seq1 = pF1KB4810.tfa, 915 bp
seq2 = pF1KB4810/gi568815595r_58092690.tfa (gi568815595r:58092690_58310906), 218217 bp

>pF1KB4810 915
>gi568815595r:58092690_58310906 (Chr3)

(complement)

1-141  (100001-100141)   100% ->
142-230  (102601-102689)   100% ->
231-320  (105347-105436)   100% ->
321-433  (106026-106138)   100% ->
434-546  (109798-109910)   100% ->
547-704  (112929-113086)   100% ->
705-801  (117468-117564)   100% ->
802-915  (118104-118217)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCACGGGAGCTGGCCCCACTGCTGCTTCTCCTCCTCTCCATCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCACGGGAGCTGGCCCCACTGCTGCTTCTCCTCCTCTCCATCCACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCCTGGCCATGAGGATCTGCTCCTTCAACGTCAGGTCCTTTGGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCCTGGCCATGAGGATCTGCTCCTTCAACGTCAGGTCCTTTGGGGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAGCAGGAAGACAAGAATGCCATGGATGTCATTGTGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100101 GCAAGCAGGAAGACAAGAATGCCATGGATGTCATTGTGAAGGTG...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCATCAAACGCTGTGACATCATACTCGTGATGGAAATCAAGGACAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102601 GTCATCAAACGCTGTGACATCATACTCGTGATGGAAATCAAGGACAGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACAGGATCTGCCCCATACTGATGGAGAAGCTGAACAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102651 CAACAGGATCTGCCCCATACTGATGGAGAAGCTGAACAGGTA...TAGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTCAAGGAGAGGCATAACGTACAACTATGTGATTAGCTCTCGGCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105349 ATTCAAGGAGAGGCATAACGTACAACTATGTGATTAGCTCTCGGCTTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGAAACACATATAAAGAACAATATGCCTTTCTCTACAA         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105399 AGAAACACATATAAAGAACAATATGCCTTTCTCTACAAGTA...TAGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAGCTGGTGTCTGTGAAGAGGAGTTATCACTACCATGACTATCAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106029 AAAGCTGGTGTCTGTGAAGAGGAGTTATCACTACCATGACTATCAGGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGACGCAGATGTGTTTTCCAGGGAGCCCTTTGTGGTCTGGTTCCAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106079 GAGACGCAGATGTGTTTTCCAGGGAGCCCTTTGTGGTCTGGTTCCAATCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCCCACACTG         CTGTCAAAGACTTCGTGATTATCCCCCTGCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106129 CCCCACACTGGTA...CAGCTGTCAAAGACTTCGTGATTATCCCCCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CACCACCCCAGAGACATCCGTTAAGGAGATCGATGAGTTGGTTGAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109829 CACCACCCCAGAGACATCCGTTAAGGAGATCGATGAGTTGGTTGAGGTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACACGGACGTGAAACACCGCTGGAAGGCGGAG         AATTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109879 ACACGGACGTGAAACACCGCTGGAAGGCGGAGGTG...TAGAATTTCATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTCATGGGTGACTTCAATGCCGGCTGCAGCTACGTCCCCAAGAAGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112938 TTCATGGGTGACTTCAATGCCGGCTGCAGCTACGTCCCCAAGAAGGCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAAGAACATCCGCTTGAGGACTGACCCCAGGTTTGTTTGGCTGATCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112988 GAAGAACATCCGCTTGAGGACTGACCCCAGGTTTGTTTGGCTGATCGGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACCAAGAGGACACCACGGTGAAGAAGAGCACCAACTGTGCATATGACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 113038 ACCAAGAGGACACCACGGTGAAGAAGAGCACCAACTGTGCATATGACAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    705         GATTGTGCTTAGAGGACAAGAAATCGTCAGTTCTGTTGTTCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113088 TA...CAGGATTGTGCTTAGAGGACAAGAAATCGTCAGTTCTGTTGTTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAAGTCAAACAGTGTTTTTGACTTCCAGAAAGCTTACAAGCTGACTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117510 CAAGTCAAACAGTGTTTTTGACTTCCAGAAAGCTTACAAGCTGACTGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGGAG         GCCCTGGATGTCAGCGACCACTTTCCAGTTGAATTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117560 AGGAGGTA...TAGGCCCTGGATGTCAGCGACCACTTTCCAGTTGAATTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAACTACAGTCTTCAAGGGCCTTCACCAACAGCAAAAAATCTGTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118140 AAACTACAGTCTTCAAGGGCCTTCACCAACAGCAAAAAATCTGTCACTCT

    950     .    :    .    :    .
    888 AAGGAAGAAAACAAAGAGCAAACGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 118190 AAGGAAGAAAACAAAGAGCAAACGCTCC