seq1 = pF1KB4809.tfa, 2202 bp
seq2 = pF1KB4809/gi568815576f_35300439.tfa (gi568815576f:35300439_35524252), 223814 bp

>pF1KB4809 2202
>gi568815576f:35300439_35524252 (Chr22)

1-167  (100001-100167)   100% ->
168-294  (102769-102895)   100% ->
295-423  (102976-103104)   100% ->
424-596  (106115-106287)   100% ->
597-752  (107970-108125)   100% ->
753-919  (110306-110472)   100% ->
920-1091  (112072-112243)   100% ->
1092-1203  (113437-113548)   100% ->
1204-1347  (115391-115534)   100% ->
1348-1413  (115901-115966)   100% ->
1414-1590  (116200-116376)   100% ->
1591-1703  (117306-117418)   100% ->
1704-1832  (119446-119574)   100% ->
1833-1975  (120880-121022)   100% ->
1976-2103  (122776-122903)   100% ->
2104-2202  (123716-123814)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGGATTCGACGATCCTGGCATTTTCTACAGCGACAGCTTCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGGATTCGACGATCCTGGCATTTTCTACAGCGACAGCTTCGGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACGCCCAGGCCGACGAGGGGCAGGCCCGCAAATCGCAGCTGCAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACGCCCAGGCCGACGAGGGGCAGGCCCGCAAATCGCAGCTGCAGAGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCAAGGAGTTCCTGCGGCAGTACCGAGTGGGCACCGACCGCACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTCAAGGAGTTCCTGCGGCAGTACCGAGTGGGCACCGACCGCACGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCACCTTCAAATACAG         GGATGAACTCAAGCGGCATTACAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCACCTTCAAATACAGGTG...CAGGGATGAACTCAAGCGGCATTACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGGGGGAGTACTGGATTGAGGTGGAGATGGAGGATCTGGCCAGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102793 CCTGGGGGAGTACTGGATTGAGGTGGAGATGGAGGATCTGGCCAGCTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGAGGACCTGGCCGACTACTTGTACAAGCAGCCAGCCGAGCACCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102843 ATGAGGACCTGGCCGACTACTTGTACAAGCAGCCAGCCGAGCACCTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTG         CTGGAGGAAGCTGCCAAGGAGGTAGCTGATGAGGTGAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102893 CTGGTG...CAGCTGGAGGAAGCTGCCAAGGAGGTAGCTGATGAGGTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCGGCCCCGGCCTTCTGGGGAGGAGGTGCTCCAGGACATCCAGGTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103014 CCGGCCCCGGCCTTCTGGGGAGGAGGTGCTCCAGGACATCCAGGTCATGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAAGTCGGACGCCAGCCCTTCCAGCATTCGTAGCCTGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 103064 TCAAGTCGGACGCCAGCCCTTCCAGCATTCGTAGCCTGAAGGTG...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCGGACATGATGTCACACCTGGTGAAGATCCCTGGCATCATCATCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106115 TCGGACATGATGTCACACCTGGTGAAGATCCCTGGCATCATCATCGCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCTGCGGTCCGTGCCAAGGCCACCCGCATCTCTATCCAGTGCCGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106165 CTCTGCGGTCCGTGCCAAGGCCACCCGCATCTCTATCCAGTGCCGCAGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCGCAACACCCTCACCAACATTGCCATGCGCCCTGGCCTCGAGGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106215 GCCGCAACACCCTCACCAACATTGCCATGCGCCCTGGCCTCGAGGGCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCCTGCCCAGGAAGTGCAACAC         AGATCAGGCTGGGCGCCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106265 GCCCTGCCCAGGAAGTGCAACACGTG...CAGAGATCAGGCTGGGCGCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAAATGCCCATTGGACCCGTACTTCATCATGCCCGACAAATGCAAATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107988 CAAATGCCCATTGGACCCGTACTTCATCATGCCCGACAAATGCAAATGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGACTTCCAGACCCTGAAGCTGCAGGAGCTGCCTGATGCAGTCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108038 TGGACTTCCAGACCCTGAAGCTGCAGGAGCTGCCTGATGCAGTCCCCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGGGAGATGCCCAGACACATGCAGCTCTACTGCGACAG         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 108088 GGGGAGATGCCCAGACACATGCAGCTCTACTGCGACAGGTG...CAGGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTGTGTGACAAGGTCGTCCCTGGGAACAGGGTTACCATCATGGGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110309 CCTGTGTGACAAGGTCGTCCCTGGGAACAGGGTTACCATCATGGGCATCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACTCCATCAAGAAGTTTGGCCTGACTACCAGCAGGGGCCGTGACAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110359 ACTCCATCAAGAAGTTTGGCCTGACTACCAGCAGGGGCCGTGACAGGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGCGTGGGCATCCGAAGCTCCTACATCCGTGTCCTGGGCATCCAGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110409 GGCGTGGGCATCCGAAGCTCCTACATCCGTGTCCTGGGCATCCAGGTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CACAGATGGCTCTG         GCCGCAGCTTTGCTGGGGCCGTGAGCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 110459 CACAGATGGCTCTGGTG...AAGGCCGCAGCTTTGCTGGGGCCGTGAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCCAGGAGGAGGAGGAGTTCCGTCGCCTGGCTGCCCTCCCAAATGTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112099 CCCAGGAGGAGGAGGAGTTCCGTCGCCTGGCTGCCCTCCCAAATGTCTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGGTCATCTCCAAGAGCATCGCCCCCTCCATCTTTGGGGGCACAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112149 GAGGTCATCTCCAAGAGCATCGCCCCCTCCATCTTTGGGGGCACAGACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GAAGAAGGCCATTGCCTGCCTGCTCTTTGGGGGCTCCCGAAAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 112199 GAAGAAGGCCATTGCCTGCCTGCTCTTTGGGGGCTCCCGAAAGAGGTA..

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092     GCTCCCTGATGGACTTACTCGCCGAGGAGACATCAACCTGCTGATG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112249 .CAGGCTCCCTGATGGACTTACTCGCCGAGGAGACATCAACCTGCTGATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTAGGGGACCCTGGGACAGCCAAGTCCCAGCTTCTGAAGTTTGTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113483 CTAGGGGACCCTGGGACAGCCAAGTCCCAGCTTCTGAAGTTTGTGGAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GTGTTCTCCCATTGGG         GTATACACGTCTGGGAAAGGCAGCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113533 GTGTTCTCCCATTGGGGTG...CAGGTATACACGTCTGGGAAAGGCAGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GCGCAGCTGGACTGACAGCCTCGGTGATGAGGGACCCTTCGTCCCGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115416 GCGCAGCTGGACTGACAGCCTCGGTGATGAGGGACCCTTCGTCCCGGAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTCATCATGGAGGGCGGAGCCATGGTCCTGGCCGATGGTGGGGTCGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115466 TTCATCATGGAGGGCGGAGCCATGGTCCTGGCCGATGGTGGGGTCGTCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TATTGACGAGTTTGACAAG         ATGCGAGAAGATGACCGTGTGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 115516 TATTGACGAGTTTGACAAGGTG...TAGATGCGAGAAGATGACCGTGTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CAATCCACGAAGCCATGGAGCAGCAGACCATCTCTATCGCCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 115923 CAATCCACGAAGCCATGGAGCAGCAGACCATCTCTATCGCCAAGGTG...

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1414    GCTGGGATCACCACCACCCTGAACTCCCGCTGCTCCGTCCTGGCTGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116197 TAGGCTGGGATCACCACCACCCTGAACTCCCGCTGCTCCGTCCTGGCTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TGCCAACTCAGTGTTCGGCCGCTGGGATGAGACGAAGGGGGAGGACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116247 TGCCAACTCAGTGTTCGGCCGCTGGGATGAGACGAAGGGGGAGGACAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TTGACTTCATGCCCACCATCTTGTCGCGCTTCGACATGATCTTCATCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116297 TTGACTTCATGCCCACCATCTTGTCGCGCTTCGACATGATCTTCATCGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AAGGATGAGCACAATGAGGAGAGGGATGTG         ATGCTGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 116347 AAGGATGAGCACAATGAGGAGAGGGATGTGGTA...CAGATGCTGGCCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GCATGTCATCACTCTGCACGTGAGCGCACTGACACAGACACAGGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117317 GCATGTCATCACTCTGCACGTGAGCGCACTGACACAGACACAGGCTGTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AGGGCGAGATTGACCTGGCCAAGCTGAAGAAGTTTATTGCCTACTGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117367 AGGGCGAGATTGACCTGGCCAAGCTGAAGAAGTTTATTGCCTACTGCCGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GT         GAAGTGTGGCCCCCGGCTGTCAGCAGAGGCTGCAGAGAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117417 GTGTG...CAGGAAGTGTGGCCCCCGGCTGTCAGCAGAGGCTGCAGAGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 ACTGAAGAACCGCTACATCATCATGCGGAGCGGGGCCCGTCAGCACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119485 ACTGAAGAACCGCTACATCATCATGCGGAGCGGGGCCCGTCAGCACGAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 GGGACAGTGACCGCCGCTCCAGCATCCCCATCACTGTGCG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 119535 GGGACAGTGACCGCCGCTCCAGCATCCCCATCACTGTGCGGTG...CAGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CAGCTGGAGGCCATTGTGCGCATCGCGGAAGCCCTCAGCAAGATGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120881 CAGCTGGAGGCCATTGTGCGCATCGCGGAAGCCCTCAGCAAGATGAAGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GCAGCCCTTCGCCACAGAGGCAGATGTGGAGGAGGCCCTGCGGCTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120931 GCAGCCCTTCGCCACAGAGGCAGATGTGGAGGAGGCCCTGCGGCTCTTCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AAGTGTCCACGTTGGATGCTGCCTTGTCCGGTACCCTGTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 120981 AAGTGTCCACGTTGGATGCTGCCTTGTCCGGTACCCTGTCAGGTG...CA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1976  GGGTGGAGGGCTTCACCAGCCAGGAGGACCAGGAGATGCTGAGCCGCAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122775 GGGGTGGAGGGCTTCACCAGCCAGGAGGACCAGGAGATGCTGAGCCGCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CGAGAAGCAGCTCAAGCGCCGCTTTGCCATTGGCTCCCAGGTGTCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122825 CGAGAAGCAGCTCAAGCGCCGCTTTGCCATTGGCTCCCAGGTGTCTGAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ACAGCATCATCAAGGACTTCACCAAGCAG         AAATACCCGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 122875 ACAGCATCATCAAGGACTTCACCAAGCAGGTG...CAGAAATACCCGGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CACGCCATCCACAAGGTGCTGCAGCTCATGCTGCGGCGCGGCGAGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123728 CACGCCATCCACAAGGTGCTGCAGCTCATGCTGCGGCGCGGCGAGATCCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .
   2166 GCATCGCATGCAGCGCAAGGTTCTCTACCGCCTCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123778 GCATCGCATGCAGCGCAAGGTTCTCTACCGCCTCAAG