seq1 = pF1KB4518.tfa, 1014 bp
seq2 = pF1KB4518/gi568815587r_132320196.tfa (gi568815587r:132320196_133632324), 1312129 bp

>pF1KB4518 1014
>gi568815587r:132320196_133632324 (Chr11)

(complement)

59-141  (689312-689394)   100% ->
142-379  (975000-975238)   99% ->
380-505  (1103139-1103264)   100% ->
506-643  (1194966-1195103)   100% ->
644-764  (1195546-1195666)   100% ->
765-916  (1196088-1196239)   100% ->
917-1014  (1212032-1212129)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     59 CAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 689312 CAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    109 AACGTGACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACC         CT CAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||-|||||
 689362 AACGTGACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTC...TCACTGCAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149 GTACCATAGATGACCGGGTAACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 975008 GTACCATAGATGACCGGGTAACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199 ATCCTCTACGCTGGGAATGACAAGTGGTCCATAGACCCTCGTGTGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 975058 ATCCTCTACGCTGGGAATGACAAGTGGTCCATAGACCCTCGTGTGATCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    249 CCTGGTCAATACACCAACCCAGTACAGCATCATGATCCAAAATGTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 975108 CCTGGTCAATACACCAACCCAGTACAGCATCATGATCCAAAATGTGGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    299 TGTATGACGAAGGTCCGTACACCTGCTCTGTGCAGACAGACAATCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 975158 TGTATGACGAAGGTCCGTACACCTGCTCTGTGCAGACAGACAATCATCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    349 AAAACGTCCCGGGTTCACCTAATAGTGCAAG         TTCCTCCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 975208 AAAACGTCCCGGGTTCACCTAATAGTGCAAGGTA...CAGTTCCTCCTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    390 GATCATGAATATCTCCTCAGACATCACTGTGAATGAGGGAAGCAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1103149 GATCATGAATATCTCCTCAGACATCACTGTGAATGAGGGAAGCAGTGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    440 CCCTGCTGTGTCTTGCTATTGGCAGACCAGAGCCAACTGTGACATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1103199 CCCTGCTGTGTCTTGCTATTGGCAGACCAGAGCCAACTGTGACATGGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    490 CACCTGTCAGTCAAGG         AAGGCCAGGGCTTTGTAAGTGAGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
1103249 CACCTGTCAGTCAAGGGTA...CAGAAGGCCAGGGCTTTGTAAGTGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    531 TGAGTACCTGGAGATCTCTGACATCAAGCGAGACCAGTCCGGGGAGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1194991 TGAGTACCTGGAGATCTCTGACATCAAGCGAGACCAGTCCGGGGAGTACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    581 AATGCAGCGCGTTGAACGATGTCGCTGCGCCCGATGTGCGGAAAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1195041 AATGCAGCGCGTTGAACGATGTCGCTGCGCCCGATGTGCGGAAAGTAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    631 ATCACTGTAAACT         ATCCTCCCTATATCTCAAAAGCCAAGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
1195091 ATCACTGTAAACTGTG...CAGATCCTCCCTATATCTCAAAAGCCAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    672 CACTGGTGTTTCAGTCGGTCAGAAGGGCATCCTGAGCTGTGAAGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1195574 CACTGGTGTTTCAGTCGGTCAGAAGGGCATCCTGAGCTGTGAAGCCTCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    722 CAGTCCCCATGGCTGAATTCCAGTGGTTCAAGGAAGAAACCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
1195624 CAGTCCCCATGGCTGAATTCCAGTGGTTCAAGGAAGAAACCAGGTA...C

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765   GTTAGCCACTGGTCTGGATGGAATGAGGATTGAAAACAAAGGCCGCAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1196086 AGGTTAGCCACTGGTCTGGATGGAATGAGGATTGAAAACAAAGGCCGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    813 GTCCACTCTGACTTTCTTCAATGTTTCAGAAAAGGATTATGGGAACTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1196136 GTCCACTCTGACTTTCTTCAATGTTTCAGAAAAGGATTATGGGAACTATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    863 CTTGTGTGGCCACGAACAAGCTTGGGAACACCAATGCCAGCATCACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1196186 CTTGTGTGGCCACGAACAAGCTTGGGAACACCAATGCCAGCATCACATTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    913 TATG         GGCCTGGAGCAGTCATTGATGGTGTAAACTCGGCCTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1196236 TATGGTG...CAGGGCCTGGAGCAGTCATTGATGGTGTAAACTCGGCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    954 CAGAGCACTGGCTTGTCTCTGGCTATCAGGGACCCTCTTAGCCCACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1212069 CAGAGCACTGGCTTGTCTCTGGCTATCAGGGACCCTCTTAGCCCACTTCT

   1000     .    :
   1004 TCATCAAGTTT
        |||||||||||
1212119 TCATCAAGTTT