seq1 = pF1KB4783.tfa, 1956 bp
seq2 = pF1KB4783/gi568815576r_38385974.tfa (gi568815576r:38385974_38606000), 220027 bp

>pF1KB4783 1956
>gi568815576r:38385974_38606000 (Chr22)

(complement)

1-50  (100001-100050)   100% ->
51-201  (104721-104871)   100% ->
202-301  (106502-106601)   100% ->
302-435  (107428-107561)   100% ->
436-501  (107851-107916)   100% ->
502-643  (110064-110205)   100% ->
644-804  (110955-111115)   100% ->
805-977  (111199-111371)   100% ->
978-1088  (111870-111980)   100% ->
1089-1150  (112230-112291)   100% ->
1151-1210  (113886-113945)   100% ->
1211-1453  (117886-118128)   100% ->
1454-1956  (119561-120063)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGCGGAGGAGGCTTTGGGGACCGGGACCGGGATCGTGACCGTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGCGGAGGAGGCTTTGGGGACCGGGACCGGGATCGTGACCGTGGAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51          ATTTGGAGCAAGAGGTGGTGGTGGCCTTCCCCCGAAGAAAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTA...TAGATTTGGAGCAAGAGGTGGTGGTGGCCTTCCCCCGAAGAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGGTAATCCTGGGGAGCGTTTGCGTAAAAAAAAGTGGGATTTGAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104762 TTGGTAATCCTGGGGAGCGTTTGCGTAAAAAAAAGTGGGATTTGAGTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCCCCAAGTTTGAGAAAAATTTTTATGTGGAACATCCGGAAGTAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104812 CTCCCCAAGTTTGAGAAAAATTTTTATGTGGAACATCCGGAAGTAGCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGACACCA         TATGAGGTTGATGAGCTACGCCGAAAGAAGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104862 GCTGACACCAGTA...TAGTATGAGGTTGATGAGCTACGCCGAAAGAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGATTACAGTGAGGGGGGGAGATGTTTGTCCTAAACCCGTGTTTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106533 AGATTACAGTGAGGGGGGGAGATGTTTGTCCTAAACCCGTGTTTGCCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CATCATGCTAACTTCCCAC         AATATGTAATGGATGTGTTGAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 106583 CATCATGCTAACTTCCCACGTA...CAGAATATGTAATGGATGTGTTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGATCAGCACTTTACAGAACCAACTCCAATTCAGTGCCAGGGATTTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107450 GGATCAGCACTTTACAGAACCAACTCCAATTCAGTGCCAGGGATTTCCGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGCTCTTAGTGGCCGGGATATGGTGGGCATTGCTCAGACTGGCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107500 TGGCTCTTAGTGGCCGGGATATGGTGGGCATTGCTCAGACTGGCTCTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGACGTTGGCG         TATCTCCTGCCTGCAATTGTTCATATTAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 107550 AAGACGTTGGCGGTA...CAGTATCTCCTGCCTGCAATTGTTCATATTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCACCAGCCATACTTGGAAAGGGGAGATGGCCCAATC         TGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 107880 CCACCAGCCATACTTGGAAAGGGGAGATGGCCCAATCGTA...CAGTGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TAGTTCTGGCTCCTACCAGAGAGCTTGCCCAGCAAGTACAGCAGGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110068 TAGTTCTGGCTCCTACCAGAGAGCTTGCCCAGCAAGTACAGCAGGTGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GATGACTATGGCAAATGTTCTAGATTGAAGAGTACTTGTATTTATGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110118 GATGACTATGGCAAATGTTCTAGATTGAAGAGTACTTGTATTTATGGAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGCTCCTAAAGGTCCCCAGATTCGAGACTTGGAAAGAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 110168 TGCTCCTAAAGGTCCCCAGATTCGAGACTTGGAAAGAGGTA...CAGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTGAGATCTGCATAGCCACTCCTGGACGTCTGATAGATTTCCTGGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110958 TTGAGATCTGCATAGCCACTCCTGGACGTCTGATAGATTTCCTGGAGTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGAAAGACAAATCTTCGCCGATGTACTTACCTTGTATTGGACGAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111008 GGAAAGACAAATCTTCGCCGATGTACTTACCTTGTATTGGACGAAGCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAGAATGCTTGATATGGGGTTTGAACCCCAGATCCGTAAAATTGTTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111058 CAGAATGCTTGATATGGGGTTTGAACCCCAGATCCGTAAAATTGTTGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAATCAGG         CCTGATAGGCAGACACTGATGTGGAGTGCAACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 111108 AAATCAGGGTG...TAGCCTGATAGGCAGACACTGATGTGGAGTGCAACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TGGCCAAAAGAAGTAAGACAGCTTGCAGAGGATTTCCTTCGTGATTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111232 TGGCCAAAAGAAGTAAGACAGCTTGCAGAGGATTTCCTTCGTGATTACAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCAGATCAACGTAGGCAATCTGGAGTTGAGTGCCAACCACAACATCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111282 CCAGATCAACGTAGGCAATCTGGAGTTGAGTGCCAACCACAACATCCTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGATAGTGGATGTCTGCATGGAAAGTGAAAAAGACCACAA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 111332 AGATAGTGGATGTCTGCATGGAAAGTGAAAAAGACCACAAGTA...CAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TTGATCCAACTAATGGAAGAAATAATGGCTGAAAAGGAAAACAAAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111871 TTGATCCAACTAATGGAAGAAATAATGGCTGAAAAGGAAAACAAAACAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AATATTTGTGGAGACAAAGAGACGCTGTGATGATCTGACTCGAAGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111921 AATATTTGTGGAGACAAAGAGACGCTGTGATGATCTGACTCGAAGGATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCAGAGATGG         TTGGCCAGCTATGTGTATCCATGGAGACAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111971 GCAGAGATGGGTG...TAGTTGGCCAGCTATGTGTATCCATGGAGACAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AGTCAACCAGAAAGAGATTGGGTACTTAATG         AGTTCCGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 112261 AGTCAACCAGAAAGAGATTGGGTACTTAATGGTA...CAGAGTTCCGTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TGGAAAGGCACCCATCCTTATTGCTACAGATGTAGCCTCCCGTGGGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113896 TGGAAAGGCACCCATCCTTATTGCTACAGATGTAGCCTCCCGTGGGCTAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211          ATGTGGAAGATGTCAAGTTTGTGATCAACTATGACTATCCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113946 GTT...AAGATGTGGAAGATGTCAAGTTTGTGATCAACTATGACTATCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AACAGCTCAGAGGATTATGTGCACCGTATTGGCCGAACAGCCCGTAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117927 AACAGCTCAGAGGATTATGTGCACCGTATTGGCCGAACAGCCCGTAGCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CAACAAGGGTACCGCCTATACCTTCTTCACCCCAGGGAACCTAAAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117977 CAACAAGGGTACCGCCTATACCTTCTTCACCCCAGGGAACCTAAAACAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CCAGAGAGCTTATCAAAGTGCTGGAAGAGGCCAATCAGGCTATCAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118027 CCAGAGAGCTTATCAAAGTGCTGGAAGAGGCCAATCAGGCTATCAATCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AAACTGATGCAGCTTGTGGACCACAGAGGAGGCGGCGGAGGCGGGGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118077 AAACTGATGCAGCTTGTGGACCACAGAGGAGGCGGCGGAGGCGGGGGTAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GG         GTGGTCGTTCTCGTTACCGGACCACTTCTTCAGCCAACA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118127 GGGTA...TAGGTGGTCGTTCTCGTTACCGGACCACTTCTTCAGCCAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 ATCCCAATCTGATGTATCAGGATGAGTGTGACCGAAGGCTTCGAGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119600 ATCCCAATCTGATGTATCAGGATGAGTGTGACCGAAGGCTTCGAGGAGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 AAGGATGGTGGCCGGAGAGACTCTGCAAGCTATCGGGATCGTAGTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119650 AAGGATGGTGGCCGGAGAGACTCTGCAAGCTATCGGGATCGTAGTGAAAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CGATAGAGCTGGTTATGCTAATGGCAGTGGCTATGGAAGTCCAAATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119700 CGATAGAGCTGGTTATGCTAATGGCAGTGGCTATGGAAGTCCAAATTCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CCTTTGGAGCACAAGCAGGCCAATACACCTATGGTCAAGGCACCTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119750 CCTTTGGAGCACAAGCAGGCCAATACACCTATGGTCAAGGCACCTATGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GCAGCTGCTTATGGCACCAGTAGCTATACAGCTCAAGAATATGGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119800 GCAGCTGCTTATGGCACCAGTAGCTATACAGCTCAAGAATATGGTGCTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CACTTATGGAGCTAGTAGCACCACCTCAACTGGGAGAAGTTCACAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119850 CACTTATGGAGCTAGTAGCACCACCTCAACTGGGAGAAGTTCACAGAGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CTAGCCAGCAGTTTAGTGGGATAGGCCGGTCTGGGCAGCAGCCACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119900 CTAGCCAGCAGTTTAGTGGGATAGGCCGGTCTGGGCAGCAGCCACAGCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CTGATGTCACAACAGTTTGCACAGCCTCCGGGAGCTACCAATATGATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119950 CTGATGTCACAACAGTTTGCACAGCCTCCGGGAGCTACCAATATGATAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TTACATGGGGCAGACTGCCTACCAATACCCTCCTCCTCCTCCACCTCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 120000 TTACATGGGGCAGACTGCCTACCAATACCCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTC

   2050     .    :
   1943 CTCCTTCACGTAAA
        ||||||||||||||
 120050 CTCCTTCACGTAAA