seq1 = pF1KB4567.tfa, 2280 bp
seq2 = pF1KB4567/gi568815586r_50077067.tfa (gi568815586r:50077067_50348751), 271685 bp

>pF1KB4567 2280
>gi568815586r:50077067_50348751 (Chr12)

(complement)

1-119  (100001-100119)   100% ->
120-165  (117042-117087)   100% ->
166-630  (126267-126731)   100% ->
631-715  (142684-142768)   100% ->
716-864  (144052-144200)   100% ->
865-972  (147868-147975)   100% ->
973-1030  (152865-152922)   100% ->
1031-1143  (156188-156300)   100% ->
1144-1277  (166715-166848)   100% ->
1278-2280  (170683-171685)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATCATCTCCATTTAATAGACGGCAATGGACCTCACTATCATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATCATCTCCATTTAATAGACGGCAATGGACCTCACTATCATTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTAACAGCCAAAGAACTTTCTCTTGTCAACAAGAACAAGTCATCGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTAACAGCCAAAGAACTTTCTCTTGTCAACAAGAACAAGTCATCGGCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGTGGAAATATTCTCCAA         GTACCAGAAAGCAGCTGAAGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100101 TTGTGGAAATATTCTCCAAGTA...AAGGTACCAGAAAGCAGCTGAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAAACATGGAGAAGAAGAGAAGT         AACACCGAAAATCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 117064 ACAAACATGGAGAAGAAGAGAAGTGTA...TAGAACACCGAAAATCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAGCACTTTAGAAAGGGGACCCTGACTGTGTTAAAGAAGAAGTGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126284 CCAGCACTTTAGAAAGGGGACCCTGACTGTGTTAAAGAAGAAGTGGGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCCAGGGCTGGGAGCAGAGTCTCACACAGACTCTCTACGGAACAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126334 ACCCAGGGCTGGGAGCAGAGTCTCACACAGACTCTCTACGGAACAGCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACTGAGATTAGGCACAGAGCAGACCATCCTCCTGCTGAAGTGACAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126384 ACTGAGATTAGGCACAGAGCAGACCATCCTCCTGCTGAAGTGACAAGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGCTGCTTCTGGAGCCAAAGCTGACCAAGAAGAACAAATCCACCCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126434 CGCTGCTTCTGGAGCCAAAGCTGACCAAGAAGAACAAATCCACCCCAGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTAGACTCAGGTCACCTCCTGAAGCCCTCGTTCAGGGTCGATATCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126484 CTAGACTCAGGTCACCTCCTGAAGCCCTCGTTCAGGGTCGATATCCCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCAAGGACGGTGAGGATCTTAAAGACCACTCAACAGAAAGTAAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126534 ATCAAGGACGGTGAGGATCTTAAAGACCACTCAACAGAAAGTAAAAAAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAAAATTGTCTAGGAGAATCCAGGCATGAAGTAGAAAAATCAGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126584 GGAAAATTGTCTAGGAGAATCCAGGCATGAAGTAGAAAAATCAGAAATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTGAAAACACAGATGCTTCGGGCAAAATAGAGAAATATAATGTTCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126634 GTGAAAACACAGATGCTTCGGGCAAAATAGAGAAATATAATGTTCCGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACAGGCTTAAGATGATGTTTGAGAAAGGTGAACCAACTCAAACTAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 126684 AACAGGCTTAAGATGATGTTTGAGAAAGGTGAACCAACTCAAACTAAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    631        ATTCTCCGGGCCCAAAGCCGAAGTGCAAGTGGAAGGAAGATCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126734 A...CAGATTCTCCGGGCCCAAAGCCGAAGTGCAAGTGGAAGGAAGATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGAAAACAGCTATTCTCTAGATGACCTGGAAATAGGCCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 142727 CTGAAAACAGCTATTCTCTAGATGACCTGGAAATAGGCCCAGGTA...CA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    716  GTCAGTTGTCATCTTCTACATTTGACTCGGAGAAAAATGAGAGTAGACG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144051 GGTCAGTTGTCATCTTCTACATTTGACTCGGAGAAAAATGAGAGTAGACG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AAATCTGGAACTTCCACGCCTCTCAGAAACCTCTATAAAGGATCGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144101 AAATCTGGAACTTCCACGCCTCTCAGAAACCTCTATAAAGGATCGAATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCAAGTACCAGGCAGCTGTGTCCAAACAAAGCAGCTCAACCAACTATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144151 CCAAGTACCAGGCAGCTGTGTCCAAACAAAGCAGCTCAACCAACTATACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865          AATGAGCTGAAAGCCAGTGGTGGCGAAATCAAAATTCATAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144201 GTA...TAGAATGAGCTGAAAGCCAGTGGTGGCGAAATCAAAATTCATAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AATGGAGCAAAAGGAGAATGTGCCCCCAGGTCCTGAGGTCTGCATCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147909 AATGGAGCAAAAGGAGAATGTGCCCCCAGGTCCTGAGGTCTGCATCACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATCAGGAAGGGGAAAAG         ATTTCTGCAAATGAGAATAGCCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 147959 ATCAGGAAGGGGAAAAGGTA...TAGATTTCTGCAAATGAGAATAGCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCAGTCCGTTCCACCCCTGCCGAAGATGACTCCC         CAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 152889 GCAGTCCGTTCCACCCCTGCCGAAGATGACTCCCGTA...AAGCAGGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTCCCAGGTTAAGAGTGAGGTTCAACAGCCTGTCCATCCCAAGCCACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156195 CTCCCAGGTTAAGAGTGAGGTTCAACAGCCTGTCCATCCCAAGCCACTAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GTCCAGATTCCAGAGCCTCCAGTCTTTCTGAAAGTTCTCCTCCCAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156245 GTCCAGATTCCAGAGCCTCCAGTCTTTCTGAAAGTTCTCCTCCCAAAGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATGAAG         AAGTTTCAGGCACCTGCAAGAGAGACCTGCGTGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156295 ATGAAGGTA...TAGAAGTTTCAGGCACCTGCAAGAGAGACCTGCGTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ATGTCAGAAGACAGTCTATCCAATGGAGCGTCTCTTGGCCAACCAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166750 ATGTCAGAAGACAGTCTATCCAATGGAGCGTCTCTTGGCCAACCAGCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGTTTCACATCAGCTGCTTCCGTTGCTCCTATTGCAACAACAAACTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 166800 TGTTTCACATCAGCTGCTTCCGTTGCTCCTATTGCAACAACAAACTCAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1278         TCTAGGAACATATGCATCTTTACATGGAAGAATCTATTGTAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166850 TA...CAGTCTAGGAACATATGCATCTTTACATGGAAGAATCTATTGTAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCCTCACTTCAATCAACTCTTTAAATCTAAGGGCAACTATGATGAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170725 GCCTCACTTCAATCAACTCTTTAAATCTAAGGGCAACTATGATGAAGGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TTGGGCACAGACCACACAAGGATCTATGGGCAAGCAAAAATGAAAACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170775 TTGGGCACAGACCACACAAGGATCTATGGGCAAGCAAAAATGAAAACGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAGATTTTGGAGAGACCAGCCCAGCTTGCAAATGCAAGGGAGACCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170825 GAGATTTTGGAGAGACCAGCCCAGCTTGCAAATGCAAGGGAGACCCCTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CAGCCCAGGGGTAGAAGATGCCCCTATTGCTAAGGTGGGTGTCCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170875 CAGCCCAGGGGTAGAAGATGCCCCTATTGCTAAGGTGGGTGTCCTGGCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CAAGTATGGAAGCCAAGGCCTCCTCTCAGCAGGAGAAGGAAGACAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170925 CAAGTATGGAAGCCAAGGCCTCCTCTCAGCAGGAGAAGGAAGACAAGCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GCTGAAACCAAGAAGCTGAGGATCGCCTGGCCACCCCCCACTGAACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170975 GCTGAAACCAAGAAGCTGAGGATCGCCTGGCCACCCCCCACTGAACTTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AAGTTCAGGAAGTGCCTTGGAGGAAGGGATCAAAATGTCAAAGCCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171025 AAGTTCAGGAAGTGCCTTGGAGGAAGGGATCAAAATGTCAAAGCCCAAAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 GGCCTCCTGAAGACGAAATCAGCAAGCCCGAAGTTCCTGAGGATGTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171075 GGCCTCCTGAAGACGAAATCAGCAAGCCCGAAGTTCCTGAGGATGTCGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 CTAGATCTGAAGAAGCTAAGACGATCTTCTTCACTGAAGGAAAGAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171125 CTAGATCTGAAGAAGCTAAGACGATCTTCTTCACTGAAGGAAAGAAGCCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 CCCATTCACTGTAGCAGCTTCATTTCAAAGCACCTCTGTCAAGAGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171175 CCCATTCACTGTAGCAGCTTCATTTCAAAGCACCTCTGTCAAGAGCCCAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 AAACTGTGTCCCCACCTATCAGGAAAGGCTGGAGCATGTCAGAGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171225 AAACTGTGTCCCCACCTATCAGGAAAGGCTGGAGCATGTCAGAGCAGAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 GAAGAGTCTGTGGGTGGAAGAGTTGCAGAAAGGAAACAAGTGGAAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171275 GAAGAGTCTGTGGGTGGAAGAGTTGCAGAAAGGAAACAAGTGGAAAATGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 CAAGGCTTCTAAGAAGAATGGGAATGTGGGAAAAACAACCTGGCAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171325 CAAGGCTTCTAAGAAGAATGGGAATGTGGGAAAAACAACCTGGCAAAACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 AAGAATCTAAAGGAGAGACAGGGAAGAGAAGTAAGGAAGGTCATAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171375 AAGAATCTAAAGGAGAGACAGGGAAGAGAAGTAAGGAAGGTCATAGTTTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 GAGATGGAGAATGAGAATCTTGTAGAAAATGGTGCAGACTCCGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171425 GAGATGGAGAATGAGAATCTTGTAGAAAATGGTGCAGACTCCGATGAAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 TGATAACAGCTTCCTCAAACAACAATCTCCACAAGAACCCAAGTCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171475 TGATAACAGCTTCCTCAAACAACAATCTCCACAAGAACCCAAGTCTCTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 ATTGGTCGAGTTTTGTAGACAACACCTTTGCTGAAGAATTCACTACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171525 ATTGGTCGAGTTTTGTAGACAACACCTTTGCTGAAGAATTCACTACTCAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 AATCAGAAATCCCAGGATGTGGAACTCTGGGAGGGAGAAGTGGTCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171575 AATCAGAAATCCCAGGATGTGGAACTCTGGGAGGGAGAAGTGGTCAAAGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 GCTCTCTGTGGAAGAACAGATAAAGAGAAATCGGTATTATGATGAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171625 GCTCTCTGTGGAAGAACAGATAAAGAGAAATCGGTATTATGATGAGGATG

   2350     .    :
   2270 AGGATGAAGAG
        |||||||||||
 171675 AGGATGAAGAG