seq1 = pF1KB4690.tfa, 2685 bp
seq2 = pF1KB4690/gi568815587f_65952385.tfa (gi568815587f:65952385_66168742), 216358 bp

>pF1KB4690 2685
>gi568815587f:65952385_66168742 (Chr11)

1-133  (100001-100133)   100% ->
134-180  (100289-100335)   100% ->
181-258  (100643-100720)   100% ->
259-498  (102692-102931)   100% ->
499-549  (103151-103201)   100% ->
550-667  (104454-104571)   100% ->
668-777  (104882-104991)   100% ->
778-874  (105670-105766)   100% ->
875-966  (105930-106021)   100% ->
967-1182  (106446-106661)   100% ->
1183-1320  (106817-106954)   100% ->
1321-1401  (107131-107211)   100% ->
1402-1629  (107398-107625)   100% ->
1630-1779  (108198-108347)   100% ->
1780-1869  (109302-109391)   100% ->
1870-1977  (109507-109614)   100% ->
1978-2085  (110625-110732)   100% ->
2086-2228  (111016-111158)   100% ->
2229-2330  (111244-111345)   100% ->
2331-2430  (115562-115661)   100% ->
2431-2616  (115764-115949)   100% ->
2617-2685  (116290-116358)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACGGAGCATCCCGAGCCTCCCAAAGCAGAATTGCAGCTGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACGGAGCATCCCGAGCCTCCCAAAGCAGAATTGCAGCTGCCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCCACCTCCAGGCCACTATGGCGCCTGGGCTGCCCAGGAGCTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGCCACCTCCAGGCCACTATGGCGCCTGGGCTGCCCAGGAGCTTCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAGTTGGCAGAGATCGGAGCTCCGATCCAGG         GTAATCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100101 CCAAGTTGGCAGAGATCGGAGCTCCGATCCAGGGTG...CAGGTAATCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGAGCTGGTGGAGCGGCTGCAGAGCTACACCCGCCAG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100297 GAGGAGCTGGTGGAGCGGCTGCAGAGCTACACCCGCCAGGTA...CAGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGGCATCGTGCTGAATCGGCCGGTTTTGAGAGGGGAAGATGGGGACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100645 TGGCATCGTGCTGAATCGGCCGGTTTTGAGAGGGGAAGATGGGGACAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGCTCCACCTCCCATGTCGGCACAG         CTCCCTGGAATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100695 CCGCTCCACCTCCCATGTCGGCACAGGTA...CAGCTCCCTGGAATTCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATGCCACCACCACCTTTGGGACTCCCCCCTCTGCAGCCTCCTCCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102707 ATGCCACCACCACCTTTGGGACTCCCCCCTCTGCAGCCTCCTCCGCCACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCACCACCTCCACCAGGCCTTGGCCTTGGCTTTCCTATGGCCCACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102757 CCCACCACCTCCACCAGGCCTTGGCCTTGGCTTTCCTATGGCCCACCCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAAATTTGGGGCCCCCGCCTCCTCTCCGTGTGGGTGAGCCAGTGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102807 CAAATTTGGGGCCCCCGCCTCCTCTCCGTGTGGGTGAGCCAGTGGCACTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCAGAGGAGGAGCGGCTGAAGTTGGCTCAGCAGCAGGCGGCATTGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102857 TCAGAGGAGGAGCGGCTGAAGTTGGCTCAGCAGCAGGCGGCATTGCTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCAGCAGGAGGAGCGTGCCAAGCAG         CAGGGAGATCATTCGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102907 GCAGCAGGAGGAGCGTGCCAAGCAGGTA...AAGCAGGGAGATCATTCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGAAGGAACATGAGCTCTTGGAGCAGCAGAAGCGG         GCAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103167 TGAAGGAACATGAGCTCTTGGAGCAGCAGAAGCGGGTA...TAGGCAGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTGTTACTGGAGCAGGAACGACAGCAGGAGATTGCCAAGATGGGCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104460 GTGTTACTGGAGCAGGAACGACAGCAGGAGATTGCCAAGATGGGCACCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGTCCCTCGGCCCCCACAAGACATGGGCCAGATTGGTGTGCGCACTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104510 AGTCCCTCGGCCCCCACAAGACATGGGCCAGATTGGTGTGCGCACTCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGGTCCTCGAG         TAGCTGCTCCAGTGGGCCCAGTGGGCCCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104560 TGGGTCCTCGAGGTG...TAGTAGCTGCTCCAGTGGGCCCAGTGGGCCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACTCCTACAGTTTTGCCCATGGGAGCCCCTGTTCCCCGGCCTCGTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104911 ACTCCTACAGTTTTGCCCATGGGAGCCCCTGTTCCCCGGCCTCGTGGTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCCACCGCCCCCTGGAGATGAGAACAGAGAG         ATGGATGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104961 CCCACCGCCCCCTGGAGATGAGAACAGAGAGGTG...CAGATGGATGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCTCTGTGGGCCCCAAGATCCCCCAGGCTTTGGAGAAGATCCTGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105680 CCTCTGTGGGCCCCAAGATCCCCCAGGCTTTGGAGAAGATCCTGCAGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAGGAGAGCCGCCAGGAAGAGATGAATTCTCAGCAGG         AGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105730 AAGGAGAGCCGCCAGGAAGAGATGAATTCTCAGCAGGGTG...CAGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGAGGAAATGGAAACAGATGCTCGCTCGTCCCTGGGCCAGTCAGCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105934 AGAGGAAATGGAAACAGATGCTCGCTCGTCCCTGGGCCAGTCAGCGTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGACTGAGGAGGACACAGTGTCCGTATCTAAAAAGGAG         AAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105984 AGACTGAGGAGGACACAGTGTCCGTATCTAAAAAGGAGGTA...CAGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AACCGGAAGCGTAGGAACCGAAAGAAGAAGAAAAAGCCCCAGCGGGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106449 AACCGGAAGCGTAGGAACCGAAAGAAGAAGAAAAAGCCCCAGCGGGTGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGGGGTGTCCTCTGAGAGCTCTGGGGACCGGGAGAAAGACTCAACCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106499 AGGGGTGTCCTCTGAGAGCTCTGGGGACCGGGAGAAAGACTCAACCCGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CCCGTGGCTCTGATTCCCCAGCAGCTGATGTTGAGATTGAGTATGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106549 CCCGTGGCTCTGATTCCCCAGCAGCTGATGTTGAGATTGAGTATGTGACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GAAGAACCTGAAATTTACGAGCCCAACTTTATCTTCTTTAAGAGGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106599 GAAGAACCTGAAATTTACGAGCCCAACTTTATCTTCTTTAAGAGGATCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGAGGCTTTTAAG         CTCACTGATGATGTGAAGAAGGAGAAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 106649 TGAGGCTTTTAAGGTA...TAGCTCACTGATGATGTGAAGAAGGAGAAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGAAGGAGCCAGAGAAACTTGACAAACTGGAGAACTCTGCAGCCCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106845 AGAAGGAGCCAGAGAAACTTGACAAACTGGAGAACTCTGCAGCCCCCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AAGAAGGGATTTGAAGAGGAGCACAAGGACAGTGATGATGACAGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106895 AAGAAGGGATTTGAAGAGGAGCACAAGGACAGTGATGATGACAGCAGTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGACGAGCAG         GAAAAGAAGCCAGAAGCCCCCAAGCTGTCCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106945 TGACGAGCAGGTC...TAGGAAAAGAAGCCAGAAGCCCCCAAGCTGTCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGAAGAAGTTGCGCCGAATGAACCGCTTCACTGTGGCTGAACTCAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107162 AGAAGAAGTTGCGCCGAATGAACCGCTTCACTGTGGCTGAACTCAAGCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402          CTGGTGGCTCGGCCCGATGTCGTGGAGATGCACGATGTGAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107212 GTA...CAGCTGGTGGCTCGGCCCGATGTCGTGGAGATGCACGATGTGAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 AGCGCAGGACCCTAAGCTCTTGGTTCACCTCAAGGCCACTCGGAACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107439 AGCGCAGGACCCTAAGCTCTTGGTTCACCTCAAGGCCACTCGGAACTCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGCCTGTGCCACGCCACTGGTGTTTTAAGCGCAAATACCTGCAGGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107489 TGCCTGTGCCACGCCACTGGTGTTTTAAGCGCAAATACCTGCAGGGCAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CGGGGCATTGAGAAGCCCCCCTTCGAGCTGCCAGACTTCATCAAACGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107539 CGGGGCATTGAGAAGCCCCCCTTCGAGCTGCCAGACTTCATCAAACGCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AGGCATCCAGGAGATGCGAGAGGCCCTGCAGGAGAAG         GAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 107589 AGGCATCCAGGAGATGCGAGAGGCCCTGCAGGAGAAGGTG...CAGGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AACAGAAGACCATGAAGTCAAAAATGCGAGAGAAAGTTCGGCCTAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108202 AACAGAAGACCATGAAGTCAAAAATGCGAGAGAAAGTTCGGCCTAAGATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GGCAAAATTGACATCGACTACCAGAAACTGCATGATGCCTTCTTCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108252 GGCAAAATTGACATCGACTACCAGAAACTGCATGATGCCTTCTTCAAGTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GCAGACCAAGCCAAAGCTGACCATCCATGGGGACCTGTACTATGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 108302 GCAGACCAAGCCAAAGCTGACCATCCATGGGGACCTGTACTATGAGGTT.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1780      GGGAAGGAGTTCGAGACACGACTGAAGGAGAAGAAGCCAGGAGAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108352 ..CAGGGGAAGGAGTTCGAGACACGACTGAAGGAGAAGAAGCCAGGAGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CTGTCTGATGAGCTAAGGATTTCCTTGGGGATGCCAGTAGGACCA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 109347 CTGTCTGATGAGCTAAGGATTTCCTTGGGGATGCCAGTAGGACCAGTG..

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870     AATGCCCACAAGGTCCCTCCCCCATGGCTGATTGCCATGCAGCGAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109397 .CAGAATGCCCACAAGGTCCCTCCCCCATGGCTGATTGCCATGCAGCGAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ATGGACCACCCCCATCGTATCCCAACCTGAAAATCCCTGGGCTGAACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109553 ATGGACCACCCCCATCGTATCCCAACCTGAAAATCCCTGGGCTGAACTCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CCCATCCCTGAG         AGCTGTTCCTTTGGGTACCATGCTGGTGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 109603 CCCATCCCTGAGGTG...CAGAGCTGTTCCTTTGGGTACCATGCTGGTGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CTGGGGCAAACCTCCAGTGGATGAGACTGGGAAACCGCTCTATGGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110654 CTGGGGCAAACCTCCAGTGGATGAGACTGGGAAACCGCTCTATGGGGACG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TGTTTGGAACCAATGCTGCTGAATTTCAG         ACCAAGACTGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110704 TGTTTGGAACCAATGCTGCTGAATTTCAGGTA...CAGACCAAGACTGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GAAGAAGAGATTGATCGGACCCCTTGGGGGGAACTGGAACCATCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111028 GAAGAAGAGATTGATCGGACCCCTTGGGGGGAACTGGAACCATCTGATGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 AGAATCCTCAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAAGTGATGAAGACAAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111078 AGAATCCTCAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAAGTGATGAAGACAAACCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 ATGAGACAGGCTTTATTACCCCTGCAGACAG         TGGCCTTATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 111128 ATGAGACAGGCTTTATTACCCCTGCAGACAGGTG...CAGTGGCCTTATC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 ACTCCTGGAGGCTTTTCATCAGTGCCTGCTGGAATGGAGACCCCTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111254 ACTCCTGGAGGCTTTTCATCAGTGCCTGCTGGAATGGAGACCCCTGAACT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 CATTGAGCTGAGGAAGAAGAAGATTGAGGAGGCGATGGACGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 111304 CATTGAGCTGAGGAAGAAGAAGATTGAGGAGGCGATGGACGGGTA...CA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2331  AAGTGAGACACCTCAGCTCTTCACTGTGTTGCCAGAGAAGAGAACAGCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115561 GAAGTGAGACACCTCAGCTCTTCACTGTGTTGCCAGAGAAGAGAACAGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 ACTGTTGGAGGGGCCATGATGGGATCAACCCACATTTATGACATGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115611 ACTGTTGGAGGGGCCATGATGGGATCAACCCACATTTATGACATGTCCAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 G         GTTATGAGCCGGAAGGGCCCGGCTCCTGAGCTGCAAGGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115661 GGTG...CAGGTTATGAGCCGGAAGGGCCCGGCTCCTGAGCTGCAAGGTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 TGGAAGTGGCGCTGGCGCCTGAAGAGTTGGAGCTGGATCCTATGGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115804 TGGAAGTGGCGCTGGCGCCTGAAGAGTTGGAGCTGGATCCTATGGCCATG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 ACCCAGAAGTATGAGGAGCATGTGCGGGAGCAGCAGGCTCAAGTAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115854 ACCCAGAAGTATGAGGAGCATGTGCGGGAGCAGCAGGCTCAAGTAGAGAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 GGAGGACTTCAGTGACATGGTGGCTGAGCACGCTGCCAAACAGAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 115904 GGAGGACTTCAGTGACATGGTGGCTGAGCACGCTGCCAAACAGAAGGTA.

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2617      CAAAAAAAACGGAAAGCTCAGCCCCAGGACAGCCGTGGGGGCAGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115954 ..CAGCAAAAAAAACGGAAAGCTCAGCCCCAGGACAGCCGTGGGGGCAGC

   2850     .    :    .    :
   2662 AAGAAATATAAGGAGTTCAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||
 116335 AAGAAATATAAGGAGTTCAAGTTT