seq1 = pF1KB4653.tfa, 600 bp
seq2 = pF1KB4653/gi568815596f_25934609.tfa (gi568815596f:25934609_26235018), 300410 bp

>pF1KB4653 600
>gi568815596f:25934609_26235018 (Chr2)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-188  (164054-164114)   100% ->
189-327  (175160-175298)   100% ->
328-417  (192536-192625)   100% ->
418-519  (193242-193343)   100% ->
520-600  (200330-200410)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAAGAAGACGTACGACCTGCTTTTCAAGCTGCTCCTGATCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAAGAAGACGTACGACCTGCTTTTCAAGCTGCTCCTGATCGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCCGGAGTGGGGAAGACCTGCGTCCTTTTTCGTTTTTCGGATGATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCCGGAGTGGGGAAGACCTGCGTCCTTTTTCGTTTTTCGGATGATGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAATACTACCTTTATTTCCACCATAG         GAATAGACTTCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 TCAATACTACCTTTATTTCCACCATAGGTA...TAGGAATAGACTTCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCAAAACAGTTGAATTACAAGGAAAGAAGATCAAGCTACAGATATG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 164068 ATCAAAACAGTTGAATTACAAGGAAAGAAGATCAAGCTACAGATATGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       GGATACAGCAGGCCAGGAGCGATTTCACACCATCACAACCTCCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164118 ...CAGGGATACAGCAGGCCAGGAGCGATTTCACACCATCACAACCTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTACAGAGGCGCAATGGGTATCATGCTAGTATATGACATCACCAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175204 ACTACAGAGGCGCAATGGGTATCATGCTAGTATATGACATCACCAATGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAAGTTTTGAAAACATCAGCAAATGGCTTAGAAACATAGATGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 175254 AAAAGTTTTGAAAACATCAGCAAATGGCTTAGAAACATAGATGAGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     CATGCCAATGAAGATGTGGAAAGAATGTTACTAGGAAACAAGTGTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175304 .TAGCATGCCAATGAAGATGTGGAAAGAATGTTACTAGGAAACAAGTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATATGGACGACAAAAGAGTTGTACCTAAAGGAAAAGGAGAACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 192582 ATATGGACGACAAAAGAGTTGTACCTAAAGGAAAAGGAGAACAGGTA...

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    418    ATTGCAAGGGAGCATGGTATTAGGTTTTTTGAGACTAGTGCAAAAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193239 TAGATTGCAAGGGAGCATGGTATTAGGTTTTTTGAGACTAGTGCAAAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAATATAAACATCGAAAAGGCGTTCCTCACGTTAGCTGAAGATATCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193289 AAATATAAACATCGAAAAGGCGTTCCTCACGTTAGCTGAAGATATCCTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAAAG         ACCCCTGTAAAAGAGCCCAACAGTGAAAATGTAGAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193339 GAAAGGTA...CAGACCCCTGTAAAAGAGCCCAACAGTGAAAATGTAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    556 ATCAGCAGTGGAGGAGGCGTGACAGGCTGGAAGAGCAAATGCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200366 ATCAGCAGTGGAGGAGGCGTGACAGGCTGGAAGAGCAAATGCTGC