seq1 = pF1KB4609.tfa, 834 bp
seq2 = pF1KB4609/gi568815576r_37082191.tfa (gi568815576r:37082191_37288213), 206023 bp

>pF1KB4609 834
>gi568815576r:37082191_37288213 (Chr22)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-289  (102759-102996)   99% ->
290-834  (105479-106023)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTGGCTCAGGGTCCGTGAGTCGCCTGGGGAGGCCACAGGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTGGCTCAGGGTCCGTGAGTCGCCTGGGGAGGCCACAGGACACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         GTCACCATGGTGACAGCCGCCCTGGGTCCCGTCTGGGCAG
        |>>>...>>>|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTG...CAGGTCACCATGGGGACAGCCGCCCTGGGTCCCGTCTGGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCTCCTGCTCTTTCTCCTGATGTGTGAGATCCGTATGGTGGAGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 102799 CGCTCCTGCTCTTTCTCCTGATGTGTGAGATCCCTATGGTGGAGCTCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGACAGAGCTGTGGCCAGCGGCTGCCAACGGTGCTGTGACTCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102849 TTTGACAGAGCTGTGGCCAGCGGCTGCCAACGGTGCTGTGACTCTGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCCCTGGATCCTGCCCATGTATCCTCAGCCTCTTCCTCCGGCCGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102899 CCCCCTGGATCCTGCCCATGTATCCTCAGCCTCTTCCTCCGGCCGCCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACGCCCTGCCTGAGATCAGACCCTACATTAATATCACCATCCTGAAGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102949 ACGCCCTGCCTGAGATCAGACCCTACATTAATATCACCATCCTGAAGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290        GTGACAAAGGGGACCCAGGCCCAATGGGCCTGCCAGGGTACAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102999 G...CAGGTGACAAAGGGGACCCAGGCCCAATGGGCCTGCCAGGGTACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGGCAGGGAGGGTCCCCAAGGGGAGCCTGGCCCTCAGGGCAGCAAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105522 GGGCAGGGAGGGTCCCCAAGGGGAGCCTGGCCCTCAGGGCAGCAAGGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAAGGGGGAGATGGGCAGCCCCGGCGCCCCGTGCCAGAAGCGCTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105572 ACAAGGGGGAGATGGGCAGCCCCGGCGCCCCGTGCCAGAAGCGCTTCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCTTCTCAGTGGGCCGCAAGACGGCCCTGCACAGCGGCGAGGACTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105622 GCCTTCTCAGTGGGCCGCAAGACGGCCCTGCACAGCGGCGAGGACTTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GACGCTGCTCTTCGAAAGGGTCTTTGTGAACCTTGATGGGTGCTTTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105672 GACGCTGCTCTTCGAAAGGGTCTTTGTGAACCTTGATGGGTGCTTTGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGCGACCGGCCAGTTTGCTGCTCCCCTGCGTGGCATCTACTTCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105722 TGGCGACCGGCCAGTTTGCTGCTCCCCTGCGTGGCATCTACTTCTTCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCAATGTGCACAGCTGGAATTACAAGGAGACGTACGTGCACATTATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105772 CTCAATGTGCACAGCTGGAATTACAAGGAGACGTACGTGCACATTATGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TAACCAGAAAGAGGCTGTCATCCTGTACGCGCAGCCCAGCGAGCGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105822 TAACCAGAAAGAGGCTGTCATCCTGTACGCGCAGCCCAGCGAGCGCAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCATGCAGAGCCAGAGTGTGATGCTGGACCTGGCCTACGGGGACCGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105872 TCATGCAGAGCCAGAGTGTGATGCTGGACCTGGCCTACGGGGACCGCGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TGGGTGCGGCTCTTCAAGCGCCAGCGCGAGAACGCCATCTACAGCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105922 TGGGTGCGGCTCTTCAAGCGCCAGCGCGAGAACGCCATCTACAGCAACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CTTCGACACCTACATCACCTTCAGCGGCCACCTCATCAAGGCCGAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105972 CTTCGACACCTACATCACCTTCAGCGGCCACCTCATCAAGGCCGAGGACG

    850 
    833 AC
        ||
 106022 AC