seq1 = pF1KB4590.tfa, 2019 bp
seq2 = pF1KB4590/gi568815592r_130758139.tfa (gi568815592r:130758139_131056485), 298347 bp

>pF1KB4590 2019
>gi568815592r:130758139_131056485 (Chr6)

(complement)

1-492  (100001-100492)   100% ->
493-705  (101169-101381)   100% ->
706-810  (129777-129881)   100% ->
811-853  (147623-147665)   100% ->
854-929  (151946-152021)   100% ->
930-1148  (155306-155524)   100% ->
1149-1236  (156908-156995)   100% ->
1237-1389  (161367-161519)   100% ->
1390-1487  (162045-162142)   100% ->
1488-1660  (166020-166192)   100% ->
1661-1833  (171218-171390)   100% ->
1834-1914  (192768-192848)   100% ->
1915-2019  (198243-198347)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTACTGAAGTAGGCTCTGTGTCTGAAGTGAAGAAGGACTCTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTACTGAAGTAGGCTCTGTGTCTGAAGTGAAGAAGGACTCTAGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTAGGAACAGATGCAACCAAGGAAAAACCTAAAGAAGTAGCAGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTAGGAACAGATGCAACCAAGGAAAAACCTAAAGAAGTAGCAGAAAATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCAGAATCAGTCTTCCGATCCAGAGGAGGAAAAAGGTTCCCAGCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCAGAATCAGTCTTCCGATCCAGAGGAGGAAAAAGGTTCCCAGCCACCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTGCAGCTGAAAGCCAAAGTAGTCTACGCCGCCAGAAGAGAGAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTGCAGCTGAAAGCCAAAGTAGTCTACGCCGCCAGAAGAGAGAGAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AACATCGGAGAGCAGGGGTATTTCTCGGTTCATACCGCCATGGCTTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AACATCGGAGAGCAGGGGTATTTCTCGGTTCATACCGCCATGGCTTAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCAAAAGTCATATACCTTAGTAGTGGCCAAAGATGGAGGAGATAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCAAAAGTCATATACCTTAGTAGTGGCCAAAGATGGAGGAGATAAAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGCCTACCCAAGCTGTTGTTGAAGAACAGGTCTTAGATAAAGAGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGCCTACCCAAGCTGTTGTTGAAGAACAGGTCTTAGATAAAGAGGAACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTTCCAGAAGAACAGAGACAGGCTAAGGGTGATGCTGAAGAAATGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTTCCAGAAGAACAGAGACAGGCTAAGGGTGATGCTGAAGAAATGGCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAAGAAACAAGAGATTAAAGTTGAAGTCAAGGAAGAAAAACCCTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAAGAAACAAGAGATTAAAGTTGAAGTCAAGGAAGAAAAACCCTCAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCAAGGAAGAAAAACCCTCAGTGAGCAAAGTGGAGATGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100451 AGCAAGGAAGAAAAACCCTCAGTGAGCAAAGTGGAGATGCAGGTA...CA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    493  CCTACTGAATTAGTAAGTAAGGAGAGAGAAGAGAAGGTAAAAGAAACAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101168 GCCTACTGAATTAGTAAGTAAGGAGAGAGAAGAGAAGGTAAAAGAAACAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGGAAGACAAATTAGAAGGAGGAGCAGCAAAAAGGGAGACCAAGGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101218 AGGAAGACAAATTAGAAGGAGGAGCAGCAAAAAGGGAGACCAAGGAAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGACCAATGAGCTGAAAGCAGAGAAGGCATCTCAAAAAGTCACCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101268 CAGACCAATGAGCTGAAAGCAGAGAAGGCATCTCAAAAAGTCACCAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GACCAAAACTGTCCAGTGTAAAGTGACCCTCTTAGATGGCACCGAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101318 GACCAAAACTGTCCAGTGTAAAGTGACCCTCTTAGATGGCACCGAATACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCTGTGACCTGGAG         AAACATGCCAAGGGACAAGTGTTATTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101368 GCTGTGACCTGGAGGTG...CAGAAACATGCCAAGGGACAAGTGTTATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GACAAAGTGTGTGAACACCTCAATCTCTTGGAGAAAGACTACTTTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129804 GACAAAGTGTGTGAACACCTCAATCTCTTGGAGAAAGACTACTTTGGACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TTTGTTTCAGGAAAGCCCTGAGCAGAAA         AACTGGTTAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 129854 TTTGTTTCAGGAAAGCCCTGAGCAGAAAGTA...CAGAACTGGTTAGATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CTGCTAAAGAAATAAAGAGACAACTGAGAA         ACCTTCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 147636 CTGCTAAAGAAATAAAGAGACAACTGAGAAGTA...CAGACCTTCCATGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTATTCACTTTTAATGTGAAGTTTTATCCTCCTGATCCTTCTCAATTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151957 CTATTCACTTTTAATGTGAAGTTTTATCCTCCTGATCCTTCTCAATTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGAAGATATCACCAG         ATACTTCTTGTGCCTTCAGCTCCGGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 152007 TGAAGATATCACCAGGTA...CAGATACTTCTTGTGCCTTCAGCTCCGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGGACATTGCCTCTGGCCGCCTGCCCTGCTCTTTTGTGACTCATGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155332 AGGACATTGCCTCTGGCCGCCTGCCCTGCTCTTTTGTGACTCATGCTCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGGGATCCTACACCCTGCAGGCTGAACTTGGTGACTATGACCCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155382 CTGGGATCCTACACCCTGCAGGCTGAACTTGGTGACTATGACCCAGAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 ACATGGCAGCATCGACCTCAGTGAATTCCAGTTTGCCCCTACTCAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155432 ACATGGCAGCATCGACCTCAGTGAATTCCAGTTTGCCCCTACTCAGACTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGGAGCTGGAAGAGAAGGTGGCAGAGCTGCACAAAACCCACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 155482 AGGAGCTGGAAGAGAAGGTGGCAGAGCTGCACAAAACCCACAGGTC...C

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1149   GGGCTTATCGCCAGCACAAGCTGATTCCCAGTTCTTAGAAAATGCAAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156906 AGGGGCTTATCGCCAGCACAAGCTGATTCCCAGTTCTTAGAAAATGCAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GAGGCTTTCCATGTATGGTGTTGACCTACATCATGCCAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 156956 GAGGCTTTCCATGTATGGTGTTGACCTACATCATGCCAAGGTA...CAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ACTCAGAAGGTGTGGACATCAAGCTGGGCGTGTGTGCTAATGGACTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161368 ACTCAGAAGGTGTGGACATCAAGCTGGGCGTGTGTGCTAATGGACTTCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ATTTACAAAGACAGACTGCGAATCAATCGTTTTGCTTGGCCGAAAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161418 ATTTACAAAGACAGACTGCGAATCAATCGTTTTGCTTGGCCGAAAATCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AAAAATTTCCTATAAACGCAGTAACTTCTACATTAAAGTCAGACCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161468 AAAAATTTCCTATAAACGCAGTAACTTCTACATTAAAGTCAGACCGGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 AG         CTGGAACAGTTTGAGAGTACCATTGGATTCAAACTGCCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161518 AGGTA...CAGCTGGAACAGTTTGAGAGTACCATTGGATTCAAACTGCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AACCACCGGGCAGCGAAAAGACTATGGAAAGTGTGCGTGGAGCATCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162084 AACCACCGGGCAGCGAAAAGACTATGGAAAGTGTGCGTGGAGCATCATAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TTTCTACAG         GCTTGTTTCTCCAGAGCAGCCACCAAAAGCCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 162134 TTTCTACAGGTA...TAGGCTTGTTTCTCCAGAGCAGCCACCAAAAGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AGTTCCTGACCTTGGGGTCCAAATTTCGCTATAGTGGCCGCACCCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166052 AGTTCCTGACCTTGGGGTCCAAATTTCGCTATAGTGGCCGCACCCAAGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CAGACCCGCCAGGCCAGCACCCTCATAGATAGGCCAGCACCACACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166102 CAGACCCGCCAGGCCAGCACCCTCATAGATAGGCCAGCACCACACTTTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GCGCACTTCTAGTAAACGGGTCTCCAGGAGTCTAGATGGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 166152 GCGCACTTCTAGTAAACGGGTCTCCAGGAGTCTAGATGGAGGTA...TAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CTCCGATTGGTGTCATGGACCAAAGTCTTATGAAGGATTTTCCTGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171218 CTCCGATTGGTGTCATGGACCAAAGTCTTATGAAGGATTTTCCTGGCGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GCTGGGGAGATTTCAGCCTATGGACCTGGACTTGTCAGCATTGCCGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171268 GCTGGGGAGATTTCAGCCTATGGACCTGGACTTGTCAGCATTGCCGTGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 ACAAGATGGGGACGGCAGGAGGGAAGTGAGAAGCCCAACTAAAGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171318 ACAAGATGGGGACGGCAGGAGGGAAGTGAGAAGCCCAACTAAAGCCCCAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 ATTTGCAGCTCATTGAAGGAAAG         ACTGTAAAAGGTGGAATT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 171368 ATTTGCAGCTCATTGAAGGAAAGGTA...TAGACTGTAAAAGGTGGAATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TCTGAAACAAGAATTGAGAAACGCATTGTGATCACAGGAGATGGAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192786 TCTGAAACAAGAATTGAGAAACGCATTGTGATCACAGGAGATGGAGATAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TGATCATGACCAG         GCACTGGCTCAGGCGATCAGGGAAGCCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 192836 TGATCATGACCAGGTA...CAGGCACTGGCTCAGGCGATCAGGGAAGCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 GAGAGCAGCACCCTGACATGTCGGTCACAAGAGTGGTGGTACACAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198271 GAGAGCAGCACCCTGACATGTCGGTCACAAGAGTGGTGGTACACAAAGAA

   2100     .    :    .    :    .
   1993 ACAGAGTTGGCTGAGGAAGGGGAAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||
 198321 ACAGAGTTGGCTGAGGAAGGGGAAGAT