seq1 = pF1KB4401.tfa, 609 bp
seq2 = pF1KB4401/gi568815587r_82882168.tfa (gi568815587r:82882168_83097316), 215149 bp

>pF1KB4401 609
>gi568815587r:82882168_83097316 (Chr11)

(complement)

1-93  (100001-100093)   100% ->
94-177  (103195-103278)   100% ->
178-361  (109547-109730)   100% ->
362-609  (114902-115149)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTATGGAAGATTATGATTTCCTGTTCAAAATTGTTTTAATTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTATGGAAGATTATGATTTCCTGTTCAAAATTGTTTTAATTGGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCTGGTGTGGGGAAGACGTGCCTCGTCCGAAGATTCACTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 CGCTGGTGTGGGGAAGACGTGCCTCGTCCGAAGATTCACTCAGGTA...C

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   GGTCTTTTCCCCCCAGGTCAAGGAGCCACAATTGGAGTTGATTTTATG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103193 AGGGTCTTTTCCCCCCAGGTCAAGGAGCCACAATTGGAGTTGATTTTATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTAAGACAGTGGAGATTAATGGTGAAAAAGTAAAG         CTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103243 ATTAAGACAGTGGAGATTAATGGTGAAAAAGTAAAGGTA...CAGCTACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATCTGGGACACAGCAGGTCAAGAGAGATTTCGGTCCATTACCCAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109552 GATCTGGGACACAGCAGGTCAAGAGAGATTTCGGTCCATTACCCAGAGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTACCGAAGCGCCAATGCCTTGATCCTCACCTATGACATTACCTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109602 ACTACCGAAGCGCCAATGCCTTGATCCTCACCTATGACATTACCTGTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAATCCTTCCGTTGCCTTCCTGAGTGGCTGCGGGAGATAGAACAATATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109652 GAATCCTTCCGTTGCCTTCCTGAGTGGCTGCGGGAGATAGAACAATATGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGCAACAAGGTCATCACTGTGTTAGTGG         GCAACAAGATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109702 CAGCAACAAGGTCATCACTGTGTTAGTGGGTA...TAGGCAACAAGATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACCTGGCTGAAAGGAGAGAGGTTTCCCAGCAGCGAGCTGAAGAATTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114914 ACCTGGCTGAAAGGAGAGAGGTTTCCCAGCAGCGAGCTGAAGAATTCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGCTCAGGACATGTATTATCTGGAGACCTCAGCCAAGGAATCTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114964 GAAGCTCAGGACATGTATTATCTGGAGACCTCAGCCAAGGAATCTGATAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTGGAGAAACTCTTCCTTGACTTAGCATGCCGACTCATCAGTGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115014 TGTGGAGAAACTCTTCCTTGACTTAGCATGCCGACTCATCAGTGAAGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GACAGAACACACTTGTGAACAATGTATCCTCACCCTTACCTGGAGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115064 GACAGAACACACTTGTGAACAATGTATCCTCACCCTTACCTGGAGAAGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .
    574 AAAAGCATCAGCTATTTGACTTGTTGTAATTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115114 AAAAGCATCAGCTATTTGACTTGTTGTAATTTCAAC