seq1 = pF1KB4571.tfa, 1845 bp
seq2 = pF1KB4571/gi568815597r_225303306.tfa (gi568815597r:225303306_225524075), 220770 bp

>pF1KB4571 1845
>gi568815597r:225303306_225524075 (Chr1)

(complement)

1-165  (100001-100165)   99% ->
166-366  (101799-101999)   99% ->
367-450  (104278-104361)   100% ->
451-640  (104624-104813)   99% ->
641-837  (105896-106092)   100% ->
838-892  (108744-108798)   100% ->
893-1084  (111431-111622)   100% ->
1085-1188  (112636-112739)   100% ->
1189-1314  (113660-113785)   100% ->
1315-1483  (117244-117412)   100% ->
1484-1564  (119370-119450)   100% ->
1565-1687  (119550-119672)   100% ->
1688-1845  (120613-120770)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAAGTAGGAAATTTGCCGATGGTGAAGTGGTAAGAGGTCGATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAAGTAGGAAATTTGCCGATGGTGAAGTGGTAAGAGGTCGATGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGAGTTCACTTTATTATGAAGTAGAAATTCTGAGCCACGACAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGAGTTCACTTTATTATGAAGTAGAAATTCTGAGCCACGACAGCACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAGCTTTACACTGTAAAGTATAAAGATGGAACAGAGCTTGAATTGAAA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCAGCTTTACACTGTGAAGTATAAAGATGGAACAGAGCTTGAATTGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGAATGATATTAAG         CCTTTAACTTCCTTTAGGCAAAGGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGAATGATATTAAGGTA...TAGCCTTTAACTTCCTTTAGGCAAAGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGTGGCTCAACTTCCAGTTCCCCTTCCAGACGCCGAGGGAGTCGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101825 AGGTGGCTCAACTTCCAGTTCCCCTTCCAGACGCCGAGGGAGTCGATCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGTCACGCTCCCGATCCCCCGGTCGACCACCTAAAAGTGCCCGCCGATCT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 101875 GGTCACGCTCCCGATCCCCTGGTCGACCACCTAAAAGTGCCCGCCGATCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTTCTGCTTCCCACCAGGCCGACATTAAGGAAGCAAGGAGGGAAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101925 GCTTCTGCTTCCCACCAGGCCGACATTAAGGAAGCAAGGAGGGAAGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGTTAAATTGACTCCGCTGATTCTG         AAGCCATTTGGAAATA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101975 AGTTAAATTGACTCCGCTGATTCTGGTA...TAGAAGCCATTTGGAAATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCATCAGCAGATATAATGGGGAGCCTGAGCATATTGAGAGAAATGACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104294 GCATCAGCAGATATAATGGGGAGCCTGAGCATATTGAGAGAAATGACGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCTCATAAAAATACACAG         GAAAAATTCAATTTGTCACAAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| ||||||||||||
 104344 CCTCATAAAAATACACAGGTG...TAGGAAAAATTCAGTTTGTCACAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAGCAGTTACATAGCAACACAGTATAGCCTTCGTCCAAGAAGAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104647 AAGCAGTTACATAGCAACACAGTATAGCCTTCGTCCAAGAAGAGAAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCAAATTAAAAGAAATAGATTCTAAGGAAGAAAAATACGTTGCAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104697 TCAAATTAAAAGAAATAGATTCTAAGGAAGAAAAATACGTTGCAAAAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGGCAGTGAGAACCTTTGAAGTGACCCCCATCCGGGCAAAGGACTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104747 CTGGCAGTGAGAACCTTTGAAGTGACCCCCATCCGGGCAAAGGACTTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTTTGGAGGAGTACCTG         GTGTGTTTCTCATCATGTTTGGCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104797 GTTTGGAGGAGTACCTGGTA...CAGGTGTGTTTCTCATCATGTTTGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGCCTGTGTTCCTCTTCCTGTTGCTGTTGATGTGTAAACAGAAAGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105920 TGCCTGTGTTCCTCTTCCTGTTGCTGTTGATGTGTAAACAGAAAGATCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGTCTTCTGAATTTCCCTCCTCCTTTGCCAGCTTTGTATGAGTTATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105970 AGTCTTCTGAATTTCCCTCCTCCTTTGCCAGCTTTGTATGAGTTATGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AACCAGAGTATTTGGGGTCTACCTCCTGTGGTTTTTGATTCAAGTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106020 AACCAGAGTATTTGGGGTCTACCTCCTGTGGTTTTTGATTCAAGTCCTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCTACCTACTGCCAATTGGAAAG         GTTGTAGAAGGAACGCCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106070 TCTACCTACTGCCAATTGGAAAGGTA...AAGGTTGTAGAAGGAACGCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTTATTGATGGAAGAAGACTCAAGTATAGATTAAATG         GATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 108762 CTTATTGATGGAAGAAGACTCAAGTATAGATTAAATGGTG...AAGGATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTATGCTTTTATCCTGACATCTGCAGTCATCGGAACATCTCTCTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111435 CTATGCTTTTATCCTGACATCTGCAGTCATCGGAACATCTCTCTTCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCGTAGAGTTTCATTACGTGTACAGTCATTTTCTTCAGTTTGCACTTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111485 GCGTAGAGTTTCATTACGTGTACAGTCATTTTCTTCAGTTTGCACTTGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCCACTGTTTTTTGTGTGGTCTTGAGTGTGTATCTCTACATGCGCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111535 GCCACTGTTTTTTGTGTGGTCTTGAGTGTGTATCTCTACATGCGCTCTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GAAAGCGCCCCGGAATGACCTGTCGCCTGCCAGCTCTG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111585 GAAAGCGCCCCGGAATGACCTGTCGCCTGCCAGCTCTGGTG...CAGGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGCTGTCTATGATTTCTTCATTGGCCGTGAATTAAACCCTCGAATTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112639 ATGCTGTCTATGATTTCTTCATTGGCCGTGAATTAAACCCTCGAATTGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ACTTTTGATCTCAAATACTTTTGTGAATTGCGCCCCGGATTGATTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112689 ACTTTTGATCTCAAATACTTTTGTGAATTGCGCCCCGGATTGATTGGATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 G         GTGGTTATTAACTTGGTGATGCTTTTGGCTGAAATGAAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112739 GGTA...CAGGTGGTTATTAACTTGGTGATGCTTTTGGCTGAAATGAAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TACAGGACCGCGCTGTTCCATCCTTGGCCATGATTTTAGTTAATAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113700 TACAGGACCGCGCTGTTCCATCCTTGGCCATGATTTTAGTTAATAGTTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CAGCTTCTCTATGTGGTGGATGCTCTCTGGAATGAG         GAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 113750 CAGCTTCTCTATGTGGTGGATGCTCTCTGGAATGAGGTA...TAGGAAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GTTGTTGACGACCATGGACATCATCCACGATGGATTTGGATTCATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117249 GTTGTTGACGACCATGGACATCATCCACGATGGATTTGGATTCATGCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTTTTGGAGACTTGGTGTGGGTTCCCTTTATTTACAGCTTCCAAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117299 CTTTTGGAGACTTGGTGTGGGTTCCCTTTATTTACAGCTTCCAAGCCTTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TATTTAGTCAGTCATCCAAATGAAGTGTCTTGGCCAATGGCTTCTCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117349 TATTTAGTCAGTCATCCAAATGAAGTGTCTTGGCCAATGGCTTCTCTAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TATTGTTCTGAAAC         TTTGTGGTTATGTAATCTTCCGAGGTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 117399 TATTGTTCTGAAACGTG...CAGTTTGTGGTTATGTAATCTTCCGAGGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CAAATTCTCAGAAAAATGCATTCCGGAAAAATCCCAGTGATCCAAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119397 CAAATTCTCAGAAAAATGCATTCCGGAAAAATCCCAGTGATCCAAAGCTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GCAC         ATTTAAAAACCATTCATACTTCAACGGGAAAAAATCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119447 GCACGTA...TAGATTTAAAAACCATTCATACTTCAACGGGAAAAAATCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TCTAGTTTCTGGATGGTGGGGCTTTGTTCGCCACCCCAATTACTTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119587 TCTAGTTTCTGGATGGTGGGGCTTTGTTCGCCACCCCAATTACTTGGGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ATCTCATCATGGCCTTGGCGTGGTCCCTCCCATGTG         GTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 119637 ATCTCATCATGGCCTTGGCGTGGTCCCTCCCATGTGGTA...CAGGTTTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AACCACATTCTGCCTTATTTCTACATAATTTATTTCACCATGTTGCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120618 AACCACATTCTGCCTTATTTCTACATAATTTATTTCACCATGTTGCTTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CCACCGAGAAGCTCGTGACGAGTACCACTGTAAGAAGAAATACGGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120668 CCACCGAGAAGCTCGTGACGAGTACCACTGTAAGAAGAAATACGGCGTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CTTGGGAAAAGTACTGTCAGCGTGTGCCCTACCGTATATTTCCATACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120718 CTTGGGAAAAGTACTGTCAGCGTGTGCCCTACCGTATATTTCCATACATC

   1950 
   1843 TAC
        |||
 120768 TAC