seq1 = pF1KB4862.tfa, 1455 bp
seq2 = pF1KB4862/gi568815587r_128362364.tfa (gi568815587r:128362364_128673130), 310767 bp

>pF1KB4862 1455
>gi568815587r:128362364_128673130 (Chr11)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-214  (116696-116840)   100% ->
215-334  (182555-182674)   100% ->
335-535  (183641-183841)   100% ->
536-613  (186985-187062)   100% ->
614-862  (188060-188308)   100% ->
863-1123  (192680-192940)   100% ->
1124-1242  (209504-209622)   99% ->
1243-1455  (210555-210767)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTACTTTGTGGATTCTGCTGGGAGCAGCCCCGTCCCTTACTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTACTTTGTGGATTCTGCTGGGAGCAGCCCCGTCCCTTACTCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTCGTCCTGCAGTGGTG         AGGCAAGGACCTAGCAACACTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 GCCTCGTCCTGCAGTGGTGGTG...CAGAGGCAAGGACCTAGCAACACTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGAAGATCCTCGAATGAACTGTGGTTTCCAGTCCAATTATCACCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116718 ATGAAGATCCTCGAATGAACTGTGGTTTCCAGTCCAATTATCACCAGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGACCTTGCTACCCCTTTTGGGATGAGATGGCAACTCAGGAAGTTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116768 AGACCTTGCTACCCCTTTTGGGATGAGATGGCAACTCAGGAAGTTCCTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGTCTTGAACACTGTGTCTCAG         ATATGGAATGTGCAGATG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 116818 TGGTCTTGAACACTGTGTCTCAGGTA...CAGATATGGAATGTGCAGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCCACTATTAACTCCAAGCAGCAAAGAAATGATGTCTCAAGCATTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182573 TCCCACTATTAACTCCAAGCAGCAAAGAAATGATGTCTCAAGCATTAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTACTTTCAGTGGTTTCACTAAAGAACAGCAACGACTGGGGATCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182623 GCTACTTTCAGTGGTTTCACTAAAGAACAGCAACGACTGGGGATCCCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AG         ACCCCCGGCAGTGGACAGAAACCCATGTTCGGGACTGGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182673 AGGTA...CAGACCCCCGGCAGTGGACAGAAACCCATGTTCGGGACTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGATGTGGGCTGTGAATGAATTCAGCCTGAAAGGTGTAGACTTCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183680 TGATGTGGGCTGTGAATGAATTCAGCCTGAAAGGTGTAGACTTCCAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCTGTATGAATGGAGCAGCCCTCTGCGCCCTGGGTAAAGACTGCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183730 TTCTGTATGAATGGAGCAGCCCTCTGCGCCCTGGGTAAAGACTGCTTTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGAGCTGGCCCCAGACTTTGTTGGGGACATCTTATGGGAACATCTAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183780 CGAGCTGGCCCCAGACTTTGTTGGGGACATCTTATGGGAACATCTAGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCTGCAGAAAG         AGGATGTGAAACCATATCAAGTTAATGGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 183830 TCCTGCAGAAAGGTA...CAGAGGATGTGAAACCATATCAAGTTAATGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTCAACCCAGCCTATCCAGAATCCCGCTATACCTCGGATTACTTCATTA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 187014 GTCAACCCAGCCTATCCAGAATCCCGCTATACCTCGGATTACTTCATTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    614         GCTATGGTATTGAGCATGCCCAGTGTGTTCCACCATCGGAGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187064 TA...CAGGCTATGGTATTGAGCATGCCCAGTGTGTTCCACCATCGGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCTCAGAGCCCAGCTTCATCACAGAGTCCTATCAGACGCTCCATCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188102 TCTCAGAGCCCAGCTTCATCACAGAGTCCTATCAGACGCTCCATCCCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGCTCGGAAGAGCTCCTCTCCCTCAAGTATGAGAATGACTACCCCTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188152 AGCTCGGAAGAGCTCCTCTCCCTCAAGTATGAGAATGACTACCCCTCGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATTCTCCGAGACCCTCTCCAGACAGACACCTTGCAGAATGACTACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188202 CATTCTCCGAGACCCTCTCCAGACAGACACCTTGCAGAATGACTACTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTATCAAACAAGAAGTCGTCACCCCAGACAACATGTGCATGGGGAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188252 CTATCAAACAAGAAGTCGTCACCCCAGACAACATGTGCATGGGGAGGACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGTCGTG         GTAAACTCGGGGGCCAGGACTCTTTTGAAAGCAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188302 AGTCGTGGTA...CAGGTAAACTCGGGGGCCAGGACTCTTTTGAAAGCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGAGAGCTACGATAGTTGTGATCGCCTCACCCAGTCCTGGAGCAGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192714 AGAGAGCTACGATAGTTGTGATCGCCTCACCCAGTCCTGGAGCAGCCAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CATCTTTCAACAGCCTGCAGCGTGTTCCCTCCTATGACAGCTTCGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192764 CATCTTTCAACAGCCTGCAGCGTGTTCCCTCCTATGACAGCTTCGACTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGGACTATCCGGCTGCCCTGCCCAACCACAAGCCCAAGGGCACCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192814 GAGGACTATCCGGCTGCCCTGCCCAACCACAAGCCCAAGGGCACCTTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGACTATGTGCGGGACCGTGCTGACCTCAATAAGGACAAGCCTGTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192864 GGACTATGTGCGGGACCGTGCTGACCTCAATAAGGACAAGCCTGTCATTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CTGCTGCTGCCCTAGCTGGCTACACAG         GCAGTGGACCAATC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 192914 CTGCTGCTGCCCTAGCTGGCTACACAGGTA...TAGGCAGTGGACCAATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CAGCTGTGGCAGTTTCTTCTGGAATTACTCACTGATAAATCCTGTCAGTC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209518 CAGCTATGGCAGTTTCTTCTGGAATTACTCACTGATAAATCCTGTCAGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TTTTATCAGCTGGACAGGAGATGGCTGGGAATTCAAACTTTCTGACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209568 TTTTATCAGCTGGACAGGAGATGGCTGGGAATTCAAACTTTCTGACCCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ATGAG         GTGGCCAGGAGATGGGGAAAGAGGAAAAACAAACCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209618 ATGAGGTA...CAGGTGGCCAGGAGATGGGGAAAGAGGAAAAACAAACCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AAGATGAATTATGAGAAACTGAGCCGTGGCCTACGCTACTATTACGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210591 AAGATGAATTATGAGAAACTGAGCCGTGGCCTACGCTACTATTACGACAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AAACATCATCCACAAGACAGCGGGGAAACGCTACGTGTACCGCTTTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210641 AAACATCATCCACAAGACAGCGGGGAAACGCTACGTGTACCGCTTTGTGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GTGACCTGCAGAGCCTGCTGGGGTACACCCCTGAGGAGCTGCACGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210691 GTGACCTGCAGAGCCTGCTGGGGTACACCCCTGAGGAGCTGCACGCCATG

   1500     .    :    .    :    .
   1429 CTGGACGTCAAGCCAGATGCCGACGAG
        |||||||||||||||||||||||||||
 210741 CTGGACGTCAAGCCAGATGCCGACGAG