seq1 = pF1KB4670.tfa, 1203 bp
seq2 = pF1KB4670/gi568815583r_36794757.tfa (gi568815583r:36794757_37198200), 403444 bp

>pF1KB4670 1203
>gi568815583r:36794757_37198200 (Chr15)

(complement)

12-245  (100001-100234)   100% ->
246-387  (101771-101912)   100% ->
388-438  (102587-102637)   100% ->
439-489  (103624-103674)   100% ->
490-639  (104471-104620)   100% ->
640-754  (114316-114430)   100% ->
755-900  (161242-161387)   100% ->
901-977  (247801-247877)   100% ->
978-1036  (301515-301573)   100% ->
1037-1147  (302940-303050)   100% ->
1148-1203  (303389-303444)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     12 GTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     62 CTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    112 CACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    162 CGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    212 ACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGG         GCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100201 ACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGTA...TAGGCACCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    253 TTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101778 TTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    303 CACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101828 CACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    353 CCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAG         GTTCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101878 CCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTC...CAGGTTCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    394 GCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102593 GCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGGTA..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    439     ATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102643 .CAGATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    485 AAAAG         GTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103670 AAAAGGTA...TAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    526 ATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104507 ATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    576 AGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104557 AGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    626 ATCTCGCTGACCAT         AACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104607 ATCTCGCTGACCATGTA...CAGAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    667 GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114343 GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    717 CCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAG         GGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 114393 CCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGTA...TAGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    758 ATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161245 ATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    808 CCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161295 CCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    858 AGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 161345 AGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACAGTA...T

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901   CATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247799 AGCATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    949 GGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTG         GTTTATTAATGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 247849 GGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTG...CAGGTTTATTAATGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    990 CAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 301527 CAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1037       GTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301577 ...CAGGTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1081 CCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 302984 CCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1131 GGGGATCCGGCCTGCAG         GACCTATGAGTGGAATGGGCATGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 303034 GGGGATCCGGCCTGCAGGTA...TAGGACCTATGAGTGGAATGGGCATGA

   1250     .    :    .    :    .    :
   1172 ATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 303413 ATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACATG