seq1 = pF1KB4415.tfa, 390 bp
seq2 = pF1KB4415/gi568815592f_26024233.tfa (gi568815592f:26024233_26224622), 200390 bp

>pF1KB4415 390
>gi568815592f:26024233_26224622 (Chr6)

1-390  (100001-100390)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGGACGTGGTAAGCAAGGAGGCAAAGCTCGCGCCAAAGCGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGGACGTGGTAAGCAAGGAGGCAAAGCTCGCGCCAAAGCGAAATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCTCTTCTCGCGCTGGTCTCCAGTTCCCGGTGGGCCGAGTGCACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCTCTTCTCGCGCTGGTCTCCAGTTCCCGGTGGGCCGAGTGCACCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTCCGTAAAGGCAACTACGCAGAGCGGGTTGGGGCAGGCGCGCCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTCCGTAAAGGCAACTACGCAGAGCGGGTTGGGGCAGGCGCGCCGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACCTGGCGGCGGTGTTAGAGTATCTGACCGCCGAGATCCTGGAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACCTGGCGGCGGTGTTAGAGTACCTGACCGCCGAGATCCTGGAGCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCAACGCGGCTCGCGACAACAAGAAGACTCGCATCATCCCGCGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCAACGCGGCTCGCGACAACAAGAAGACTCGCATCATCCCGCGCCACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCAGCTGGCCATCCGCAACGACGAGGAGCTCAACAAACTGCTAGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCAGCTGGCCATCCGCAACGACGAGGAGCTCAACAAACTGCTAGGCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGACCATTGCTCAGGGCGGCGTCCTTCCTAACATCCAGGCCGTGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGACCATTGCTCAGGGCGGCGTCCTTCCTAACATCCAGGCCGTGCTTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCTAAGAAGACCGAGAGTCACCACAAGGCCAAGGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCTAAGAAGACCGAGAGTCACCACAAGGCCAAGGGCAAG