seq1 = pF1KB4675.tfa, 1482 bp
seq2 = pF1KB4675/gi568815580f_63307.tfa (gi568815580f:63307_311281), 247975 bp

>pF1KB4675 1482
>gi568815580f:63307_311281 (Chr18)

1-16  (95393-95408)   100% ->
17-162  (100002-100147)   100% ->
163-195  (103481-103513)   100% ->
196-300  (115627-115731)   100% ->
301-404  (116930-117033)   100% ->
405-463  (129536-129594)   100% ->
464-594  (133331-133461)   100% ->
595-675  (134310-134390)   100% ->
676-761  (134741-134826)   100% ->
762-876  (135896-136010)   100% ->
877-942  (139574-139639)   100% ->
943-1035  (139792-139884)   100% ->
1036-1164  (141258-141386)   100% ->
1165-1225  (146665-146725)   100% ->
1226-1333  (147080-147187)   100% ->
1334-1482  (147827-147975)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCTCTACTCCG         TTACTGTAAAATGGGGAAAGGAGAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  95393 ATGCCGCTCTACTCCGGTG...CAGTTACTGTAAAATGGGGAAAGGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ATTTGAAGGTGTAGAATTGAATACAGATGAACCTCCAATGGTATTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100027 ATTTGAAGGTGTAGAATTGAATACAGATGAACCTCCAATGGTATTCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCAGCTGTTTGCGTTGACTGGAGTCCAGCCTGCCAGACAGAAAGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100077 CTCAGCTGTTTGCGTTGACTGGAGTCCAGCCTGCCAGACAGAAAGTTATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGAAAGGAGGAACGCTAAAG         GATGATGATTGGGGAAACAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100127 GTGAAAGGAGGAACGCTAAAGGTA...CAGGATGATGATTGGGGAAACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAAATAAAAAAT         GGAATGACTCTACTAATGATGGGGTCAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103501 CAAAATAAAAAATGTA...CAGGGAATGACTCTACTAATGATGGGGTCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CAGATGCTCTTCCAGAAGAACCCTCAGCCAAAACTGTCTTCGTAGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115655 CAGATGCTCTTCCAGAAGAACCCTCAGCCAAAACTGTCTTCGTAGAAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATGACAGAAGAACAGTTAGCATCTGCT         ATGGAGTTACCATG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 115705 ATGACAGAAGAACAGTTAGCATCTGCTGTA...TAGATGGAGTTACCATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGGATTGACAAACCTTGGTAACACTTGTTACATGAATGCCACAGTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116944 TGGATTGACAAACCTTGGTAACACTTGTTACATGAATGCCACAGTTCAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GTATTCGTTCTGTGCCTGAACTCAAAGATGCCCTTAAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 116994 GTATTCGTTCTGTGCCTGAACTCAAAGATGCCCTTAAAAGGTA...TAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TATGCAGGTGCCTTGAGAGCTTCAGGGGAAATGGCTTCAGCGCAGTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129537 TATGCAGGTGCCTTGAGAGCTTCAGGGGAAATGGCTTCAGCGCAGTATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TACTGCAG         CCCTTAGAGATTTGTTTGATTCCATGGATAAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 129587 TACTGCAGGTT...AAGCCCTTAGAGATTTGTTTGATTCCATGGATAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 CTTCTTCCAGTATTCCACCTATTATTCTACTGCAGTTTTTGCACATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133364 CTTCTTCCAGTATTCCACCTATTATTCTACTGCAGTTTTTGCACATGGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TTCCCACAGTTTGCCGAGAAAGGTGAACAAGGACAGTATCTTCAACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 133414 TTCCCACAGTTTGCCGAGAAAGGTGAACAAGGACAGTATCTTCAACAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    595        GATGCTAATGAATGTTGGATACAAATGATGCGAGTATTGCAAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133464 A...CAGGATGCTAATGAATGTTGGATACAAATGATGCGAGTATTGCAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AGAAATTGGAAGCAATAGAGGATGATTCTGTTAAAGAG         ACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 134353 AGAAATTGGAAGCAATAGAGGATGATTCTGTTAAAGAGGTA...CAGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GACTCCTCATCTGCATCGGCAGCGACACCTTCTAAAAAGAAAAGTTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134744 GACTCCTCATCTGCATCGGCAGCGACACCTTCTAAAAAGAAAAGTTTAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CGATCAGTTCTTCGGTGTTGAGTTTGAAACTAC         CATGAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 134794 CGATCAGTTCTTCGGTGTTGAGTTTGAAACTACGTA...AAGCATGAAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 GTACAGAATCTGAAGAAGAAGAAGTCACCAAAGGAAAGGAAAATCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135904 GTACAGAATCTGAAGAAGAAGAAGTCACCAAAGGAAAGGAAAATCAACTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 CAGCTTAGCTGTTTTATCAATCAGGAAGTCAAGTATCTTTTTACAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135954 CAGCTTAGCTGTTTTATCAATCAGGAAGTCAAGTATCTTTTTACAGGACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TAAATTG         CGACTTCAGGAAGAAATCACCAAACAGTCTCCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136004 TAAATTGGTA...TAGCGACTTCAGGAAGAAATCACCAAACAGTCTCCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 CGTTGCAAAGAAATGCCTTGTATATCAAATCT         TCCAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 139608 CGTTGCAAAGAAATGCCTTGTATATCAAATCTGTA...CAGTCCAAGATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 AGCCGGCTGCCTGCTTACTTGACCATTCAGATGGTTCGATTTTTTTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139801 AGCCGGCTGCCTGCTTACTTGACCATTCAGATGGTTCGATTTTTTTATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 AGAGAAGGAATCTGTGAATGCCAAAGTTCTTAAG         GATGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 139851 AGAGAAGGAATCTGTGAATGCCAAAGTTCTTAAGGTT...TAGGATGTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 AATTTCCTCTTATGTTGGATATGTATGAACTGTGTACACCAGAACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141265 AATTTCCTCTTATGTTGGATATGTATGAACTGTGTACACCAGAACTTCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 GAGAAAATGGTGTCTTTTCGATCCAAATTCAAGGATCTAGAAGATAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141315 GAGAAAATGGTGTCTTTTCGATCCAAATTCAAGGATCTAGAAGATAAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 AGTGAATCAGCAGCCAAATACA         AGTGACAAAAAGAGTAGTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 141365 AGTGAATCAGCAGCCAAATACAGTA...CAGAGTGACAAAAAGAGTAGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 CCCAGAAAGAAGTTAAGTATGAACCCTTTTCTTTTGCTGATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 146684 CCCAGAAAGAAGTTAAGTATGAACCCTTTTCTTTTGCTGATGGTA...TA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1226  ATATTGGCTCCAATAATTGTGGATACTATGACTTACAAGCAGTACTAAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147079 GATATTGGCTCCAATAATTGTGGATACTATGACTTACAAGCAGTACTAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 ACACCAGGGAAGGTCTAGTTCTTCAGGTCATTATGTATCATGGGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147129 ACACCAGGGAAGGTCTAGTTCTTCAGGTCATTATGTATCATGGGTGAAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 GGAAACAAG         ATGAATGGATTAAGTTTGATGATGACAAAGTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 147179 GGAAACAAGGTA...TAGATGAATGGATTAAGTTTGATGATGACAAAGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 AGCATCGTAACACCAGAAGATATCTTACGGCTTTCTGGTGGTGGAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147859 AGCATCGTAACACCAGAAGATATCTTACGGCTTTCTGGTGGTGGAGACTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 GCATATCGCTTACGTTCTACTCTATGGGCCTCGCAGAGTTGAAATAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147909 GCATATCGCTTACGTTCTACTCTATGGGCCTCGCAGAGTTGAAATAATGG

   1600     .    :    .
   1466 AAGAGGAAAGTGAACAG
        |||||||||||||||||
 147959 AAGAGGAAAGTGAACAG