Result of SIM4 for
pF1KB4477
seq1 = pF1KB4477.tfa, 3447 bp
seq2 = pF1KB4477/gi568815589f_130614320.tfa (gi568815589f:130614320_130985680), 371361 bp
>pF1KB4477 3447
>gi568815589f:130614320_130985680 (Chr9)
1-136 (100001-100136) 100% ->
137-310 (239745-239918) 100% ->
311-606 (240482-240777) 100% ->
607-879 (248444-248716) 100% ->
880-964 (257810-257894) 100% ->
965-1142 (258541-258718) 100% ->
1143-1327 (260549-260733) 100% ->
1328-1480 (264096-264248) 100% ->
1481-1570 (265749-265838) 100% ->
1571-1735 (266181-266345) 100% ->
1736-3447 (269650-271361) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGGCAGCAGCCTGGAAAAGTACTTGGGGACCAAAGAAGGCCAAGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGGGCAGCAGCCTGGAAAAGTACTTGGGGACCAAAGAAGGCCAAGCTT
50 . : . : . : . : . :
51 GCCTGCCCTGCATTTTATCAAAGGAGCAGGGAAGAAGGAATCATCGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GCCTGCCCTGCATTTTATCAAAGGAGCAGGGAAGAAGGAATCATCGAGGC
100 . : . : . : . : . :
101 ATGGGGGTCCACACTGCAATGTTTTTGTGGAACATG AAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
100101 ATGGGGGTCCACACTGCAATGTTTTTGTGGAACATGGTG...CAGAAGCC
150 . : . : . : . : . :
142 CTTCAGCGGCCAGTAGCATCTGACTTTGAGCCTCAGGGTCTGAGTGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
239750 CTTCAGCGGCCAGTAGCATCTGACTTTGAGCCTCAGGGTCTGAGTGAAGC
200 . : . : . : . : . :
192 CGCTCGTTGGAACTCCAAGGAAAACCTTCTCGCTGGACCCAGTGAAAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
239800 CGCTCGTTGGAACTCCAAGGAAAACCTTCTCGCTGGACCCAGTGAAAATG
250 . : . : . : . : . :
242 ACCCCAACCTTTTCGTTGCACTGTATGATTTTGTGGCCAGTGGAGATAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
239850 ACCCCAACCTTTTCGTTGCACTGTATGATTTTGTGGCCAGTGGAGATAAC
300 . : . : . : . : . :
292 ACTCTAAGCATAACTAAAG GTGAAAAGCTCCGGGTCTTAGG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
239900 ACTCTAAGCATAACTAAAGGTA...CAGGTGAAAAGCTCCGGGTCTTAGG
350 . : . : . : . : . :
333 CTATAATCACAATGGGGAATGGTGTGAAGCCCAAACCAAAAATGGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
240504 CTATAATCACAATGGGGAATGGTGTGAAGCCCAAACCAAAAATGGCCAAG
400 . : . : . : . : . :
383 GCTGGGTCCCAAGCAACTACATCACGCCAGTCAACAGTCTGGAGAAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
240554 GCTGGGTCCCAAGCAACTACATCACGCCAGTCAACAGTCTGGAGAAACAC
450 . : . : . : . : . :
433 TCCTGGTACCATGGGCCTGTGTCCCGCAATGCCGCTGAGTATCTGCTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
240604 TCCTGGTACCATGGGCCTGTGTCCCGCAATGCCGCTGAGTATCTGCTGAG
500 . : . : . : . : . :
483 CAGCGGGATCAATGGCAGCTTCTTGGTGCGTGAGAGTGAGAGCAGTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
240654 CAGCGGGATCAATGGCAGCTTCTTGGTGCGTGAGAGTGAGAGCAGTCCTG
550 . : . : . : . : . :
533 GCCAGAGGTCCATCTCGCTGAGATACGAAGGGAGGGTGTACCATTACAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
240704 GCCAGAGGTCCATCTCGCTGAGATACGAAGGGAGGGTGTACCATTACAGG
600 . : . : . : . : . :
583 ATCAACACTGCTTCTGATGGCAAG CTCTACGTCTCCTCCGA
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
240754 ATCAACACTGCTTCTGATGGCAAGGTA...CAGCTCTACGTCTCCTCCGA
650 . : . : . : . : . :
624 GAGCCGCTTCAACACCCTGGCCGAGTTGGTTCATCATCATTCAACGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
248461 GAGCCGCTTCAACACCCTGGCCGAGTTGGTTCATCATCATTCAACGGTGG
700 . : . : . : . : . :
674 CCGACGGGCTCATCACCACGCTCCATTATCCAGCCCCAAAGCGCAACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
248511 CCGACGGGCTCATCACCACGCTCCATTATCCAGCCCCAAAGCGCAACAAG
750 . : . : . : . : . :
724 CCCACTGTCTATGGTGTGTCCCCCAACTACGACAAGTGGGAGATGGAACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
248561 CCCACTGTCTATGGTGTGTCCCCCAACTACGACAAGTGGGAGATGGAACG
800 . : . : . : . : . :
774 CACGGACATCACCATGAAGCACAAGCTGGGCGGGGGCCAGTACGGGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
248611 CACGGACATCACCATGAAGCACAAGCTGGGCGGGGGCCAGTACGGGGAGG
850 . : . : . : . : . :
824 TGTACGAGGGCGTGTGGAAGAAATACAGCCTGACGGTGGCCGTGAAGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
248661 TGTACGAGGGCGTGTGGAAGAAATACAGCCTGACGGTGGCCGTGAAGACC
900 . : . : . : . : . :
874 TTGAAG GAGGACACCATGGAGGTGGAAGAGTTCTTGAAAGA
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
248711 TTGAAGGTA...CAGGAGGACACCATGGAGGTGGAAGAGTTCTTGAAAGA
950 . : . : . : . : . :
915 AGCTGCAGTCATGAAAGAGATCAAACACCCTAACCTGGTGCAGCTCCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
257845 AGCTGCAGTCATGAAAGAGATCAAACACCCTAACCTGGTGCAGCTCCTTG
1000 . : . : . : . : . :
965 GGGTCTGCACCCGGGAGCCCCCGTTCTATATCATCACTGAG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
257895 GTG...CAGGGGTCTGCACCCGGGAGCCCCCGTTCTATATCATCACTGAG
1050 . : . : . : . : . :
1006 TTCATGACCTACGGGAACCTCCTGGACTACCTGAGGGAGTGCAACCGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
258582 TTCATGACCTACGGGAACCTCCTGGACTACCTGAGGGAGTGCAACCGGCA
1100 . : . : . : . : . :
1056 GGAGGTGAACGCCGTGGTGCTGCTGTACATGGCCACTCAGATCTCGTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
258632 GGAGGTGAACGCCGTGGTGCTGCTGTACATGGCCACTCAGATCTCGTCAG
1150 . : . : . : . : . :
1106 CCATGGAGTACCTGGAGAAGAAAAACTTCATCCACAG AGAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
258682 CCATGGAGTACCTGGAGAAGAAAAACTTCATCCACAGGTA...TAGAGAT
1200 . : . : . : . : . :
1147 CTTGCTGCCCGAAACTGCCTGGTAGGGGAGAACCACTTGGTGAAGGTAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
260553 CTTGCTGCCCGAAACTGCCTGGTAGGGGAGAACCACTTGGTGAAGGTAGC
1250 . : . : . : . : . :
1197 TGATTTTGGCCTGAGCAGGTTGATGACAGGGGACACCTACACAGCCCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
260603 TGATTTTGGCCTGAGCAGGTTGATGACAGGGGACACCTACACAGCCCATG
1300 . : . : . : . : . :
1247 CTGGAGCCAAGTTCCCCATCAAATGGACTGCACCCGAGAGCCTGGCCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
260653 CTGGAGCCAAGTTCCCCATCAAATGGACTGCACCCGAGAGCCTGGCCTAC
1350 . : . : . : . : . :
1297 AACAAGTTCTCCATCAAGTCCGACGTCTGGG CATTTGGAGT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
260703 AACAAGTTCTCCATCAAGTCCGACGTCTGGGGTA...CAGCATTTGGAGT
1400 . : . : . : . : . :
1338 ATTGCTTTGGGAAATTGCTACCTATGGCATGTCCCCTTACCCGGGAATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
264106 ATTGCTTTGGGAAATTGCTACCTATGGCATGTCCCCTTACCCGGGAATTG
1450 . : . : . : . : . :
1388 ACCTGTCCCAGGTGTATGAGCTGCTAGAGAAGGACTACCGCATGGAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
264156 ACCTGTCCCAGGTGTATGAGCTGCTAGAGAAGGACTACCGCATGGAGCGC
1500 . : . : . : . : . :
1438 CCAGAAGGCTGCCCAGAGAAGGTCTATGAACTCATGCGAGCAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
264206 CCAGAAGGCTGCCCAGAGAAGGTCTATGAACTCATGCGAGCATGTA...C
1550 . : . : . : . : . :
1481 GTTGGCAGTGGAATCCCTCTGACCGGCCCTCCTTTGCTGAAATCCACC
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
265747 AGGTTGGCAGTGGAATCCCTCTGACCGGCCCTCCTTTGCTGAAATCCACC
1600 . : . : . : . : . :
1529 AAGCCTTTGAAACAATGTTCCAGGAATCCAGTATCTCAGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
265797 AAGCCTTTGAAACAATGTTCCAGGAATCCAGTATCTCAGACGGTA...TA
1650 . : . : . : . : . :
1571 AAGTGGAAAAGGAGCTGGGGAAACAAGGCGTCCGTGGGGCTGTGAGTAC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
266180 GAAGTGGAAAAGGAGCTGGGGAAACAAGGCGTCCGTGGGGCTGTGAGTAC
1700 . : . : . : . : . :
1620 CTTGCTGCAGGCCCCAGAGCTGCCCACCAAGACGAGGACCTCCAGGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
266230 CTTGCTGCAGGCCCCAGAGCTGCCCACCAAGACGAGGACCTCCAGGAGAG
1750 . : . : . : . : . :
1670 CTGCAGAGCACAGAGACACCACTGACGTGCCTGAGATGCCTCACTCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
266280 CTGCAGAGCACAGAGACACCACTGACGTGCCTGAGATGCCTCACTCCAAG
1800 . : . : . : . : . :
1720 GGCCAGGGAGAGAGCG ATCCTCTGGACCATGAGCCTGCCGT
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
266330 GGCCAGGGAGAGAGCGGTA...CAGATCCTCTGGACCATGAGCCTGCCGT
1850 . : . : . : . : . :
1761 GTCTCCATTGCTCCCTCGAAAAGAGCGAGGTCCCCCGGAGGGCGGCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
269675 GTCTCCATTGCTCCCTCGAAAAGAGCGAGGTCCCCCGGAGGGCGGCCTGA
1900 . : . : . : . : . :
1811 ATGAAGATGAGCGCCTTCTCCCCAAAGACAAAAAGACCAACTTGTTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
269725 ATGAAGATGAGCGCCTTCTCCCCAAAGACAAAAAGACCAACTTGTTCAGC
1950 . : . : . : . : . :
1861 GCCTTGATCAAGAAGAAGAAGAAGACAGCCCCAACCCCTCCCAAACGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
269775 GCCTTGATCAAGAAGAAGAAGAAGACAGCCCCAACCCCTCCCAAACGCAG
2000 . : . : . : . : . :
1911 CAGCTCCTTCCGGGAGATGGACGGCCAGCCGGAGCGCAGAGGGGCCGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
269825 CAGCTCCTTCCGGGAGATGGACGGCCAGCCGGAGCGCAGAGGGGCCGGCG
2050 . : . : . : . : . :
1961 AGGAAGAGGGCCGAGACATCAGCAACGGGGCACTGGCTTTCACCCCCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
269875 AGGAAGAGGGCCGAGACATCAGCAACGGGGCACTGGCTTTCACCCCCTTG
2100 . : . : . : . : . :
2011 GACACAGCTGACCCAGCCAAGTCCCCAAAGCCCAGCAATGGGGCTGGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
269925 GACACAGCTGACCCAGCCAAGTCCCCAAAGCCCAGCAATGGGGCTGGGGT
2150 . : . : . : . : . :
2061 CCCCAATGGAGCCCTCCGGGAGTCCGGGGGCTCAGGCTTCCGGTCTCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
269975 CCCCAATGGAGCCCTCCGGGAGTCCGGGGGCTCAGGCTTCCGGTCTCCCC
2200 . : . : . : . : . :
2111 ACCTGTGGAAGAAGTCCAGCACGCTGACCAGCAGCCGCCTAGCCACCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270025 ACCTGTGGAAGAAGTCCAGCACGCTGACCAGCAGCCGCCTAGCCACCGGC
2250 . : . : . : . : . :
2161 GAGGAGGAGGGCGGTGGCAGCTCCAGCAAGCGCTTCCTGCGCTCTTGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270075 GAGGAGGAGGGCGGTGGCAGCTCCAGCAAGCGCTTCCTGCGCTCTTGCTC
2300 . : . : . : . : . :
2211 CGCCTCCTGCGTTCCCCATGGGGCCAAGGACACGGAGTGGAGGTCAGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270125 CGCCTCCTGCGTTCCCCATGGGGCCAAGGACACGGAGTGGAGGTCAGTCA
2350 . : . : . : . : . :
2261 CGCTGCCTCGGGACTTGCAGTCCACGGGAAGACAGTTTGACTCGTCCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270175 CGCTGCCTCGGGACTTGCAGTCCACGGGAAGACAGTTTGACTCGTCCACA
2400 . : . : . : . : . :
2311 TTTGGAGGGCACAAAAGTGAGAAGCCGGCTCTGCCTCGGAAGAGGGCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270225 TTTGGAGGGCACAAAAGTGAGAAGCCGGCTCTGCCTCGGAAGAGGGCAGG
2450 . : . : . : . : . :
2361 GGAGAACAGGTCTGACCAGGTGACCCGAGGCACAGTAACGCCTCCCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270275 GGAGAACAGGTCTGACCAGGTGACCCGAGGCACAGTAACGCCTCCCCCCA
2500 . : . : . : . : . :
2411 GGCTGGTGAAAAAGAATGAGGAAGCTGCTGATGAGGTCTTCAAAGACATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270325 GGCTGGTGAAAAAGAATGAGGAAGCTGCTGATGAGGTCTTCAAAGACATC
2550 . : . : . : . : . :
2461 ATGGAGTCCAGCCCGGGCTCCAGCCCGCCCAACCTGACTCCAAAACCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270375 ATGGAGTCCAGCCCGGGCTCCAGCCCGCCCAACCTGACTCCAAAACCCCT
2600 . : . : . : . : . :
2511 CCGGCGGCAGGTCACCGTGGCCCCTGCCTCGGGCCTCCCCCACAAGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270425 CCGGCGGCAGGTCACCGTGGCCCCTGCCTCGGGCCTCCCCCACAAGGAAG
2650 . : . : . : . : . :
2561 AAGCTGGAAAGGGCAGTGCCTTAGGGACCCCTGCTGCAGCTGAGCCAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270475 AAGCTGGAAAGGGCAGTGCCTTAGGGACCCCTGCTGCAGCTGAGCCAGTG
2700 . : . : . : . : . :
2611 ACCCCCACCAGCAAAGCAGGCTCAGGTGCACCAGGGGGCACCAGCAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270525 ACCCCCACCAGCAAAGCAGGCTCAGGTGCACCAGGGGGCACCAGCAAGGG
2750 . : . : . : . : . :
2661 CCCCGCCGAGGAGTCCAGAGTGAGGAGGCACAAGCACTCCTCTGAGTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270575 CCCCGCCGAGGAGTCCAGAGTGAGGAGGCACAAGCACTCCTCTGAGTCGC
2800 . : . : . : . : . :
2711 CAGGGAGGGACAAGGGGAAATTGTCCAGGCTCAAACCTGCCCCGCCGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270625 CAGGGAGGGACAAGGGGAAATTGTCCAGGCTCAAACCTGCCCCGCCGCCC
2850 . : . : . : . : . :
2761 CCACCAGCAGCCTCTGCAGGGAAGGCTGGAGGAAAGCCCTCGCAGAGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270675 CCACCAGCAGCCTCTGCAGGGAAGGCTGGAGGAAAGCCCTCGCAGAGCCC
2900 . : . : . : . : . :
2811 GAGCCAGGAGGCGGCCGGGGAGGCAGTCCTGGGCGCAAAGACAAAAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270725 GAGCCAGGAGGCGGCCGGGGAGGCAGTCCTGGGCGCAAAGACAAAAGCCA
2950 . : . : . : . : . :
2861 CGAGTCTGGTTGATGCTGTGAACAGTGACGCTGCCAAGCCCAGCCAGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270775 CGAGTCTGGTTGATGCTGTGAACAGTGACGCTGCCAAGCCCAGCCAGCCG
3000 . : . : . : . : . :
2911 GGAGAGGGCCTCAAAAAGCCCGTGCTCCCGGCCACTCCAAAGCCACAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270825 GGAGAGGGCCTCAAAAAGCCCGTGCTCCCGGCCACTCCAAAGCCACAGTC
3050 . : . : . : . : . :
2961 CGCCAAGCCGTCGGGGACCCCCATCAGCCCAGCCCCCGTTCCCTCCACGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270875 CGCCAAGCCGTCGGGGACCCCCATCAGCCCAGCCCCCGTTCCCTCCACGT
3100 . : . : . : . : . :
3011 TGCCATCAGCATCCTCGGCCCTGGCAGGGGACCAGCCGTCTTCCACCGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270925 TGCCATCAGCATCCTCGGCCCTGGCAGGGGACCAGCCGTCTTCCACCGCC
3150 . : . : . : . : . :
3061 TTCATCCCTCTCATATCAACCCGAGTGTCTCTTCGGAAAACCCGCCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
270975 TTCATCCCTCTCATATCAACCCGAGTGTCTCTTCGGAAAACCCGCCAGCC
3200 . : . : . : . : . :
3111 TCCAGAGCGGATCGCCAGCGGCGCCATCACCAAGGGCGTGGTCCTGGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271025 TCCAGAGCGGATCGCCAGCGGCGCCATCACCAAGGGCGTGGTCCTGGACA
3250 . : . : . : . : . :
3161 GCACCGAGGCGCTGTGCCTCGCCATCTCTAGGAACTCCGAGCAGATGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271075 GCACCGAGGCGCTGTGCCTCGCCATCTCTAGGAACTCCGAGCAGATGGCC
3300 . : . : . : . : . :
3211 AGCCACAGCGCAGTGCTGGAGGCCGGCAAAAACCTCTACACGTTCTGCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271125 AGCCACAGCGCAGTGCTGGAGGCCGGCAAAAACCTCTACACGTTCTGCGT
3350 . : . : . : . : . :
3261 GAGCTATGTGGATTCCATCCAGCAAATGAGGAACAAGTTTGCCTTCCGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271175 GAGCTATGTGGATTCCATCCAGCAAATGAGGAACAAGTTTGCCTTCCGAG
3400 . : . : . : . : . :
3311 AGGCCATCAACAAACTGGAGAATAATCTCCGGGAGCTTCAGATCTGCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271225 AGGCCATCAACAAACTGGAGAATAATCTCCGGGAGCTTCAGATCTGCCCG
3450 . : . : . : . : . :
3361 GCGACAGCAGGCAGTGGTCCAGCGGCCACTCAGGACTTCAGCAAGCTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271275 GCGACAGCAGGCAGTGGTCCAGCGGCCACTCAGGACTTCAGCAAGCTCCT
3500 . : . : . : .
3411 CAGTTCGGTGAAGGAAATCAGTGACATAGTGCAGAGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271325 CAGTTCGGTGAAGGAAATCAGTGACATAGTGCAGAGG