seq1 = pF1KB4596.tfa, 2751 bp
seq2 = pF1KB4596/gi568815588f_69218948.tfa (gi568815588f:69218948_69501132), 282185 bp

>pF1KB4596 2751
>gi568815588f:69218948_69501132 (Chr10)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-226  (124880-125042)   100% ->
227-375  (140950-141098)   100% ->
376-495  (145836-145955)   100% ->
496-591  (149589-149684)   100% ->
592-691  (150290-150389)   100% ->
692-875  (150494-150677)   100% ->
876-1031  (157987-158142)   100% ->
1032-1265  (160915-161148)   100% ->
1266-1570  (163540-163844)   99% ->
1571-1719  (165386-165534)   100% ->
1720-1839  (165849-165968)   100% ->
1840-1935  (167376-167471)   100% ->
1936-2035  (170250-170349)   100% ->
2036-2219  (173178-173361)   100% ->
2220-2375  (176003-176158)   100% ->
2376-2609  (179648-179881)   100% ->
2610-2751  (182044-182185)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCGCCGCGCAGCTCCTGGCCTATTACTTCACGGAGCTGAAGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCGCCGCGCAGCTCCTGGCCTATTACTTCACGGAGCTGAAGGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGTCAAAAAG         ATTGACAAGTATCTCTATGCCATGCGGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGTCAAAAAGGTG...CAGATTGACAAGTATCTCTATGCCATGCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCTCCGATGAAACTCTCATAGATATCATGACTCGCTTCAGGAAGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124908 TCTCCGATGAAACTCTCATAGATATCATGACTCGCTTCAGGAAGGAGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGAATGGCCTCTCCCGGGATTTTAATCCAACAGCCACAGTCAAGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124958 AAGAATGGCCTCTCCCGGGATTTTAATCCAACAGCCACAGTCAAGATGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCAACATTCGTAAGGTCCATTCCTGATGGCTCTG         AAAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 125008 GCCAACATTCGTAAGGTCCATTCCTGATGGCTCTGGTA...CAGAAAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAGATTTCATTGCCCTGGATCTTGGTGGGTCTTCCTTTCGAATTCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140956 GAGATTTCATTGCCCTGGATCTTGGTGGGTCTTCCTTTCGAATTCTGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGCAAGTGAATCATGAGAAAAACCAGAATGTTCACATGGAGTCCGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141006 GTGCAAGTGAATCATGAGAAAAACCAGAATGTTCACATGGAGTCCGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTATGACACCCCAGAGAACATCGTGCACGGCAGTGGAAGCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 141056 TTATGACACCCCAGAGAACATCGTGCACGGCAGTGGAAGCCAGGTG...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   CTTTTTGATCATGTTGCTGAGTGCCTGGGAGATTTCATGGAGAAAAGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145834 AGCTTTTTGATCATGTTGCTGAGTGCCTGGGAGATTTCATGGAGAAAAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGATCAAGGACAAGAAGTTACCTGTGGGATTCACGTTTTCTTTTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145884 AAGATCAAGGACAAGAAGTTACCTGTGGGATTCACGTTTTCTTTTCCTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCAACAATCCAAAATAGATGAG         GCCATCCTGATCACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 145934 CCAACAATCCAAAATAGATGAGGTA...CAGGCCATCCTGATCACCTGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAAAGCGATTTAAAGCGAGCGGAGTGGAAGGAGCAGATGTGGTCAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149608 CAAAGCGATTTAAAGCGAGCGGAGTGGAAGGAGCAGATGTGGTCAAACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTTAACAAAGCCATCAAAAAGCGAGGG         GACTATGATGCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 149658 CTTAACAAAGCCATCAAAAAGCGAGGGGTA...CAGGACTATGATGCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CATCGTAGCTGTGGTGAATGACACAGTGGGCACCATGATGACCTGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150304 CATCGTAGCTGTGGTGAATGACACAGTGGGCACCATGATGACCTGTGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGACGACCAGCACTGTGAAGTCGGCCTGATCATCG         GCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 150354 ATGACGACCAGCACTGTGAAGTCGGCCTGATCATCGGTA...CAGGCACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGCACCAATGCTTGCTACATGGAGGAACTGAGGCACATTGATCTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150499 GGCACCAATGCTTGCTACATGGAGGAACTGAGGCACATTGATCTGGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGGAGACGAGGGGAGGATGTGTATCAATACAGAATGGGGAGCCTTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150549 AGGAGACGAGGGGAGGATGTGTATCAATACAGAATGGGGAGCCTTTGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACGATGGATCATTAGAAGACATCCGGACAGAGTTTGACAGGGAGATAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150599 ACGATGGATCATTAGAAGACATCCGGACAGAGTTTGACAGGGAGATAGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CGGGGATCCCTCAACCCTGGAAAACAGCT         GTTTGAGAAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 150649 CGGGGATCCCTCAACCCTGGAAAACAGCTGTG...CAGGTTTGAGAAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGTCAGTGGCATGTACTTGGGAGAGCTGGTTCGACTGATCCTAGTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157999 GGTCAGTGGCATGTACTTGGGAGAGCTGGTTCGACTGATCCTAGTCAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGGCCAAGGAGGGCCTCTTATTTGAAGGGCGGATCACCCCGGAGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158049 TGGCCAAGGAGGGCCTCTTATTTGAAGGGCGGATCACCCCGGAGCTGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACCCGAGGGAAGTTTAACACCAGTGATGTGTCAGCCATCGAAAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 158099 ACCCGAGGGAAGTTTAACACCAGTGATGTGTCAGCCATCGAAAAGTA...

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1032    GAATAAGGAAGGCCTCCACAATGCCAAAGAAATCCTGACCCGCCTGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160912 CAGGAATAAGGAAGGCCTCCACAATGCCAAAGAAATCCTGACCCGCCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GAGTGGAGCCGTCCGATGATGACTGTGTCTCAGTCCAGCACGTTTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160962 GAGTGGAGCCGTCCGATGATGACTGTGTCTCAGTCCAGCACGTTTGCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATTGTCTCATTTCGCTCAGCCAACTTGGTGGCTGCCACACTGGGCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161012 ATTGTCTCATTTCGCTCAGCCAACTTGGTGGCTGCCACACTGGGCGCCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CTTGAACCGCCTGCGTGATAACAAGGGCACACCCAGGCTGCGGACCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161062 CTTGAACCGCCTGCGTGATAACAAGGGCACACCCAGGCTGCGGACCACGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TTGGTGTCGACGGATCTCTTTACAAGACGCACCCACA         GTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 161112 TTGGTGTCGACGGATCTCTTTACAAGACGCACCCACAGTG...AAGGTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TCCCGGCGTTTCCACAAGACTCTAAGGCGCTTGGTGCCAGACTCCGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163544 TCCCGGCGTTTCCACAAGACTCTAAGGCGCTTGGTGCCAGACTCCGATGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCGCTTCCTCCTCTCGGAGAGTGGCAGCGGCAAGGGGGCTGCCATGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163594 GCGCTTCCTCCTCTCGGAGAGTGGCAGCGGCAAGGGGGCTGCCATGGTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CGGCGGTGGCCTACCGCTTGGCCGAGCAGCACCGGCAGATAGAGGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163644 CGGCGGTGGCCTACCGCTTGGCCGAGCAGCACCGGCAGATAGAGGAGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CTGGCTCATTTCCACCTCACCAAAGACATGCTGCTGGAGGTGAAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 163694 CTGGCTCATTTCCACCTCACCAAGGACATGCTGCTGGAGGTGAAGAAGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GATGCGGGCCGAGATGGAGCTGGGGCTGAGGAAGCAGACGCACAACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163744 GATGCGGGCCGAGATGGAGCTGGGGCTGAGGAAGCAGACGCACAACAATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCGTGGTTAAGATGCTGCCCTCCTTCGTCCGGAGAACTCCCGACGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163794 CCGTGGTTAAGATGCTGCCCTCCTTCGTCCGGAGAACTCCCGACGGGACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 G         AGAATGGTGACTTCTTGGCCCTGGATCTTGGAGGAACCAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163844 GGTG...CAGAGAATGGTGACTTCTTGGCCCTGGATCTTGGAGGAACCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TTTCCGTGTGCTGCTGGTGAAAATCCGTAGTGGGAAAAAGAGAACGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165426 TTTCCGTGTGCTGCTGGTGAAAATCCGTAGTGGGAAAAAGAGAACGGTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AAATGCACAACAAGATCTACGCCATTCCTATTGAAATCATGCAGGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165476 AAATGCACAACAAGATCTACGCCATTCCTATTGAAATCATGCAGGGCACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GGGGAAGAG         CTGTTTGATCACATTGTCTCCTGCATCTCTGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 165526 GGGGAAGAGGTG...CAGCTGTTTGATCACATTGTCTCCTGCATCTCTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CTTCTTGGACTACATGGGGATCAAAGGCCCCAGGATGCCTCTGGGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165881 CTTCTTGGACTACATGGGGATCAAAGGCCCCAGGATGCCTCTGGGCTTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CGTTCTCATTTCCCTGCCAGCAGACGAGTCTGGACGCG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 165931 CGTTCTCATTTCCCTGCCAGCAGACGAGTCTGGACGCGGTG...TAGGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 ATCTTGATCACGTGGACAAAGGGTTTTAAGGCAACAGACTGCGTGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167379 ATCTTGATCACGTGGACAAAGGGTTTTAAGGCAACAGACTGCGTGGGCCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CGATGTAGTCACCTTACTAAGGGATGCGATAAAAAGGAGAGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 167429 CGATGTAGTCACCTTACTAAGGGATGCGATAAAAAGGAGAGAGGTA...A

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1936   GAATTTGACCTGGACGTGGTGGCTGTGGTCAACGACACAGTGGGCACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170248 AGGAATTTGACCTGGACGTGGTGGCTGTGGTCAACGACACAGTGGGCACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 ATGATGACCTGTGCTTATGAGGAGCCCACCTGTGAGGTTGGACTCATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170298 ATGATGACCTGTGCTTATGAGGAGCCCACCTGTGAGGTTGGACTCATTGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TG         GGACCGGCAGCAATGCCTGCTACATGGAGGAGATGAAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170348 TGGTG...CAGGGACCGGCAGCAATGCCTGCTACATGGAGGAGATGAAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ACGTGGAGATGGTGGAGGGGGACCAGGGGCAGATGTGCATCAACATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173217 ACGTGGAGATGGTGGAGGGGGACCAGGGGCAGATGTGCATCAACATGGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 TGGGGGGCCTTTGGGGACAACGGGTGTCTGGATGATATCAGGACACACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173267 TGGGGGGCCTTTGGGGACAACGGGTGTCTGGATGATATCAGGACACACTA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 CGACAGACTGGTGGACGAATATTCCCTAAATGCTGGGAAACAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 173317 CGACAGACTGGTGGACGAATATTCCCTAAATGCTGGGAAACAAAGGTA..

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220     GTATGAGAAGATGATCAGTGGTATGTACCTGGGTGAAATCGTCCGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173367 .CAGGTATGAGAAGATGATCAGTGGTATGTACCTGGGTGAAATCGTCCGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 AACATCTTAATCGACTTCACCAAGAAGGGATTCCTCTTCCGAGGGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176049 AACATCTTAATCGACTTCACCAAGAAGGGATTCCTCTTCCGAGGGCAGAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CTCTGAGACGCTGAAGACCCGGGGCATCTTTGAGACCAAGTTTCTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176099 CTCTGAGACGCTGAAGACCCGGGGCATCTTTGAGACCAAGTTTCTCTCTC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 AGATCGAGAG         TGACCGATTAGCACTGCTCCAGGTCCGGGCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 176149 AGATCGAGAGGTG...CAGTGACCGATTAGCACTGCTCCAGGTCCGGGCT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 ATCCTCCAGCAGCTAGGTCTGAATAGCACCTGCGATGACAGTATCCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179679 ATCCTCCAGCAGCTAGGTCTGAATAGCACCTGCGATGACAGTATCCTCGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 CAAGACAGTGTGCGGGGTGGTGTCCAGGAGGGCCGCACAGCTGTGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179729 CAAGACAGTGTGCGGGGTGGTGTCCAGGAGGGCCGCACAGCTGTGTGGCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 CAGGCATGGCTGCGGTTGTGGATAAGATCCGCGAGAACAGAGGACTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179779 CAGGCATGGCTGCGGTTGTGGATAAGATCCGCGAGAACAGAGGACTGGAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 CGTCTGAATGTGACTGTGGGAGTGGACGGGACACTCTACAAGCTTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179829 CGTCTGAATGTGACTGTGGGAGTGGACGGGACACTCTACAAGCTTCATCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 ACA         CTTCTCCAGAATCATGCACCAGACGGTGAAGGAACTGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179879 ACAGTG...TAGCTTCTCCAGAATCATGCACCAGACGGTGAAGGAACTGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 CACCAAAATGTAACGTGTCCTTCCTCCTGTCTGAGGATGGCAGCGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182082 CACCAAAATGTAACGTGTCCTTCCTCCTGTCTGAGGATGGCAGCGGCAAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GGGGCCGCCCTCATCACGGCCGTGGGCGTGCGGTTACGCACAGAGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182132 GGGGCCGCCCTCATCACGGCCGTGGGCGTGCGGTTACGCACAGAGGCAAG

   2900 
   2748 CAGC
        ||||
 182182 CAGC