seq1 = pF1KB4865.tfa, 2769 bp
seq2 = pF1KB4865/gi568815588r_33080079.tfa (gi568815588r:33080079_33434382), 354304 bp

>pF1KB4865 2769
>gi568815588r:33080079_33434382 (Chr10)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-248  (103501-103675)   100% ->
249-430  (163527-163708)   100% ->
431-658  (170510-170737)   99% ->
659-814  (177912-178067)   100% ->
815-981  (180189-180355)   100% ->
982-1137  (208094-208249)   100% ->
1138-1282  (212520-212664)   100% ->
1283-1614  (220666-220997)   100% ->
1615-1759  (226667-226811)   100% ->
1760-1864  (231388-231492)   100% ->
1865-1924  (236674-236733)   100% ->
1925-2062  (241965-242102)   100% ->
2063-2334  (247895-248166)   100% ->
2335-2431  (248659-248755)   100% ->
2432-2482  (251635-251685)   100% ->
2483-2769  (254018-254304)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACG         ATAAATGTGGCGATACTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGGTA...CAGATAAATGTGGCGATACTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103519 TAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATCACCCAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103569 TATCACCCAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCACTTCGATTTGGAGGACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103619 CCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCACTTCGATTTGGAGGACAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTGCAA         GTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103669 ACTGCAAGTA...TAGGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAAATGGACATTTTAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163561 GAAAATGGACATTTTAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTGTCTCTGACTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163611 TGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTGTCTCTGACTACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 163661 AAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    431        GTCCTGAATGTTCCCAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163711 G...TAGGTCCTGAATGTTCCCAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170553 AAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATGCACTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATATTGTCTTTGCACCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGC
        ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170603 ATATTGTCTTTGTGCCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTTGACCTGGAGCCTGACTCAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170653 TTTGACCTGGAGCCTGACTCAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATG         TTGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 170703 CGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGGTA...CAGTTGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTCACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177918 CTCACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTTTTACACCGACAGCGCGATAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177968 TCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTTTTACACCGACAGCGCGATAGCAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178018 AGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815          ATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178068 GTC...CAGATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAGTATAGCACCAACTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180230 ATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAGTATAGCACCAACTGGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180280 TGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGGATTCCTACCGAGAGTGGATACAG         GTAGACTTGGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 180330 AGGATTCCTACCGAGAGTGGATACAGGTA...CAGGTAGACTTGGGCCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTTCAAAAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208109 CTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTTCAAAAGAAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208159 CAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GGGAAGACTGGATCACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 208209 GGGAAGACTGGATCACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTTGTA...CAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212520 CTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATTCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212570 CAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CTGGCATATCTATGAGATTTGAAGTATACGGTTGCAAGATAACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 212620 CTGGCATATCTATGAGATTTGAAGTATACGGTTGCAAGATAACAGGTA..

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283     ATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212670 .CAGATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGACTCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220712 TGACTCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTCTGGCTGGGCACTTCCACCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220762 AAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTCTGGCTGGGCACTTCCACCCGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220812 CCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GATCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220862 GATCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 TGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGGTACAGCAACAACGGCTCGGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220912 TGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGGTACAGCAACAACGGCTCGGACTGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 AAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAG         TCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 220962 AAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAGGTG...CAGTCTTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 TGAGGGCAACAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226672 TGAGGGCAACAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGAGAGCCACTCATGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226722 TCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGAGAGCCACTCATGGCGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 CTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGAAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 226772 CTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGAAGGTA...CAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CCCTACAGCTGGACCGACCACTCCCAACGGGAACTTGGTGGATGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231389 CCCTACAGCTGGACCGACCACTCCCAACGGGAACTTGGTGGATGAATGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 ATGACGACCAGGCCAACTGCCACAGTGGAACAGGTGATGACTTCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231439 ATGACGACCAGGCCAACTGCCACAGTGGAACAGGTGATGACTTCCAGCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 ACAG         GTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231489 ACAGGTG...CAGGTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CATAGACAGCACCATACAATCAG         AGTTTCCAACATATGGTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 236711 CATAGACAGCACCATACAATCAGGTA...AAGAGTTTCCAACATATGGTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TTAACTGTGAATTTGGCTGGGGCTCTCACAAGACCTTCTGCCACTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241983 TTAACTGTGAATTTGGCTGGGGCTCTCACAAGACCTTCTGCCACTGGGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 CATGACAATCACGTGCAGCTCAAGTGGAGTGTGTTGACCAGCAAGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242033 CATGACAATCACGTGCAGCTCAAGTGGAGTGTGTTGACCAGCAAGACGGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 ACCCATTCAGGATCACACAG         GAGATGGCAACTTCATCTATT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 242083 ACCCATTCAGGATCACACAGGTA...CAGGAGATGGCAACTTCATCTATT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 CCCAAGCTGACGAAAATCAGAAGGGCAAAGTGGCTCGCCTGGTGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247916 CCCAAGCTGACGAAAATCAGAAGGGCAAAGTGGCTCGCCTGGTGAGCCCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GTGGTTTATTCCCAGAACTCTGCCCACTGCATGACCTTCTGGTATCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247966 GTGGTTTATTCCCAGAACTCTGCCCACTGCATGACCTTCTGGTATCACAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 GTCTGGGTCCCACGTCGGCACACTCAGGGTCAAACTGCGCTACCAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248016 GTCTGGGTCCCACGTCGGCACACTCAGGGTCAAACTGCGCTACCAGAAGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 CAGAGGAGTACGATCAGCTGGTCTGGATGGCCATTGGACACCAAGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248066 CAGAGGAGTACGATCAGCTGGTCTGGATGGCCATTGGACACCAAGGTGAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 CACTGGAAGGAAGGGCGTGTCTTGCTCCACAAGTCTCTGAAACTTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248116 CACTGGAAGGAAGGGCGTGTCTTGCTCCACAAGTCTCTGAAACTTTATCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 G         GTGATTTTCGAGGGCGAAATCGGAAAAGGAAACCTTGGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248166 GGTA...TAGGTGATTTTCGAGGGCGAAATCGGAAAAGGAAACCTTGGTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 GGATTGCTGTGGATGACATTAGTATTAATAACCACATTTCACAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248699 GGATTGCTGTGGATGACATTAGTATTAATAACCACATTTCACAAGAAGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 TGTGCAA         AACCAGCAGACCTGGATAAAAAGAACCCAGAAAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248749 TGTGCAAGTA...CAGAACCAGCAGACCTGGATAAAAAGAACCCAGAAAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 TAAAATTGATGAAACAG         GGAGCACGCCAGGATACGAAGGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 251669 TAAAATTGATGAAACAGGTA...TAGGGAGCACGCCAGGATACGAAGGTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 AAGGAGAAGGTGACAAGAACATCTCCAGGAAGCCAGGCAATGTGTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254042 AAGGAGAAGGTGACAAGAACATCTCCAGGAAGCCAGGCAATGTGTTGAAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 ACCTTAGACCCCATCCTCATCACCATCATAGCCATGAGTGCCCTGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254092 ACCTTAGACCCCATCCTCATCACCATCATAGCCATGAGTGCCCTGGGGGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 CCTCCTGGGGGCTGTCTGTGGGGTCGTGCTGTACTGTGCCTGTTGGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254142 CCTCCTGGGGGCTGTCTGTGGGGTCGTGCTGTACTGTGCCTGTTGGCATA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 ATGGGATGTCAGAAAGAAACTTGTCTGCCCTGGAGAACTATAACTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254192 ATGGGATGTCAGAAAGAAACTTGTCTGCCCTGGAGAACTATAACTTTGAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 CTTGTGGATGGTGTGAAGTTGAAAAAAGACAAACTGAATACACAGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254242 CTTGTGGATGGTGTGAAGTTGAAAAAAGACAAACTGAATACACAGAGTAC

   2900     .    :
   2757 TTATTCGGAGGCA
        |||||||||||||
 254292 TTATTCGGAGGCA