700 . : . : . : . : . :
1647 GGACTCGGCTTCACGCTTCGGCCTGCCCTCCCTGGGTGGGAGGCGCCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105760 GGACTCGGCTTCACGCTTCGGCCTGCCCTCCCTGGGTGGGAGGCGCCGGG
1750 . : . : . : . : . :
1697 CGGCCCCTCGGGGCCCAGGCGCCGAGCTGCAGGCAGCGGGCTCACTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105810 CGGCCCCTCGGGGCCCAGGCGCCGAGCTGCAGGCAGCGGGCTCACTGGTG
1800 . : . : . : . : . :
1747 TGGGGAGTGCGCGCGGCGCCCGGGGCGCGGGTCGCCGCCGGGGCTCAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105860 TGGGGAGTGCGCGCGGCGCCCGGGGCGCGGGTCGCCGCCGGGGCTCAGGC
1850 . : . : . : . : . :
1797 GAGCGGCCCCGAAGGCATCGAGGTGCCCTGCCTGCTGGGCATCTCGGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105910 GAGCGGCCCCGAAGGCATCGAGGTGCCCTGCCTGCTGGGCATCTCGGCCG
1900 . : . : . : . : . :
1847 AGGCTCTGGTGCTGGTGGCGCCGCGCGACGGCCGCGTAGTGTTCAATTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105960 AGGCTCTGGTGCTGGTGGCGCCGCGCGACGGCCGCGTAGTGTTCAATTGC
1950 . : . : . : . : . :
1897 GCCTGTCGCGACGTGCTGGCCTGGACCTTCTCCGAGCAGCAGCTGGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106010 GCCTGTCGCGACGTGCTGGCCTGGACCTTCTCCGAGCAGCAGCTGGACCT
2000 . : . : . : . : . :
1947 GTACCACGGCCGCGGGGAGGCGATCACGCTGCGCTTCGACGGGTCCCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106060 GTACCACGGCCGCGGGGAGGCGATCACGCTGCGCTTCGACGGGTCCCCCG
2050 . : . : . : . : . :
1997 GCCAAGCCGTGGGCGAGGTGGTGGCGCGCCTGCAG CTGGTG
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106110 GCCAAGCCGTGGGCGAGGTGGTGGCGCGCCTGCAGGTG...CAGCTGGTG
2100 . : . : . : . : . :
2038 AGCCGTGGCTGCGAGACCCGCGAGCTGGCGCTGCCCCGCGACGGTCAAGG
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106469 AGCCGTGGCTGCGAGACCCGCGAGCTGGCGCTGCCCCGCGACGGTCAAGG
2150 . : . : . : . : . :
2088 CCGCCTGGGCTTCGAGGTGGACGCCGAGGGATTCGTCACGCACGTGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106519 CCGCCTGGGCTTCGAGGTGGACGCCGAGGGATTCGTCACGCACGTGGAGC
2200 . : . : . : . : . :
2138 GCTTCACATTCGCCGAGACGGCGGGGCTGCGGCCCGGGGCGCGCCTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106569 GCTTCACATTCGCCGAGACGGCGGGGCTGCGGCCCGGGGCGCGCCTCCTG
2250 . : . : . : . : . :
2188 CGCGTGTGCGGCCAGACGCTGCCCAGCCTCCGGCCCGAGGCCGCTGCCCA
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
106619 CGCGTGTGCGGCCAGACTCTGCCCAGCCTCCGGCCCGAGGCCGCTGCCCA
2300 . : . : . : . : . :
2238 GCTCCTGCGCTCGGCGCCCAAGGTCTGCGTCACCGTCCTGCCCCCCGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106669 GCTCCTGCGCTCGGCGCCCAAGGTCTGCGTCACCGTCCTGCCCCCCGACG
2350 . : . : . : . : . :
2288 AGAGCGGCCGGCCCCGCAG GAGTTTTTCGGAGCTGTACACG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
106719 AGAGCGGCCGGCCCCGCAGGTC...CAGGAGTTTTTCGGAGCTGTACACG
2400 . : . : . : . : . :
2329 CTGTCGCTGCAGGAGCCTAGCCGGCGGGGGGCCCCAGATCCTGTGCAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108363 CTGTCGCTGCAGGAGCCTAGCCGGCGGGGGGCCCCAGATCCTGTGCAGGA
2450 . : . : . : . : . :
2379 TGAGGTCCAGGGGGTGACCCTGCTGCCCACCACAAAGCAGCTGCTGCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108413 TGAGGTCCAGGGGGTGACCCTGCTGCCCACCACAAAGCAGCTGCTGCACC
2500 . : . : . : . : . :
2429 TGTGCCTGCAAGATGGTGGCAGTCCTCCAGGGCCTGGGGATCTGGCCGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108463 TGTGCCTGCAAGATGGTGGCAGTCCTCCAGGGCCTGGGGATCTGGCCGAG
2550 . : . : . : . : . :
2479 GAGAGGACTGAGTTCCTGCACAGCCAGAACTCGCTGTCACCACGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
108513 GAGAGGACTGAGTTCCTGCACAGCCAGAACTCGCTGTCACCACGCAGGTG
2600 . : . : . : . : . :
2526 CTCTCTGTCGGATGAGGCCCCAGTCCTGCCCAACACCACCCCGG
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108563 ...CAGCTCTCTGTCGGATGAGGCCCCAGTCCTGCCCAACACCACCCCGG
2650 . : . : . : . : . :
2570 ACCTCCTCCTGGCCACCACAGCCAAGCCATCAGTACCCAGTGCTGACAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108684 ACCTCCTCCTGGCCACCACAGCCAAGCCATCAGTACCCAGTGCTGACAGT
2700 . : . : . : . : . :
2620 GAGACACCCCTGACCCAG GACAGGCCAGGCAGTCCCAGTGG
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
108734 GAGACACCCCTGACCCAGGTG...CAGGACAGGCCAGGCAGTCCCAGTGG
2750 . : . : . : . : . :
2661 CTCTGAGGACAAGGGCAACCCGGCGCCGGAGCTGAGGGCCTCCTTTCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108859 CTCTGAGGACAAGGGCAACCCGGCGCCGGAGCTGAGGGCCTCCTTTCTGC
2800 . : . : . : . : . :
2711 CACGTACCTTGTCTCTGCGGAACTCCATCAGCAGGA TCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
108909 CACGTACCTTGTCTCTGCGGAACTCCATCAGCAGGAGTG...CAGTCATG
2850 . : . : . : . : . :
2752 TCGGAGGCGGGCAGTGGGACCCTGGAGGACGAGTGGCAGGCCATCTCGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109034 TCGGAGGCGGGCAGTGGGACCCTGGAGGACGAGTGGCAGGCCATCTCGGA
2900 . : . : . : . : . :
2802 GATTGCCTCTACTTGCAACACCATTCTGGAGTCGCTGTCCCGAGAGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
109084 GATTGCCTCTACTTGCAACACCATTCTGGAGTCGCTGTCCCGAGAGGGTG
2950 . : . : . : . : . :
2849 GACAGCCCATCCCAGAGAGTGGAGACCCTAAGGGAACTCCAAAA
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109134 ...CAGGACAGCCCATCCCAGAGAGTGGAGACCCTAAGGGAACTCCAAAA
3000 . : . : . : . : . :
2893 TCTGATGCTGA GCCAGAGCCTGGGAACCTCTCAGAGAAGGT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
109261 TCTGATGCTGAGTA...CAGGCCAGAGCCTGGGAACCTCTCAGAGAAGGT
3050 . : . : . : . : . :
2934 CTCTCACTTGGAGTCCATGCTCAGGAAGCTGCAGGAGGACCTGCAGAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
109510 CTCTCACTTGGAGTCCATGCTCAGGAAGCTGCAGGAGGACCTGCAGAAGG
3100 . : . : . : . : . :
2983 GAGAAGGCGGACAGGGCGGCCCTGGAGGAGGAGGTGCGGAGC
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109560 TG...CAGGAGAAGGCGGACAGGGCGGCCCTGGAGGAGGAGGTGCGGAGC
3150 . : . : . : . : . :
3025 CTGAGACACAACAACCGGCGGCTGCAGGCGGAGTCTGAGAGTGCAGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109690 CTGAGACACAACAACCGGCGGCTGCAGGCGGAGTCTGAGAGTGCAGCCAC
3200 . : . : . : . : . :
3075 ACGCCTCCTCCTGGCCTCCAAGCAGCTGGGCTCACCCACCGCCGACCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109740 ACGCCTCCTCCTGGCCTCCAAGCAGCTGGGCTCACCCACCGCCGACCTGG
3250
3125 CC
||
109790 CC