seq1 = pF1KB4713.tfa, 2328 bp
seq2 = pF1KB4713/gi568815584r_59503064.tfa (gi568815584r:59503064_59970630), 467567 bp

>pF1KB4713 2328
>gi568815584r:59503064_59970630 (Chr14)

(complement)

1-241  (100001-100241)   100% ->
242-1015  (224150-224923)   100% ->
1016-1765  (242963-243712)   100% ->
1766-1973  (363139-363346)   100% ->
1974-2112  (365125-365263)   100% ->
2113-2182  (366710-366779)   100% ->
2183-2229  (367373-367419)   100% ->
2230-2288  (367508-367566)   100% ->
2289-2328  (373844-373883)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCGCCGGGGGATCCGCAGGACGAGCTGCTGCCGCTGGCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCGCCGGGGGATCCGCAGGACGAGCTGCTGCCGCTGGCCGGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGTCCCAGTGGCTCAGGCACCGGGGGGAGGGGGAGAACGAAGCGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGTCCCAGTGGCTCAGGCACCGGGGGGAGGGGGAGAACGAAGCGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCGAAAGGGGCCACGCCGGCGCCGCAGGCTGGGGAGCCCAGCCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCGAAAGGGGCCACGCCGGCGCCGCAGGCTGGGGAGCCCAGCCCGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGGCGCCAGGGCCCGGGAAGCGGCGTCGCGGGAAGCCGGCTCGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGGCGCCAGGGCCCGGGAAGCGGCGTCGCGGGAAGCCGGCTCGGGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCCCGGCAGTCGCCCGTTGCCATGGAAACTGCATCCACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100201 CGCCCGGCAGTCGCCCGTTGCCATGGAAACTGCATCCACAGGTA...TAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTGTGGCAGGTGTTTCCAGTGCCATGGACCACACCTTCTCAACAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224150 GTGTGGCAGGTGTTTCCAGTGCCATGGACCACACCTTCTCAACAACATCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAGATGGGGAAGGATCGTGTTACACATCTCTCATTTCTGACATCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224200 AAAGATGGGGAAGGATCGTGTTACACATCTCTCATTTCTGACATCTGCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCCACCTCAGGAGGATTCTACATATTTTACTGGAATTCTTCAGAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224250 TCCACCTCAGGAGGATTCTACATATTTTACTGGAATTCTTCAGAAGGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGGCCACGTCACCATTTCAGAGAGCCCTGAGGAGCTGGGTACACCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224300 ATGGCCACGTCACCATTTCAGAGAGCCCTGAGGAGCTGGGTACACCCGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCTCCTTACCAGATGTGCCTGGGATAGAGTCTCGTGGCTTATTTAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224350 CCCTCCTTACCAGATGTGCCTGGGATAGAGTCTCGTGGCTTATTTAGTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGATTCTGGAATAGAGATGACTCCTGCAGAGTCCACGGAAGTGAACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224400 TGATTCTGGAATAGAGATGACTCCTGCAGAGTCCACGGAAGTGAACAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCTTAGCAGACCCTCTGGACCAGATGAAAGCAGAGGCCTATAAATACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224450 TCTTAGCAGACCCTCTGGACCAGATGAAAGCAGAGGCCTATAAATACATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GACATAACCAGACCCGAGGAGGTGAAGCACCAAGAACAACATCACCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224500 GACATAACCAGACCCGAGGAGGTGAAGCACCAAGAACAACATCACCCCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTGGAAGATAAAGACTTGGACTTTAAGAATAAAGACACTGACATCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224550 GCTGGAAGATAAAGACTTGGACTTTAAGAATAAAGACACTGACATCTCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTAAACCTGAAGGAGTCCGTGAACCTGACAAACCAGCTCCTGTGGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224600 TTAAACCTGAAGGAGTCCGTGAACCTGACAAACCAGCTCCTGTGGAGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AAAATCATCAAGGACCATTTATTGGAAGAATCCACATTTGCTCCATACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224650 AAAATCATCAAGGACCATTTATTGGAAGAATCCACATTTGCTCCATACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGATGATCTCTCTGAAGAACAGCGCAGGGCTCCTCAGATCACCACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224700 AGATGATCTCTCTGAAGAACAGCGCAGGGCTCCTCAGATCACCACCCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCAAAATCACACTGACGGAAATAGAACCTTCTGTTGAAACCACTACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224750 TCAAAATCACACTGACGGAAATAGAACCTTCTGTTGAAACCACTACCCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GAGAAGACCCCTGAGAAGCAAGATATATGTCTAAAGCCAAGTCCTGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224800 GAGAAGACCCCTGAGAAGCAAGATATATGTCTAAAGCCAAGTCCTGACAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AGTCCCCACTGTCACTGTCTCGGAGCCTGAAGACGACAGCCCAGGATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224850 AGTCCCCACTGTCACTGTCTCGGAGCCTGAAGACGACAGCCCAGGATCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TCACCCCTCCATCTTCTGGAACAG         AACCATCTGCTGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 224900 TCACCCCTCCATCTTCTGGAACAGGTA...CAGAACCATCTGCTGCAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TCCCAGGGGAAAGGCAGCATCTCCGAGGATGAGCTGATCACCGCCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242980 TCCCAGGGGAAAGGCAGCATCTCCGAGGATGAGCTGATCACCGCCATCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGAAGCAAAGGGATTATCGTATGAAACCGCCGAGAACCCACGGCCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243030 AGAAGCAAAGGGATTATCGTATGAAACCGCCGAGAACCCACGGCCGGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GCCAGCTGGCCGACAGGCCCGAGGTCAAGGCCAGGTCCGGACCGCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243080 GCCAGCTGGCCGACAGGCCCGAGGTCAAGGCCAGGTCCGGACCGCCAACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 ATCCCCAGCCCCCTGGACCACGAGGCCAGCAGCGCGGAGTCGGGGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243130 ATCCCCAGCCCCCTGGACCACGAGGCCAGCAGCGCGGAGTCGGGGGACTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 AGAGATCGAGCTGGTGTCCGAGGACCCCATGGCCGCGGAGGACGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243180 AGAGATCGAGCTGGTGTCCGAGGACCCCATGGCCGCGGAGGACGCGCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CCTCAGGCTATGTGAGCTTTGGCCACGTGGGCGGCCCGCCGCCCTCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243230 CCTCAGGCTATGTGAGCTTTGGCCACGTGGGCGGCCCGCCGCCCTCGCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GCCTCGCCATCCATCCAGTACAGCATCCTGAGGGAGGAGCGCGAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243280 GCCTCGCCATCCATCCAGTACAGCATCCTGAGGGAGGAGCGCGAGGCCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 GCTGGACAGCGAGCTCATCATCGAGTCGTGCGACGCCTCCTCGGCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243330 GCTGGACAGCGAGCTCATCATCGAGTCGTGCGACGCCTCCTCGGCCTCGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AGGAGAGCCCCAAGCGGGAGCAGGACTCACCCCCGATGAAGCCCAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243380 AGGAGAGCCCCAAGCGGGAGCAGGACTCACCCCCGATGAAGCCCAGCGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 CTGGATGCCATCCGGGAGGAGACTGGCGTCCGGGCCGAGGAGCGTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243430 CTGGATGCCATCCGGGAGGAGACTGGCGTCCGGGCCGAGGAGCGTGCGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 AAGCCGGCGGGGCCTGGCCGAGCCGGGTTCCTTCCTCGACTACCCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243480 AAGCCGGCGGGGCCTGGCCGAGCCGGGTTCCTTCCTCGACTACCCCTCAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CTGAGCCCCAGCCTGGCCCCGAGCTGCCCCCTGGAGACGGAGCCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243530 CTGAGCCCCAGCCTGGCCCCGAGCTGCCCCCTGGAGACGGAGCCCTGGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 CCTGAGACGCCCATGTTGCCACGGAAGCCTGAAGAAGACTCGAGTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243580 CCTGAGACGCCCATGTTGCCACGGAAGCCTGAAGAAGACTCGAGTTCCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 CCAAAGTCCTGCGGCCACAAAGGGCCCTGGGCCTCTAGGTCCTGGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243630 CCAAAGTCCTGCGGCCACAAAGGGCCCTGGGCCTCTAGGTCCTGGCGCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 CGCCCCCACTGCTGTTTCTCAATAAGCAAAAAG         CTATTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 243680 CGCCCCCACTGCTGTTTCTCAATAAGCAAAAAGGTA...CAGCTATTGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 CTGTTGTATTGGCGGGACATCAAGCAGACGGGCATCGTGTTTGGGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363147 CTGTTGTATTGGCGGGACATCAAGCAGACGGGCATCGTGTTTGGGAGTTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CCTGCTGCTGCTCTTCTCCCTGACCCAGTTCAGCGTGGTGAGCGTCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363197 CCTGCTGCTGCTCTTCTCCCTGACCCAGTTCAGCGTGGTGAGCGTCGTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 CCTACCTGGCCCTGGCCGCACTCTCAGCCACCATCAGTTTCCGCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363247 CCTACCTGGCCCTGGCCGCACTCTCAGCCACCATCAGTTTCCGCATCTAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 AAGTCTGTTTTACAAGCAGTGCAGAAAACCGACGAAGGCCACCCTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363297 AAGTCTGTTTTACAAGCAGTGCAGAAAACCGACGAAGGCCACCCTTTCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974          GGCCTACTTGGAGCTTGAGATCACCCTTTCTCAGGAGCAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363347 GTG...CAGGGCCTACTTGGAGCTTGAGATCACCCTTTCTCAGGAGCAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2015 TTCAGAAGTACACGGACTGCCTGCAGTTCTACGTGAACAGCACACTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 365166 TTCAGAAGTACACGGACTGCCTGCAGTTCTACGTGAACAGCACACTTAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2065 GAACTGAGGAGGCTCTTCCTTGTCCAGGACCTGGTGGATTCCTTAAAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 365216 GAACTGAGGAGGCTCTTCCTTGTCCAGGACCTGGTGGATTCCTTAAAAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2113        TTTGCAGTCCTGATGTGGCTCCTGACCTACGTTGGCGCTCTCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 365266 A...CAGTTTGCAGTCCTGATGTGGCTCCTGACCTACGTTGGCGCTCTCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 TCAATGGCCTGACCCTGCTGCTCATGG         CTGTGGTTTCAATG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 366753 TCAATGGCCTGACCCTGCTGCTCATGGGTA...CAGCTGTGGTTTCAATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 TTTACTCTACCTGTAGTGTATGTTAAGCACCAG         GCACAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 367387 TTTACTCTACCTGTAGTGTATGTTAAGCACCAGGTA...TAGGCACAGAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 TGACCAATATCTGGGACTTGTGAGGACTCACATAAATGCTGTTGTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 367516 TGACCAATATCTGGGACTTGTGAGGACTCACATAAATGCTGTTGTGGCAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 A         GATTCAGGCTAAAATCCCAGGCGCTAAGAGGCACGCTGAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 367566 AGTA...TAGGATTCAGGCTAAAATCCCAGGCGCTAAGAGGCATGCTGAG