seq1 = pF1KB4722.tfa, 990 bp
seq2 = pF1KB4722/gi568815595r_122314539.tfa (gi568815595r:122314539_122515528), 200990 bp

>pF1KB4722 990
>gi568815595r:122314539_122515528 (Chr3)

(complement)

1-990  (100001-100990)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAACCAAGGAGTCAAGAGACGCCAAAGCACAGTTGGCCCTCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAACCAAGGAGTCAAGAGACGCCAAAGCACAGTTGGCCCTCTCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCGGCCAATCAGAGCAAGGAAGTGCCTGAAAACCCAAACTATGCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCGGCCAATCAGAGCAAGGAAGTGCCTGAAAACCCAAACTATGCTCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AATGTACTCTTGTGGGACACACGGAAGCAGTGTCATCAGTTAAGTTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AATGTACTCTTGTGGGACACACGGAAGCAGTGTCATCAGTTAAGTTTAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTAATGGAGAATGGCTAGCAAGTTCTTCTGCTGATAGGCTAATCATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTAATGGAGAATGGCTAGCAAGTTCTTCTGCTGATAGGCTAATCATAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTGGGGAGCATATGATGGAAAATATGAGAAAACACTCTATGGTCATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTGGGGAGCATATGATGGAAAATATGAGAAAACACTCTATGGTCATAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGAAATATCGGATGTTGCCTGGTCATCAGATTCCAGTCGTCTTGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGAAATATCGGATGTTGCCTGGTCATCAGATTCCAGTCGTCTTGTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCTCAGATGATAAAACTCTAAAATTATGGGATGTGAGATCTGGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCTCAGATGATAAAACTCTAAAATTATGGGATGTGAGATCTGGAAAATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTGAAAACACTGAAGGGGCACAGTAATTATGTCTTTTGTTGTAACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTGAAAACACTGAAGGGGCACAGTAATTATGTCTTTTGTTGTAACTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATCCGCCATCCAACCTTATAATCTCGGGATCTTTTGATGAGACTGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATCCGCCATCCAACCTTATAATCTCGGGATCTTTTGATGAGACTGTAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATATGGGAGGTGAAAACAGGAAAGTGTCTCAAGACTTTGTCTGCTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATATGGGAGGTGAAAACAGGAAAGTGTCTCAAGACTTTGTCTGCTCATTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGACCCAGTTTCTGCTGTTCATTTTAATTGTAGTGGGTCCTTGATAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGACCCAGTTTCTGCTGTTCATTTTAATTGTAGTGGGTCCTTGATAGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGGTAGCTATGATGGCCTCTGTAGAATCTGGGATGCTGCATCAGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAGGTAGCTATGATGGCCTCTGTAGAATCTGGGATGCTGCATCAGGTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGTTTAAAAACGCTCGTTGATGACGATAACCCTCCTGTCTCTTTTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGTTTAAAAACGCTCGTTGATGACGATAACCCTCCTGTCTCTTTTGTAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATTTTCTCCAAATGGTAAATACATTCTCACTGCAACTTTGGACAACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATTTTCTCCAAATGGTAAATACATTCTCACTGCAACTTTGGACAACACTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTAAACTATGGGATTATAGCAGAGGCAGGTGCCTGAAAACATACACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTAAACTATGGGATTATAGCAGAGGCAGGTGCCTGAAAACATACACTGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CATAAGAATGAGAAATATTGCATATTTGCCAATTTTTCAGTTACTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CATAAGAATGAGAAATATTGCATATTTGCCAATTTTTCAGTTACTGGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAAGTGGATTGTGTCTGGTTCCGAGGATAACCTGGTTTACATTTGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAAGTGGATTGTGTCTGGTTCCGAGGATAACCTGGTTTACATTTGGAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTCAGACTAAAGAGATTGTGCAGAAATTACAAGGCCATACAGATGTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTCAGACTAAAGAGATTGTGCAGAAATTACAAGGCCATACAGATGTTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATCTCAGCAGCTTGTCATCCTACAGAAAACCTCATCGCATCAGCAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATCTCAGCAGCTTGTCATCCTACAGAAAACCTCATCGCATCAGCAGCATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGATGAGTAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGATGAGTAACCAC