seq1 = pF1KB4450.tfa, 1140 bp
seq2 = pF1KB4450/gi568815587r_57135865.tfa (gi568815587r:57135865_57337004), 201140 bp

>pF1KB4450 1140
>gi568815587r:57135865_57337004 (Chr11)

(complement)

1-1140  (100001-101140)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAAGGTGGTGATTTTGACAACTACTATGGGGCAGACAACCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAAGGTGGTGATTTTGACAACTACTATGGGGCAGACAACCAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGTGTGAGTACACAGACTGGAAATCCTCGGGGGCCCTCATCCCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGTGTGAGTACACAGACTGGAAATCCTCGGGGGCCCTCATCCCTGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACATGTTGGTCTTCCTCCTGGGCACCACGGGAAACGGTCTGGTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100101 TCTACATGTTGGTCTTCCTCCTGGGCACCACGGGCAACGGTCTGGTGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGACCGTGTTTCGGAGCAGCCGGGAGAAGAGGCGCTCAGCTGATATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGACCGTGTTTCGGAGCAGCCGGGAGAAGAGGCGCTCAGCTGATATCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTGCTAGCCTGGCGGTGGCTGACCTGACCTTCGTGGTGACGCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATTGCTAGCCTGGCGGTGGCTGACCTGACCTTCGTGGTGACGCTGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTGGGCTACCTACACGTACCGGGACTATGACTGGCCCTTTGGGACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTGGGCTACCTACACGTACCGGGACTATGACTGGCCCTTTGGGACCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTGCAAGCTCAGCAGCTACCTCATCTTCGTCAACATGTACGCCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTGCAAGCTCAGCAGCTACCTCATCTTCGTCAACATGTACGCCAGCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCTGCCTCACCGGCCTCAGCTTCGACCGCTACCTGGCCATCGTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCTGCCTCACCGGCCTCAGCTTCGACCGCTACCTGGCCATCGTGAGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGTGGCCAATGCTCGGCTGAGGCTGCGGGTCAGCGGGGCCGTGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGTGGCCAATGCTCGGCTGAGGCTGCGGGTCAGCGGGGCCGTGGCCACG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCAGTTCTTTGGGTGCTGGCCGCCCTCCTGGCCATGCCTGTCATGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAGTTCTTTGGGTGCTGGCCGCCCTCCTGGCCATGCCTGTCATGGTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACGCACCACCGGGGACTTGGAGAACACCACTAAGGTGCAGTGCTACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACGCACCACCGGGGACTTGGAGAACACCACTAAGGTGCAGTGCTACATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTACTCCATGGTGGCCACTGTGAGCTCAGAGTGGGCCTGGGAGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTACTCCATGGTGGCCACTGTGAGCTCAGAGTGGGCCTGGGAGGTGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTTGGGGTCTCGTCCACCACCGTGGGCTTTGTGGTGCCCTTCACCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTTGGGGTCTCGTCCACCACCGTGGGCTTTGTGGTGCCCTTCACCATCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTGACCTGTTACTTCTTCATCGCCCAAACCATCGCTGGCCACTTCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTGACCTGTTACTTCTTCATCGCCCAAACCATCGCTGGCCACTTCCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGAACGCATCGAGGGCCTGCGGAAGCGGCGCCGGCTGCTCAGCATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGAACGCATCGAGGGCCTGCGGAAGCGGCGCCGGCTGCTCAGCATCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGGTGCTGGTGGTGACCTTTGCCCTGTGCTGGATGCCCTACCACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGGTGCTGGTGGTGACCTTTGCCCTGTGCTGGATGCCCTACCACCTGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAAGACGCTGTACATGCTGGGCAGCCTGCTGCACTGGCCCTGTGACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAAGACGCTGTACATGCTGGGCAGCCTGCTGCACTGGCCCTGTGACTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCTCTTCCTCATGAACATCTTCCCCTACTGCACCTGCATCAGCTACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCTCTTCCTCATGAACATCTTCCCCTACTGCACCTGCATCAGCTACGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACAGCTGCCTCAACCCCTTCCTCTATGCCTTTTTCGACCCCCGCTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACAGCTGCCTCAACCCCTTCCTCTATGCCTTTTTCGACCCCCGCTTCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCAGGCCTGCACCTCCATGCTCTGCTGTGGCCAGAGCAGGTGCGCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCAGGCCTGCACCTCCATGCTCTGCTGTGGCCAGAGCAGGTGCGCAGGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCTCCCACAGCAGCAGTGGGGAGAAGTCAGCCAGCTACTCTTCGGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCTCCCACAGCAGCAGTGGGGAGAAGTCAGCCAGCTACTCTTCGGGGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGCCAGGGGCCCGGCCCCAACATGGGCAAGGGTGGAGAACAGATGCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGCCAGGGGCCCGGCCCCAACATGGGCAAGGGTGGAGAACAGATGCACGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GAAATCCATCCCCTACAGCCAGGAGACCCTTGTGGTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GAAATCCATCCCCTACAGCCAGGAGACCCTTGTGGTTGAC