seq1 = pF1KB4784.tfa, 813 bp
seq2 = pF1KB4784/gi568815586r_57723605.tfa (gi568815586r:57723605_57946435), 222831 bp

>pF1KB4784 813
>gi568815586r:57723605_57946435 (Chr12)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-213  (116840-116988)   100% ->
214-252  (118846-118884)   100% ->
253-354  (119339-119440)   100% ->
355-411  (120034-120090)   100% ->
412-504  (122117-122209)   100% ->
505-690  (122347-122532)   100% ->
691-813  (122709-122831)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAACACGGCTCCATCATCACCCAGGCGCGGAGGGAAGACGCCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAACACGGCTCCATCATCACCCAGGCGCGGAGGGAAGACGCCCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCACCAAGCAAG         GCCTGGTCTCCAAGTCCTCTCCTAAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCACCAAGCAAGGTA...TAGGCCTGGTCTCCAAGTCCTCTCCTAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCCTCGTGGACGTAACATCTTCAAGGCCCTTTTCTGCTGTTTTCGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116867 AGCCTCGTGGACGTAACATCTTCAAGGCCCTTTTCTGCTGTTTTCGCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGCATGTTGGCCAGTCAAGTTCCTCCACTGAGCTCGCTGCGTATAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116917 CAGCATGTTGGCCAGTCAAGTTCCTCCACTGAGCTCGCTGCGTATAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAAGCAAACACCATTGCTAAG         TCGGATCTGCTCCAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 116967 GGAAGCAAACACCATTGCTAAGGTA...CAGTCGGATCTGCTCCAGTGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCAGTACCAGTTCTACCAG         ATCCCAGGGACCTGCCTGCTC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 118865 TCCAGTACCAGTTCTACCAGGTA...TAGATCCCAGGGACCTGCCTGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCAGAGGTGACAGAGGAAGATCAAGGAAGGATCTGTGTGGTCATTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119360 CCAGAGGTGACAGAGGAAGATCAAGGAAGGATCTGTGTGGTCATTGACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGATGAAACCCTTGTGCATAGCTCCTTTAAG         CCAATCAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 119410 CGATGAAACCCTTGTGCATAGCTCCTTTAAGGTA...CAGCCAATCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGCTGACTTCATAGTGCCTATAGAGATTGAGGGGACCACTCACCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 120044 ATGCTGACTTCATAGTGCCTATAGAGATTGAGGGGACCACTCACCAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    412       GTGTATGTGCTCAAGAGGCCTTATGTGGATGAGTTCCTGAGACG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120094 ...CAGGTGTATGTGCTCAAGAGGCCTTATGTGGATGAGTTCCTGAGACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CATGGGGGAACTCTTTGAATGTGTTCTCTTCACTGCCAGCCTGGCCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 122161 CATGGGGGAACTCTTTGAATGTGTTCTCTTCACTGCCAGCCTGGCCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    505         TATGCCGACCCTGTGACAGACCTGCTGGACCGGTGTGGGGTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122211 TA...TAGTATGCCGACCCTGTGACAGACCTGCTGGACCGGTGTGGGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TTCCGGGCCCGCCTATTCCGTGAGTCTTGCGTGTTCCACCAGGGCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122389 TTCCGGGCCCGCCTATTCCGTGAGTCTTGCGTGTTCCACCAGGGCTGCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CGTCAAGGACCTCAGCCGCCTGGGGAGGGACCTGAGAAAGACCCTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122439 CGTCAAGGACCTCAGCCGCCTGGGGAGGGACCTGAGAAAGACCCTCATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGGACAACTCGCCTGCTTCTTACATATTCCACCCCGAGAATGCA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 122489 TGGACAACTCGCCTGCTTCTTACATATTCCACCCCGAGAATGCAGTG...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    691    GTGCCTGTGCAGTCCTGGTTTGATGACATGGCAGACACTGAGTTGCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122706 CAGGTGCCTGTGCAGTCCTGGTTTGATGACATGGCAGACACTGAGTTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAACCTGATCCCAATCTTTGAGGAGCTGAGCGGAGCAGAGGACGTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122756 GAACCTGATCCCAATCTTTGAGGAGCTGAGCGGAGCAGAGGACGTCTACA

    850     .    :    .    :    .
    788 CCAGCCTTGGGCAGCTGCGGGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||
 122806 CCAGCCTTGGGCAGCTGCGGGCCCCT