seq1 = pF1KB4712.tfa, 741 bp
seq2 = pF1KB4712/gi568815591r_76229580.tfa (gi568815591r:76229580_76458808), 229229 bp

>pF1KB4712 741
>gi568815591r:76229580_76458808 (Chr7)

(complement)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-741  (128576-129229)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGACCGCGAGCAACTGGTGCAGAAAGCCCGGCTGGCCGAGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGACCGCGAGCAACTGGTGCAGAAAGCCCGGCTGGCCGAGCAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCGCTACGACGACATGGCCGCGGCCATGAAGAAC         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 GGAGCGCTACGACGACATGGCCGCGGCCATGAAGAACGTG...CAGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGAGCTGAATGAGCCACTGTCGAATGAGGAACGAAACCTTCTGTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128580 CAGAGCTGAATGAGCCACTGTCGAATGAGGAACGAAACCTTCTGTCTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCTACAAGAACGTTGTGGGGGCACGCCGCTCTTCCTGGAGGGTCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128630 GCCTACAAGAACGTTGTGGGGGCACGCCGCTCTTCCTGGAGGGTCATCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAGCATTGAGCAGAAGACATCTGCAGACGGCAATGAGAAGAAGATTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128680 TAGCATTGAGCAGAAGACATCTGCAGACGGCAATGAGAAGAAGATTGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGTCCGTGCGTACCGGGAGAAGATAGAGAAGGAGTTGGAGGCTGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128730 TGGTCCGTGCGTACCGGGAGAAGATAGAGAAGGAGTTGGAGGCTGTGTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGGATGTGCTGAGCCTGCTGGATAACTACCTGATCAAGAATTGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128780 CAGGATGTGCTGAGCCTGCTGGATAACTACCTGATCAAGAATTGCAGCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACCCAGTACGAGAGCAAAGTGTTCTACCTGAAGATGAAAGGGGACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128830 GACCCAGTACGAGAGCAAAGTGTTCTACCTGAAGATGAAAGGGGACTACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACCGCTACCTGGCTGAAGTGGCCACCGGAGAGAAAAGGGCGACGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128880 ACCGCTACCTGGCTGAAGTGGCCACCGGAGAGAAAAGGGCGACGGTGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGTCCTCCGAGAAGGCCTACAGCGAAGCCCACGAGATCAGCAAAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128930 GAGTCCTCCGAGAAGGCCTACAGCGAAGCCCACGAGATCAGCAAAGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATGCAGCCCACCCACCCCATCCGATTAGGCCTGGCTCTTAACTACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128980 CATGCAGCCCACCCACCCCATCCGATTAGGCCTGGCTCTTAACTACTCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCTTCTACTATGAGATCCAGAACGCCCCAGAGCAAGCGTGCCACTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129030 TCTTCTACTATGAGATCCAGAACGCCCCAGAGCAAGCGTGCCACTTGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAGACCGCGTTCGACGACGCCATCGCCGAGCTTGACACCCTCAACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129080 AAGACCGCGTTCGACGACGCCATCGCCGAGCTTGACACCCTCAACGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTCCTACAAGGACTCCACGCTCATCATGCAGCTCCTCCGCGACAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129130 CTCCTACAAGGACTCCACGCTCATCATGCAGCTCCTCCGCGACAACCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CGCTCTGGACGAGCGACCAGCAGGACGACGATGGCGGCGAAGGCAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129180 CGCTCTGGACGAGCGACCAGCAGGACGACGATGGCGGCGAAGGCAACAAT