seq1 = pF1KB4387.tfa, 2574 bp
seq2 = pF1KB4387/gi568815579f_10989549.tfa (gi568815579f:10989549_11229670), 240122 bp

>pF1KB4387 2574
>gi568815579f:10989549_11229670 (Chr19)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-190  (110675-110797)   100% ->
191-313  (113116-113238)   100% ->
314-694  (115672-116052)   100% ->
695-817  (117017-117139)   100% ->
818-940  (117844-117966)   100% ->
941-1060  (121104-121223)   100% ->
1061-1186  (121966-122091)   100% ->
1187-1358  (123730-123901)   100% ->
1359-1586  (123987-124214)   100% ->
1587-1705  (126546-126664)   100% ->
1706-1845  (127311-127450)   99% ->
1846-1987  (130544-130685)   100% ->
1988-2140  (130822-130974)   100% ->
2141-2311  (133626-133796)   100% ->
2312-2389  (138460-138537)   100% ->
2390-2547  (139965-140122)   100% ->
2548-2574  (141739-141765)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCCCTGGGGCTGGAAATTGCGCTGGACCGTCGCCTTGCTCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCCCTGGGGCTGGAAATTGCGCTGGACCGTCGCCTTGCTCCTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGGCGGGGACTGCAG         TGGGCGACAGATGCGAAAGAAACG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGGCGGGGACTGCAGGTA...CAGTGGGCGACAGATGCGAAAGAAACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTTCCAGTGCCAAGACGGGAAATGCATCTCCTACAAGTGGGTCTGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110699 AGTTCCAGTGCCAAGACGGGAAATGCATCTCCTACAAGTGGGTCTGCGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCAGCGCTGAGTGCCAGGATGGCTCTGATGAGTCCCAGGAGACGTGCT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 110749 GGCAGCGCTGAGTGCCAGGATGGCTCTGATGAGTCCCAGGAGACGTGCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         TGTCTGTCACCTGCAAATCCGGGGACTTCAGCTGTGGGGGCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110799 TG...TAGTGTCTGTCACCTGCAAATCCGGGGACTTCAGCTGTGGGGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGTCAACCGCTGCATTCCTCAGTTCTGGAGGTGCGATGGCCAAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113158 GTGTCAACCGCTGCATTCCTCAGTTCTGGAGGTGCGATGGCCAAGTGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCGACAACGGCTCAGACGAGCAAGGCTGTC         CCCCCAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 113208 TGCGACAACGGCTCAGACGAGCAAGGCTGTCGTA...CAGCCCCCAAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTGCTCCCAGGACGAGTTTCGCTGCCACGATGGGAAGTGCATCTCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115682 GTGCTCCCAGGACGAGTTTCGCTGCCACGATGGGAAGTGCATCTCTCGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGTTCGTCTGTGACTCAGACCGGGACTGCTTGGACGGCTCAGACGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115732 AGTTCGTCTGTGACTCAGACCGGGACTGCTTGGACGGCTCAGACGAGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCCTGCCCGGTGCTCACCTGTGGTCCCGCCAGCTTCCAGTGCAACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115782 TCCTGCCCGGTGCTCACCTGTGGTCCCGCCAGCTTCCAGTGCAACAGCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CACCTGCATCCCCCAGCTGTGGGCCTGCGACAACGACCCCGACTGCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115832 CACCTGCATCCCCCAGCTGTGGGCCTGCGACAACGACCCCGACTGCGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGGCTCGGATGAGTGGCCGCAGCGCTGTAGGGGTCTTTACGTGTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115882 ATGGCTCGGATGAGTGGCCGCAGCGCTGTAGGGGTCTTTACGTGTTCCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGGGACAGTAGCCCCTGCTCGGCCTTCGAGTTCCACTGCCTAAGTGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115932 GGGGACAGTAGCCCCTGCTCGGCCTTCGAGTTCCACTGCCTAAGTGGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTGCATCCACTCCAGCTGGCGCTGTGATGGTGGCCCCGACTGCAAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115982 GTGCATCCACTCCAGCTGGCGCTGTGATGGTGGCCCCGACTGCAAGGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AATCTGACGAGGAAAACTGCG         CTGTGGCCACCTGTCGCCCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 116032 AATCTGACGAGGAAAACTGCGGTA...CAGCTGTGGCCACCTGTCGCCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACGAATTCCAGTGCTCTGATGGAAACTGCATCCATGGCAGCCGGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117037 GACGAATTCCAGTGCTCTGATGGAAACTGCATCCATGGCAGCCGGCAGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGACCGGGAATATGACTGCAAGGACATGAGCGATGAAGTTGGCTGCGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117087 TGACCGGGAATATGACTGCAAGGACATGAGCGATGAAGTTGGCTGCGTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATG         TGACACTCTGCGAGGGACCCAACAAGTTCAAGTGTCAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117137 ATGGTG...CAGTGACACTCTGCGAGGGACCCAACAAGTTCAAGTGTCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGCGGCGAATGCATCACCCTGGACAAAGTCTGCAACATGGCTAGAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117882 AGCGGCGAATGCATCACCCTGGACAAAGTCTGCAACATGGCTAGAGACTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCGGGACTGGTCAGATGAACCCATCAAAGAGTGCG         GGACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 117932 CCGGGACTGGTCAGATGAACCCATCAAAGAGTGCGGTG...CAGGGACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACGAATGCTTGGACAACAACGGCGGCTGTTCCCACGTCTGCAATGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121110 ACGAATGCTTGGACAACAACGGCGGCTGTTCCCACGTCTGCAATGACCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AAGATCGGCTACGAGTGCCTGTGCCCCGACGGCTTCCAGCTGGTGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121160 AAGATCGGCTACGAGTGCCTGTGCCCCGACGGCTTCCAGCTGGTGGCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCGAAGATGCGAAG         ATATCGATGAGTGTCAGGATCCCGACA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 121210 GCGAAGATGCGAAGGTG...CAGATATCGATGAGTGTCAGGATCCCGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCTGCAGCCAGCTCTGCGTGAACCTGGAGGGTGGCTACAAGTGCCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121993 CCTGCAGCCAGCTCTGCGTGAACCTGGAGGGTGGCTACAAGTGCCAGTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GAGGAAGGCTTCCAGCTGGACCCCCACACGAAGGCCTGCAAGGCTGTGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 122043 GAGGAAGGCTTCCAGCTGGACCCCCACACGAAGGCCTGCAAGGCTGTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1187         GCTCCATCGCCTACCTCTTCTTCACCAACCGGCACGAGGTCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122093 TG...CAGGCTCCATCGCCTACCTCTTCTTCACCAACCGGCACGAGGTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GGAAGATGACGCTGGACCGGAGCGAGTACACCAGCCTCATCCCCAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123772 GGAAGATGACGCTGGACCGGAGCGAGTACACCAGCCTCATCCCCAACCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AGGAACGTGGTCGCTCTGGACACGGAGGTGGCCAGCAATAGAATCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123822 AGGAACGTGGTCGCTCTGGACACGGAGGTGGCCAGCAATAGAATCTACTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GTCTGACCTGTCCCAGAGAATGATCTGCAG         CACCCAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 123872 GTCTGACCTGTCCCAGAGAATGATCTGCAGGTG...CAGCACCCAGCTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 ACAGAGCCCACGGCGTCTCTTCCTATGACACCGTCATCAGCAGAGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123998 ACAGAGCCCACGGCGTCTCTTCCTATGACACCGTCATCAGCAGAGACATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CAGGCCCCCGACGGGCTGGCTGTGGACTGGATCCACAGCAACATCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124048 CAGGCCCCCGACGGGCTGGCTGTGGACTGGATCCACAGCAACATCTACTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GACCGACTCTGTCCTGGGCACTGTCTCTGTTGCGGATACCAAGGGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124098 GACCGACTCTGTCCTGGGCACTGTCTCTGTTGCGGATACCAAGGGCGTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AGAGGAAAACGTTATTCAGGGAGAACGGCTCCAAGCCAAGGGCCATCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124148 AGAGGAAAACGTTATTCAGGGAGAACGGCTCCAAGCCAAGGGCCATCGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GTGGATCCTGTTCATGG         CTTCATGTACTGGACTGACTGGGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 124198 GTGGATCCTGTTCATGGGTG...CAGCTTCATGTACTGGACTGACTGGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AACTCCCGCCAAGATCAAGAAAGGGGGCCTGAATGGTGTGGACATCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126570 AACTCCCGCCAAGATCAAGAAAGGGGGCCTGAATGGTGTGGACATCTACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CGCTGGTGACTGAAAACATTCAGTGGCCCAATGGCATCACCCTAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 126620 CGCTGGTGACTGAAAACATTCAGTGGCCCAATGGCATCACCCTAGGTA..

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706     ATCTCCTCAGTGGCCGCCTTTACTGGGTTGACTCCAAACTTCACTC
        .>>>||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 126670 .TAGATCTCCTCAGTGGCCGCCTCTACTGGGTTGACTCCAAACTTCACTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CATCTCAAGCATCGATGTCAACGGGGGCAACCGGAAGACCATCTTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127357 CATCTCAAGCATCGATGTCAACGGGGGCAACCGGAAGACCATCTTGGAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ATGAAAAGAGGCTGGCCCACCCCTTCTCCTTGGCCGTCTTTGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 127407 ATGAAAAGAGGCTGGCCCACCCCTTCTCCTTGGCCGTCTTTGAGGTG...

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1846    GACAAAGTATTTTGGACAGATATCATCAACGAAGCCATTTTCAGTGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130541 TAGGACAAAGTATTTTGGACAGATATCATCAACGAAGCCATTTTCAGTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CAACCGCCTCACAGGTTCCGATGTCAACTTGTTGGCTGAAAACCTACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130591 CAACCGCCTCACAGGTTCCGATGTCAACTTGTTGGCTGAAAACCTACTGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CCCCAGAGGATATGGTTCTCTTCCACAACCTCACCCAGCCAAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 130641 CCCCAGAGGATATGGTTCTCTTCCACAACCTCACCCAGCCAAGAGGTA..

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988     GAGTGAACTGGTGTGAGAGGACCACCCTGAGCAATGGCGGCTGCCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130691 .CAGGAGTGAACTGGTGTGAGAGGACCACCCTGAGCAATGGCGGCTGCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GTATCTGTGCCTCCCTGCCCCGCAGATCAACCCCCACTCGCCCAAGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130868 GTATCTGTGCCTCCCTGCCCCGCAGATCAACCCCCACTCGCCCAAGTTTA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 CCTGCGCCTGCCCGGACGGCATGCTGCTGGCCAGGGACATGAGGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130918 CCTGCGCCTGCCCGGACGGCATGCTGCTGGCCAGGGACATGAGGAGCTGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 CTCACAG         AGGCTGAGGCTGCAGTGGCCACCCAGGAGACATC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130968 CTCACAGGTG...CAGAGGCTGAGGCTGCAGTGGCCACCCAGGAGACATC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 CACCGTCAGGCTAAAGGTCAGCTCCACAGCCGTAAGGACACAGCACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133660 CACCGTCAGGCTAAAGGTCAGCTCCACAGCCGTAAGGACACAGCACACAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CCACCCGACCTGTTCCCGACACCTCCCGGCTGCCTGGGGCCACCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133710 CCACCCGACCTGTTCCCGACACCTCCCGGCTGCCTGGGGCCACCCCTGGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 CTCACCACGGTGGAGATAGTGACAATGTCTCACCAAG         CTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 133760 CTCACCACGGTGGAGATAGTGACAATGTCTCACCAAGGTA...CAGCTCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GGGCGACGTTGCTGGCAGAGGAAATGAGAAGAAGCCCAGTAGCGTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138464 GGGCGACGTTGCTGGCAGAGGAAATGAGAAGAAGCCCAGTAGCGTGAGGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 CTCTGTCCATTGTCCTCCCCATCG         TGCTCCTCGTCTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 138514 CTCTGTCCATTGTCCTCCCCATCGGTA...CAGTGCTCCTCGTCTTCCTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 TGCCTGGGGGTCTTCCTTCTATGGAAGAACTGGCGGCTTAAGAACATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139982 TGCCTGGGGGTCTTCCTTCTATGGAAGAACTGGCGGCTTAAGAACATCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 CAGCATCAACTTTGACAACCCCGTCTATCAGAAGACCACAGAGGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140032 CAGCATCAACTTTGACAACCCCGTCTATCAGAAGACCACAGAGGATGAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TCCACATTTGCCACAACCAGGACGGCTACAGCTACCCCTCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 140082 TCCACATTTGCCACAACCAGGACGGCTACAGCTACCCCTCGGTG...CAG

   2700     .    :    .    :    .
   2548 ATGGTCAGTCTGGAGGATGACGTGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||
 141739 ATGGTCAGTCTGGAGGATGACGTGGCG