seq1 = pF1KB4757.tfa, 1632 bp
seq2 = pF1KB4757/gi568815595f_44620262.tfa (gi568815595f:44620262_44822449), 202188 bp

>pF1KB4757 1632
>gi568815595f:44620262_44822449 (Chr3)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-1632  (100612-102188)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGAATATGCAAGGAGCTGAAGAGAGAGACATTAGAAGAGAGACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGAATATGCAAGGAGCTGAAGAGAGAGACATTAGAAGAGAGACTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCAG         GCTGGGTAAACAAGAACAAGCCTGCTCTGGAGCAGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCAGGTG...CAGGCTGGGTAAACAAGAACAAGCCTGCTCTGGAGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGTCTGTAAAATTGACTCATCAGGGATAGTAGTAAAGAGGTTCCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100648 ATGTCTGTAAAATTGACTCATCAGGGATAGTAGTAAAGAGGTTCCAAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGAATACCAAGATTCTACATTTGAAGAAAAATATGCATGTGAGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100698 GATGAATACCAAGATTCTACATTTGAAGAAAAATATGCATGTGAGGGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGGAAAACTCTCCTAGGGAGATTGCTGAATCATGCCTTTTCCAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100748 GAAGGAAAACTCTCCTAGGGAGATTGCTGAATCATGCCTTTTCCAGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAGGTTTTGGGAGAATAACTTTCATCCACAAAGAAGCACCCCCTGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100798 GAGGTTTTGGGAGAATAACTTTCATCCACAAAGAAGCACCCCCTGAAATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTAGTCAAGGATATAATTTTGAGAAAAGCTTGCTTTTGACCTCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100848 ATTAGTCAAGGATATAATTTTGAGAAAAGCTTGCTTTTGACCTCAAGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGTTACACGTCTCAGGGTTTCTACAGAAGAGAGTCTGCATCAGTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100898 TGTTACACGTCTCAGGGTTTCTACAGAAGAGAGTCTGCATCAGTGGGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAAGTAATATACAAACCAATGATATTTCAGACCAAAGTAAATGTCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100948 CAAGTAATATACAAACCAATGATATTTCAGACCAAAGTAAATGTCCAACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTCTGCACACAGAAAAAATCTTGGAAATGTAATGAATGTGGAAAAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100998 CTCTGCACACAGAAAAAATCTTGGAAATGTAATGAATGTGGAAAAACCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TACTCAGAGCTCATCCCTTACCCAACATCAGAGAACTCATACTGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101048 TACTCAGAGCTCATCCCTTACCCAACATCAGAGAACTCATACTGGAGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GACCCTACACATGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTCGTAGTTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101098 GACCCTACACATGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTCGTAGTTCATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTTGTTCAACATCAAAGAATTCACACTGGAGTGAAACCATATGGATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101148 CTTGTTCAACATCAAAGAATTCACACTGGAGTGAAACCATATGGATGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCAGTGTGGGAAAACATTTCGATGTCGATCATTTCTTACTCAGCATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101198 GCAGTGTGGGAAAACATTTCGATGTCGATCATTTCTTACTCAGCATCAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GAATTCACACTGGAGAGAAACCTTATAAATGCAATGAATGTGGGAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101248 GAATTCACACTGGAGAGAAACCTTATAAATGCAATGAATGTGGGAATTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTCCGCAATCACTCACATCTCACTGAACACCAGAGAATTCACACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101298 TTCCGCAATCACTCACATCTCACTGAACACCAGAGAATTCACACTGGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GAAACCTTATAAATGCAATAGGTGTGGGAAGGCATTCAATCAGAATACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101348 GAAACCTTATAAATGCAATAGGTGTGGGAAGGCATTCAATCAGAATACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACCTTATTCATCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAGCCTTACATATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101398 ACCTTATTCATCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAGCCTTACATATGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AGTGAATGTGGCTCTTCTTTTCGAAAACACTCAAATCTTACGCAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101448 AGTGAATGTGGCTCTTCTTTTCGAAAACACTCAAATCTTACGCAACATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GAGAATTCACACTGGGGAAAAACCCCATAAATGTGACGAATGTGGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101498 GAGAATTCACACTGGGGAAAAACCCCATAAATGTGACGAATGTGGGAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CTTTCCAAACAAAGGCAAACCTCTCTCAGCATCAGAGAATTCATAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101548 CTTTCCAAACAAAGGCAAACCTCTCTCAGCATCAGAGAATTCATAGTGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GAGAAACCCTATAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGCCTTTTGTCAGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101598 GAGAAACCCTATAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGCCTTTTGTCAGAGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 ATCTCTTATTAAACACCAGCGAATTCATACTGGAGAAAAACCATATAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101648 ATCTCTTATTAAACACCAGCGAATTCATACTGGAGAAAAACCATATAAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GTAAAGAATGTGGCAAAGCGTTTACTCAGAGCACCCCACTCACTAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101698 GTAAAGAATGTGGCAAAGCGTTTACTCAGAGCACCCCACTCACTAAACAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CAGAGAATACATACAGGGGAGAGACCCTACAAATGCAGTGAATGTGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101748 CAGAGAATACATACAGGGGAGAGACCCTACAAATGCAGTGAATGTGGTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AGCCTTCATTCAGAGCATTTGCCTTATTCGGCACCAGAGAAGTCACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101798 AGCCTTCATTCAGAGCATTTGCCTTATTCGGCACCAGAGAAGTCACACTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GAGAAAAACCCTATAAATGCAATGAATGTGGAAAGGGCTTTAATCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101848 GAGAAAAACCCTATAAATGCAATGAATGTGGAAAGGGCTTTAATCAGAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 ACCTGCCTCACTCAGCATATGAGAATTCATACTGGAGAGAAGCCCTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101898 ACCTGCCTCACTCAGCATATGAGAATTCATACTGGAGAGAAGCCCTATAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 ATGTAAAGAATGTGGGAAAGCCTTTGCTCATAGCTCATCTCTTACTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101948 ATGTAAAGAATGTGGGAAAGCCTTTGCTCATAGCTCATCTCTTACTGAAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 ATCATAGAACTCACACTGGTGAGAAGCTCTATAAATGTAGTGAGTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101998 ATCATAGAACTCACACTGGTGAGAAGCTCTATAAATGTAGTGAGTGTGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 AAAACCTTCCGCAAGTATGCACACCTTAGTGAACATTACAGAATTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102048 AAAACCTTCCGCAAGTATGCACACCTTAGTGAACATTACAGAATTCACAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TGGTGAGAAGCCTTATGAGTGTATTGAGTGTGGAAAGTTCTTCAGACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102098 TGGTGAGAAGCCTTATGAGTGTATTGAGTGTGGAAAGTTCTTCAGACATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 GTTCAGTCCTTTTCAGACATCAGAAACTTCACAGTGGTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102148 GTTCAGTCCTTTTCAGACATCAGAAACTTCACAGTGGTGAC