seq1 = pF1KB4568.tfa, 1110 bp
seq2 = pF1KB4568/gi568815596r_96086733.tfa (gi568815596r:96086733_96308434), 221702 bp

>pF1KB4568 1110
>gi568815596r:96086733_96308434 (Chr2)

(complement)

1-290  (100001-100290)   100% ->
291-499  (112886-113094)   100% ->
500-549  (113428-113477)   100% ->
550-660  (115083-115193)   100% ->
661-743  (115275-115357)   100% ->
744-843  (115967-116066)   100% ->
844-928  (121134-121218)   100% ->
929-1110  (121521-121702)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCCGCGGAGGCTGCTGGCCGCCTGGCTGGCGGGGACGCGGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCCCGCGGAGGCTGCTGGCCGCCTGGCTGGCGGGGACGCGGGGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCTGCTGGCGCTTCTGGCCAATCAGTGCCGCTTCGTCACGGGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCCTGCTGGCGCTTCTGGCCAATCAGTGCCGCTTCGTCACGGGCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGTGCGGCGCGCGCAGCAGATCGCGCAGCTCTACGGCCGCCTCTACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGTGCGGCGCGCGCAGCAGATCGCGCAGCTCTACGGCCGCCTCTACTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGAGCTCACGCCGCGTTCTCCTCGGCCGCCTCTGGCGCCGGCTGCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGAGCTCACGCCGCGTTCTCCTCGGCCGCCTCTGGCGCCGGCTGCACGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGTCCTGGCCATGCCTCTGCCTTGATGGCGGCGTTAGCCGGCGTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGTCCTGGCCATGCCTCTGCCTTGATGGCGGCGTTAGCCGGCGTCTTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTGGGACGAGGAGAGGATCCAGGAGGAGGAGTTGCAGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100251 TTTGGGACGAGGAGAGGATCCAGGAGGAGGAGTTGCAGAGGTG...CAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCTATTAATGAGATGAAGCGGTTGGAAGAAATGTCAAATATGTTTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112887 TCTATTAATGAGATGAAGCGGTTGGAAGAAATGTCAAATATGTTTCAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTCTGGAGTCCAGCACCACCCTCCAGAACCAAAAGCCCAAACAGAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112937 CTCTGGAGTCCAGCACCACCCTCCAGAACCAAAAGCCCAAACAGAAGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGAAGATTCAGAGGGCAAAGAGCAACGTTGGGAAATGGTGATGGATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112987 ATGAAGATTCAGAGGGCAAAGAGCAACGTTGGGAAATGGTGATGGATAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAACACTTTAAGCTGTGGCGGCGCCCAATTACAGGCACCCACCTTTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113037 AAACACTTTAAGCTGTGGCGGCGCCCAATTACAGGCACCCACCTTTACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTACCGAG         TTTTTGGAACCTACACAGATGTGACACCTCGGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 113087 GTACCGAGGTG...TAGTTTTTGGAACCTACACAGATGTGACACCTCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGTTCTTCAATGTTCAG         CTGGACACAGAGTATAGAAAAAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 113461 AGTTCTTCAATGTTCAGGTG...CAGCTGGACACAGAGTATAGAAAAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGGGATGCCCTGGTAATCAAGCTGGAGGTGATTGAGAGGGATGTGGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115107 TGGGATGCCCTGGTAATCAAGCTGGAGGTGATTGAGAGGGATGTGGTTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGGTTCCGAGGTTCTTCACTGGGTAACCCATTTTCCT         TATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 115157 TGGTTCCGAGGTTCTTCACTGGGTAACCCATTTTCCTGTG...TAGTATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAATGTACTCACGGGATTATGTTTATGTTCGGCGGTATAGTGTGGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115279 CAATGTACTCACGGGATTATGTTTATGTTCGGCGGTATAGTGTGGATCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAAAACAACATGATGGTGTTGGTGTCGCG         TGCTGTGGAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 115329 GAAAACAACATGATGGTGTTGGTGTCGCGGTA...CAGTGCTGTGGAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCCGAGTGTGCCAGAGTCTCCAGAATTCGTCAGGGTCAGATCATATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115979 TCCGAGTGTGCCAGAGTCTCCAGAATTCGTCAGGGTCAGATCATATGAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCCAAATGGTTATCCGTCCCCACAAGTCATTTGATGAG         AAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 116029 CCCAAATGGTTATCCGTCCCCACAAGTCATTTGATGAGGTG...CAGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGCTTTGACTACTTACTAACATACAGTGACAATCCCCAAACGGTGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121137 GGCTTTGACTACTTACTAACATACAGTGACAATCCCCAAACGGTGTTTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCGCTACTGTGTTAGTTGGATGGTTTCCAGTG         GCATGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 121187 TCGCTACTGTGTTAGTTGGATGGTTTCCAGTGGTA...CAGGCATGCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATTTCCTGGAGAAGCTGCACATGGCCACTCTGAAAGCCAAGAATATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121530 ATTTCCTGGAGAAGCTGCACATGGCCACTCTGAAAGCCAAGAATATGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATTAAAGTAAAGGACTACATCTCAGCTAAGCCTCTGGAAATGAGTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121580 ATTAAAGTAAAGGACTACATCTCAGCTAAGCCTCTGGAAATGAGTAGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AGCCAAGGCCACCAGCCAGTCCTCTGAGCGAAAGAACGAGGGCAGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121630 AGCCAAGGCCACCAGCCAGTCCTCTGAGCGAAAGAACGAGGGCAGCTGTG

   1150     .    :    .    :
   1088 GCCCTGCTCGGATTGAGTATGCT
        |||||||||||||||||||||||
 121680 GCCCTGCTCGGATTGAGTATGCT