seq1 = pF1KB4411.tfa, 558 bp
seq2 = pF1KB4411/gi568815576r_36658314.tfa (gi568815576r:36658314_36867865), 209552 bp

>pF1KB4411 558
>gi568815576r:36658314_36867865 (Chr22)

(complement)

1-34  (92159-92192)   100% ->
35-114  (100004-100083)   100% ->
115-174  (100501-100560)   100% ->
175-234  (101669-101728)   100% ->
235-352  (103830-103947)   100% ->
353-462  (104853-104962)   100% ->
463-558  (109457-109552)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGAAGCTGGCAGCCAAATGCATCCTGGCAG         GAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  92159 ATGGTGAAGCTGGCAGCCAAATGCATCCTGGCAGGTG...CAGGAGACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGCAGTGGGCAAGACCGCCCTGGCACAGATCTTCCGCAGTGATGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100011 AGCAGTGGGCAAGACCGCCCTGGCACAGATCTTCCGCAGTGATGGAGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTTCCAGAAAAGCTACACCCTG         ACAACAGGAATGGATTTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100061 ATTTCCAGAAAAGCTACACCCTGGTG...CAGACAACAGGAATGGATTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTGGTGAAGACAGTGCCAGTTCCTGACACGGGAGACAGTGTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100519 GTGGTGAAGACAGTGCCAGTTCCTGACACGGGAGACAGTGTGGTG...TA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    175  GAACTCTTCATTTTTGACTCTGCTGGCAAGGAGCTGTTTTCGGAAATGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101668 GGAACTCTTCATTTTTGACTCTGCTGGCAAGGAGCTGTTTTCGGAAATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGGATAAATTG         TGGGAGAGTCCCAATGTCTTATGTCTCGTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101718 TGGATAAATTGGCA...CAGTGGGAGAGTCCCAATGTCTTATGTCTCGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 TATGATGTGACCAATGAAGAATCCTTCAACAACTGCAGCAAGTGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103860 TATGATGTGACCAATGAAGAATCCTTCAACAACTGCAGCAAGTGGCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GAAGGCTCGGTCACAGGCTCCAGGCATCTCTCTCCCAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103910 GAAGGCTCGGTCACAGGCTCCAGGCATCTCTCTCCCAGGTA...TAGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 TTTTAGTTGGGAACAAGACAGACCTGGCCGGCAGACGAGCAGTGGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104856 TTTTAGTTGGGAACAAGACAGACCTGGCCGGCAGACGAGCAGTGGACTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GCTGAGGCCCGGGCATGGGCGCTGGGCCAGGGCCTGGAATGTTTTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104906 GCTGAGGCCCGGGCATGGGCGCTGGGCCAGGGCCTGGAATGTTTTGAAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 ATCCGTG         AAAGAGATGGAAAACTTCGAAGCCCCTTTCCACT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104956 ATCCGTGGTG...CAGAAAGAGATGGAAAACTTCGAAGCCCCTTTCCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GCCTTGCCAAGCAGTTCCACCAGCTGTACCGGGAGAAGGTGGAGGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109491 GCCTTGCCAAGCAGTTCCACCAGCTGTACCGGGAGAAGGTGGAGGTTTTC

    600     .    :
    547 CGGGCCCTGGCA
        ||||||||||||
 109541 CGGGCCCTGGCA