seq1 = pF1KB4392.tfa, 1068 bp
seq2 = pF1KB4392/gi568815592r_31562269.tfa (gi568815592r:31562269_31764478), 202210 bp

>pF1KB4392 1068
>gi568815592r:31562269_31764478 (Chr6)

(complement)

1-626  (100001-100626)   100% ->
627-1068  (101769-102210)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCGGCCCTTGCTCATCACCTTCACCCCAGCCACTGACCCCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCGGCCCTTGCTCATCACCTTCACCCCAGCCACTGACCCCAGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTGGAAGGATGGGCAGCAGCAGCCACAGCCCGAGAAGCCAGAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCTGGAAGGATGGGCAGCAGCAGCCACAGCCCGAGAAGCCAGAGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGGATGGGGCTGCAGCCCGAGCTTTCTATGAGGCCCTGATTGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTGGATGGGGCTGCAGCCCGAGCTTTCTATGAGGCCCTGATTGGGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGAGCAGCGCTCCTGACTCCCAGAGATCTCAGACTGAACCTGCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGAGCAGCGCTCCTGACTCCCAGAGATCTCAGACTGAACCTGCCAGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAGAAAGAGAAAGAAAAGAAGAATAATGAAGGCACCAGCAGCAGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAGAAAGAGAAAGAAAAGAAGAATAATGAAGGCACCAGCAGCAGAAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCAGAAGGAGCATCAGGAAGACATGGACAAGGGAGATCCCTTGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCAGAAGGAGCATCAGGAAGACATGGACAAGGGAGATCCCTTGAGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGATAAGATGACTCACCGGATACTGAGGGCAGCCCAGGAGGGGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGATAAGATGACTCACCGGATACTGAGGGCAGCCCAGGAGGGGGACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCAGAACTTAGGAGACTGCTGGAACCGCATGAGGCAGGAGGAGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCAGAACTTAGGAGACTGCTGGAACCGCATGAGGCAGGAGGAGCTGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGAATATCAACGCCCGGGATGCCTTCTGGTGGACCCCACTGATGTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGAATATCAACGCCCGGGATGCCTTCTGGTGGACCCCACTGATGTGTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTCGAGCGGGCCAGGGGGCAGCTGTGAGCTATCTCCTGGGCCGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTCGAGCGGGCCAGGGGGCAGCTGTGAGCTATCTCCTGGGCCGTGGGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCCTGGGTGGGGGTCTGTGAGCTGAGTGGCAGGGATGCGGCTCAGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCCTGGGTGGGGGTCTGTGAGCTGAGTGGCAGGGATGCGGCTCAGCTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGAAGAAGCTGGCTTCCCTGAGGTAGCCCGCATGGTCAGGGAGAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGAAGAAGCTGGCTTCCCTGAGGTAGCCCGCATGGTCAGGGAGAGCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGAGAGACAAGGAGCCCGGAAAACCG         GTCTCCTACTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100601 GGAGAGACAAGGAGCCCGGAAAACCGGTA...CAGGTCTCCTACTCCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCTCCAGTACTGCGAGAACTGTGACACCCACTTCCAAGATTCCAACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101784 CCTCCAGTACTGCGAGAACTGTGACACCCACTTCCAAGATTCCAACCACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCACATCCACTGCTCACCTGCTGTCACTGTCGCAGGGTCCTCAGCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101834 GCACATCCACTGCTCACCTGCTGTCACTGTCGCAGGGTCCTCAGCCTCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AACCTTCCACTTGGGGTGCCCATCTCCAGCCCGGGCTTCAAACTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101884 AACCTTCCACTTGGGGTGCCCATCTCCAGCCCGGGCTTCAAACTGCTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GAGGGGGGGCTGGGAGCCAGGAATGGGGCTGGGACCCCGGGGTGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101934 GAGGGGGGGCTGGGAGCCAGGAATGGGGCTGGGACCCCGGGGTGAGGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GTGCCAATCCCATCCCCACTGTCCTCAAGAGAGACCAGGAAGGACTAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 101984 GTGCCAATCCCATCCCCACTGTCCTCAAGAGGGACCAGGAAGGACTAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TACAGATCAGCACCCCAGCCCCGAGTGACACATTTCCCAGCTTGGGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102034 TACAGATCAGCACCCCAGCCCCGAGTGACACATTTCCCAGCTTGGGATAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCGAGCTGTGGCTGGGAGGGAGAGACCCCCTCGGGTGGCCACACTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102084 CCGAGCTGTGGCTGGGAGGGAGAGACCCCCTCGGGTGGCCACACTGAGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GGAGGGAGGAGAGAAGGAGGGAGGAGAAAGACAGGGCTTGGGAGCGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102134 GGAGGGAGGAGAGAAGGAGGGAGGAGAAAGACAGGGCTTGGGAGCGGGAT

   1050     .    :    .    :    .
   1042 CTAAGGACTTACATGAACCTCGAGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||
 102184 CTAAGGACTTACATGAACCTCGAGTTC