Result of SIM4 for
pF1KB4367
seq1 = pF1KB4367.tfa, 3372 bp
seq2 = pF1KB4367/gi568815588f_31219235.tfa (gi568815588f:31219235_31627260), 408026 bp
>pF1KB4367 3372
>gi568815588f:31219235_31627260 (Chr10)
1-58 (100001-100058) 100% ->
59-259 (241803-242003) 100% ->
260-319 (276545-276604) 100% ->
320-481 (283114-283275) 100% ->
482-684 (291439-291641) 100% ->
685-790 (295369-295474) 100% ->
791-2601 (300892-302702) 100% ->
2602-2782 (304699-304879) 100% ->
2783-3372 (307438-308026) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGGATGGCCCCAGGTGTAAGCGCAGAAAGCAGGCGAACCCGCGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCGGATGGCCCCAGGTGTAAGCGCAGAAAGCAGGCGAACCCGCGGCG
50 . : . : . : . : . :
51 CAATAACG TTACAAATTATAATACTGTGGTAGAAACAAATT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CAATAACGGTG...CAGTTACAAATTATAATACTGTGGTAGAAACAAATT
100 . : . : . : . : . :
92 CAGATTCAGATGATGAAGACAAACTGCATATTGTGGAAGAAGAAAGTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241836 CAGATTCAGATGATGAAGACAAACTGCATATTGTGGAAGAAGAAAGTGTT
150 . : . : . : . : . :
142 ACAGATGCAGCTGACTGTGAAGGTGTACCAGAGGATGACCTGCCAACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241886 ACAGATGCAGCTGACTGTGAAGGTGTACCAGAGGATGACCTGCCAACAGA
200 . : . : . : . : . :
192 CCAGACAGTGTTACCAGGGAGGAGCAGTGAAAGAGAAGGGAATGCTAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241936 CCAGACAGTGTTACCAGGGAGGAGCAGTGAAAGAGAAGGGAATGCTAAGA
250 . : . : . : . : . :
242 ACTGCTGGGAGGATGACA GAAAGGAAGGGCAAGAAATCCTG
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
241986 ACTGCTGGGAGGATGACAGTA...CAGGAAAGGAAGGGCAAGAAATCCTG
300 . : . : . : . : . :
283 GGGCCTGAAGCTCAGGCAGATGAAGCAGGATGTACAG TAAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
276568 GGGCCTGAAGCTCAGGCAGATGAAGCAGGATGTACAGGTA...TAGTAAA
350 . : . : . : . : . :
324 AGATGATGAATGCGAGTCAGATGCAGAAAATGAGCAAAACCATGATCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
283118 AGATGATGAATGCGAGTCAGATGCAGAAAATGAGCAAAACCATGATCCTA
400 . : . : . : . : . :
374 ATGTTGAAGAGTTTCTACAACAACAAGACACTGCTGTCATTTTTCCTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
283168 ATGTTGAAGAGTTTCTACAACAACAAGACACTGCTGTCATTTTTCCTGAG
450 . : . : . : . : . :
424 GCACCTGAAGAGGACCAGAGGCAGGGCACACCAGAAGCCAGTGGTCATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
283218 GCACCTGAAGAGGACCAGAGGCAGGGCACACCAGAAGCCAGTGGTCATGA
500 . : . : . : . : . :
474 TGAAAATG GAACACCAGATGCATTTTCACAATTACTCACCT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
283268 TGAAAATGGTA...CAGGAACACCAGATGCATTTTCACAATTACTCACCT
550 . : . : . : . : . :
515 GTCCATATTGTGATAGAGGCTATAAACGCTTTACCTCTCTGAAAGAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
291472 GTCCATATTGTGATAGAGGCTATAAACGCTTTACCTCTCTGAAAGAACAC
600 . : . : . : . : . :
565 ATTAAATATCGTCATGAAAAGAATGAAGATAACTTTAGTTGCTCCCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
291522 ATTAAATATCGTCATGAAAAGAATGAAGATAACTTTAGTTGCTCCCTGTG
650 . : . : . : . : . :
615 CAGTTACACCTTTGCATACAGAACCCAACTTGAACGTCACATGACATCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
291572 CAGTTACACCTTTGCATACAGAACCCAACTTGAACGTCACATGACATCAC
700 . : . : . : . : . :
665 ATAAATCAGGAAGAGATCAA AGACATGTGACGCAGTCTGGG
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
291622 ATAAATCAGGAAGAGATCAAGTA...CAGAGACATGTGACGCAGTCTGGG
750 . : . : . : . : . :
706 TGTAATCGTAAATTCAAATGCACTGAGTGTGGAAAAGCTTTCAAATACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
295390 TGTAATCGTAAATTCAAATGCACTGAGTGTGGAAAAGCTTTCAAATACAA
800 . : . : . : . : . :
756 ACATCACCTAAAAGAGCACTTAAGAATTCACAGTG GAGAGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
295440 ACATCACCTAAAAGAGCACTTAAGAATTCACAGTGGTA...TAGGAGAGA
850 . : . : . : . : . :
797 AGCCATATGAATGCCCAAACTGCAAGAAACGCTTTTCCCATTCTGGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
300898 AGCCATATGAATGCCCAAACTGCAAGAAACGCTTTTCCCATTCTGGCTCC
900 . : . : . : . : . :
847 TATAGCTCACACATAAGCAGTAAGAAATGTATCAGCTTGATACCTGTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
300948 TATAGCTCACACATAAGCAGTAAGAAATGTATCAGCTTGATACCTGTGAA
950 . : . : . : . : . :
897 TGGGCGACCAAGAACAGGACTCAAGACATCTCAGTGTTCTTCACCGTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
300998 TGGGCGACCAAGAACAGGACTCAAGACATCTCAGTGTTCTTCACCGTCTC
1000 . : . : . : . : . :
947 TTTCAGCATCACCAGGCAGTCCCACACGACCACAGATACGGCAAAAGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301048 TTTCAGCATCACCAGGCAGTCCCACACGACCACAGATACGGCAAAAGATA
1050 . : . : . : . : . :
997 GAGAATAAACCCCTTCAAGAACAACTTTCTGTTAACCAAATTAAAACTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301098 GAGAATAAACCCCTTCAAGAACAACTTTCTGTTAACCAAATTAAAACTGA
1100 . : . : . : . : . :
1047 ACCTGTGGATTATGAATTCAAACCCATAGTGGTTGCTTCAGGAATCAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301148 ACCTGTGGATTATGAATTCAAACCCATAGTGGTTGCTTCAGGAATCAACT
1150 . : . : . : . : . :
1097 GTTCAACCCCTTTACAAAATGGGGTTTTCACTGGTGGTGGCCCATTACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301198 GTTCAACCCCTTTACAAAATGGGGTTTTCACTGGTGGTGGCCCATTACAG
1200 . : . : . : . : . :
1147 GCAACCAGTTCTCCTCAGGGCATGGTGCAAGCTGTTGTTCTGCCAACAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301248 GCAACCAGTTCTCCTCAGGGCATGGTGCAAGCTGTTGTTCTGCCAACAGT
1250 . : . : . : . : . :
1197 TGGTTTGGTGTCTCCCATAAGTATCAATTTAAGTGATATTCAGAATGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301298 TGGTTTGGTGTCTCCCATAAGTATCAATTTAAGTGATATTCAGAATGTAC
1300 . : . : . : . : . :
1247 TTAAAGTGGCGGTAGATGGTAATGTAATAAGGCAAGTGTTGGAGAATAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301348 TTAAAGTGGCGGTAGATGGTAATGTAATAAGGCAAGTGTTGGAGAATAAT
1350 . : . : . : . : . :
1297 CAAGCCAATCTTGCATCCAAAGAACAAGAAACAATCAATGCTTCACCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301398 CAAGCCAATCTTGCATCCAAAGAACAAGAAACAATCAATGCTTCACCCAT
1400 . : . : . : . : . :
1347 ACAACAAGGTGGCCATTCTGTTATTTCAGCCATCAGTCTTCCTTTGGTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301448 ACAACAAGGTGGCCATTCTGTTATTTCAGCCATCAGTCTTCCTTTGGTTG
1450 . : . : . : . : . :
1397 ATCAAGATGGAACAACCAAAATTATCATCAACTACAGTCTTGAGCAGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301498 ATCAAGATGGAACAACCAAAATTATCATCAACTACAGTCTTGAGCAGCCT
1500 . : . : . : . : . :
1447 AGCCAACTTCAAGTTGTTCCTCAAAATTTAAAAAAAGAAAATCCAGTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301548 AGCCAACTTCAAGTTGTTCCTCAAAATTTAAAAAAAGAAAATCCAGTCGC
1550 . : . : . : . : . :
1497 TACAAACAGTTGTAAAAGTGAAAAGTTACCAGAAGATCTTACTGTTAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301598 TACAAACAGTTGTAAAAGTGAAAAGTTACCAGAAGATCTTACTGTTAAGT
1600 . : . : . : . : . :
1547 CTGAGAAGGACAAAAGCTTTGAAGGGGGGGTGAATGATAGCACTTGTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301648 CTGAGAAGGACAAAAGCTTTGAAGGGGGGGTGAATGATAGCACTTGTCTT
1650 . : . : . : . : . :
1597 CTGTGTGATGATTGTCCAGGAGATATTAATGCACTTCCAGAATTAAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301698 CTGTGTGATGATTGTCCAGGAGATATTAATGCACTTCCAGAATTAAAGCA
1700 . : . : . : . : . :
1647 CTATGACCTAAAGCAGCCTACTCAGCCTCCTCCACTCCCTGCAGCAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301748 CTATGACCTAAAGCAGCCTACTCAGCCTCCTCCACTCCCTGCAGCAGAAG
1750 . : . : . : . : . :
1697 CTGAGAAGCCTGAGTCCTCTGTTTCATCAGCTACTGGAGATGGCAATTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301798 CTGAGAAGCCTGAGTCCTCTGTTTCATCAGCTACTGGAGATGGCAATTTG
1800 . : . : . : . : . :
1747 TCTCCTAGTCAGCCACCTTTAAAGAACCTCTTGTCTCTCCTAAAAGCATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301848 TCTCCTAGTCAGCCACCTTTAAAGAACCTCTTGTCTCTCCTAAAAGCATA
1850 . : . : . : . : . :
1797 TTATGCTTTGAATGCACAACCAAGTGCAGAAGAGCTCTCAAAAATTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301898 TTATGCTTTGAATGCACAACCAAGTGCAGAAGAGCTCTCAAAAATTGCTG
1900 . : . : . : . : . :
1847 ATTCAGTAAACCTACCACTGGATGTAGTAAAAAAGTGGTTTGAAAAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301948 ATTCAGTAAACCTACCACTGGATGTAGTAAAAAAGTGGTTTGAAAAGATG
1950 . : . : . : . : . :
1897 CAAGCTGGACAGATTTCAGTGCAGTCTTCTGAACCATCTTCTCCTGAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301998 CAAGCTGGACAGATTTCAGTGCAGTCTTCTGAACCATCTTCTCCTGAACC
2000 . : . : . : . : . :
1947 AGGCAAAGTAAATATCCCTGCCAAGAACAATGATCAGCCTCAATCTGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302048 AGGCAAAGTAAATATCCCTGCCAAGAACAATGATCAGCCTCAATCTGCAA
2050 . : . : . : . : . :
1997 ATGCAAATGAACCCCAGGACAGCACAGTAAATCTACAAAGTCCTTTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302098 ATGCAAATGAACCCCAGGACAGCACAGTAAATCTACAAAGTCCTTTGAAG
2100 . : . : . : . : . :
2047 ATGACTAACTCCCCAGTTTTACCAGTGGGATCAACCACCAATGGTTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302148 ATGACTAACTCCCCAGTTTTACCAGTGGGATCAACCACCAATGGTTCCAG
2150 . : . : . : . : . :
2097 AAGTAGTACACCATCCCCATCACCTCTAAACCTTTCCTCATCCAGAAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302198 AAGTAGTACACCATCCCCATCACCTCTAAACCTTTCCTCATCCAGAAATA
2200 . : . : . : . : . :
2147 CACAGGGTTACTTGTACACAGCTGAGGGTGCACAAGAAGAGCCACAAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302248 CACAGGGTTACTTGTACACAGCTGAGGGTGCACAAGAAGAGCCACAAGTA
2250 . : . : . : . : . :
2197 GAACCTCTTGATCTTTCACTACCAAAGCAACAGGGAGAATTATTAGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302298 GAACCTCTTGATCTTTCACTACCAAAGCAACAGGGAGAATTATTAGAAAG
2300 . : . : . : . : . :
2247 GTCAACTATCACTAGTGTTTACCAGAACAGTGTTTATTCTGTCCAGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302348 GTCAACTATCACTAGTGTTTACCAGAACAGTGTTTATTCTGTCCAGGAAG
2350 . : . : . : . : . :
2297 AACCCTTGAACTTGTCTTGCGCAAAAAAGGAGCCACAAAAGGACAGTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302398 AACCCTTGAACTTGTCTTGCGCAAAAAAGGAGCCACAAAAGGACAGTTGT
2400 . : . : . : . : . :
2347 GTTACAGACTCAGAACCAGTTGTAAATGTAATCCCACCAAGTGCCAACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302448 GTTACAGACTCAGAACCAGTTGTAAATGTAATCCCACCAAGTGCCAACCC
2450 . : . : . : . : . :
2397 CATAAATATCGCTATACCTACAGTCACTGCCCAGTTACCCACAATCGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302498 CATAAATATCGCTATACCTACAGTCACTGCCCAGTTACCCACAATCGTGG
2500 . : . : . : . : . :
2447 CCATTGCTGACCAGAACAGTGTTCCATGCTTAAGAGCGCTAGCTGCCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302548 CCATTGCTGACCAGAACAGTGTTCCATGCTTAAGAGCGCTAGCTGCCAAT
2550 . : . : . : . : . :
2497 AAGCAAACGATTCTGATTCCCCAGGTGGCATACACCTACTCAACTACGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302598 AAGCAAACGATTCTGATTCCCCAGGTGGCATACACCTACTCAACTACGGT
2600 . : . : . : . : . :
2547 CAGCCCTGCAGTCCAAGAACCACCCTTGAAAGTGATCCAGCCAAATGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302648 CAGCCCTGCAGTCCAAGAACCACCCTTGAAAGTGATCCAGCCAAATGGAA
2650 . : . : . : . : . :
2597 ATCAG GATGAAAGACAAGATACTAGCTCAGAAGGAGTATCA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302698 ATCAGGTA...TAGGATGAAAGACAAGATACTAGCTCAGAAGGAGTATCA
2700 . : . : . : . : . :
2638 AATGTAGAGGATCAGAATGACTCTGATTCTACACCGCCCAAAAAGAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
304735 AATGTAGAGGATCAGAATGACTCTGATTCTACACCGCCCAAAAAGAAAAT
2750 . : . : . : . : . :
2688 GCGGAAGACAGAAAATGGAATGTATGCTTGTGATTTGTGTGACAAGATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
304785 GCGGAAGACAGAAAATGGAATGTATGCTTGTGATTTGTGTGACAAGATAT
2800 . : . : . : . : . :
2738 TCCAAAAGAGTAGTTCATTATTGAGACATAAATATGAACACACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
304835 TCCAAAAGAGTAGTTCATTATTGAGACATAAATATGAACACACAGGTA..
2850 . : . : . : . : . :
2783 GTAAAAGACCTCATGAGTGTGGAATCTGTAAAAAGGCATTTAAACA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
304885 .CAGGTAAAAGACCTCATGAGTGTGGAATCTGTAAAAAGGCATTTAAACA
2900 . : . : . : . : . :
2829 CAAACATCATTTGATTGAACACATGCGATTACATTCTGGAGAAAAGCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307484 CAAACATCATTTGATTGAACACATGCGATTACATTCTGGAGAAAAGCCCT
2950 . : . : . : . : . :
2879 ATCAATGTGACAAATGTGGAAAGCGCTTCTCACACTCTGGGTCTTATTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307534 ATCAATGTGACAAATGTGGAAAGCGCTTCTCACACTCTGGGTCTTATTCT
3000 . : . : . : . : . :
2929 CAACACATGAATCATCGCTACTCCTACTGTAAGAGAGAAGCGGAAGAACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307584 CAACACATGAATCATCGCTACTCCTACTGTAAGAGAGAAGCGGAAGAACG
3050 . : . : . : . : . :
2979 TGACAGCACAGAGCAGGAAGAGGCAGGGCCTGAAATCCTCTCGAATGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307634 TGACAGCACAGAGCAGGAAGAGGCAGGGCCTGAAATCCTCTCGAATGAGC
3100 . : . : . : . : . :
3029 ACGTGGGTGCCAGGGCGTCTCCCTCACAGGGCGACTCGGACGAGAGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307684 ACGTGGGTGCCAGGGCGTCTCCCTCACAGGGCGACTCGGACGAGAGAGAG
3150 . : . : . : . : . :
3079 AGTTTGACAAGGGAAGAGGATGAAGACAGTGAAAAAGAGGAAGAGGAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307734 AGTTTGACAAGGGAAGAGGATGAAGACAGTGAAAAAGAGGAAGAGGAGGA
3200 . : . : . : . : . :
3129 GGATAAAGAGATGGAAGAATTGCAGGAAGAAAAAGAATGTGAAAAACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307784 GGATAAAGAGATGGAAGAATTGCAGGAAGAAAAAGAATGTGAAAAACCAC
3250 . : . : . : . : . :
3179 AAGGGGATGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGTGGAAGAAGAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307834 AAGGGGATGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGTGGAAGAAGAAGAG
3300 . : . : . : . : . :
3229 GTAGAAGAGGCAGAGAATGAGGGAGAAGAAGCAAAAACTGAAGGTCTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307884 GTAGAAGAGGCAGAGAATGAGGGAGAAGAAGCAAAAACTGAAGGTCTGAT
3350 . : . : . : . : . :
3279 GAAGGATGACAGGGCTGAAAGTCAAGCAAGCAGCTTAGGACAAAAAGTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307934 GAAGGATGACAGGGCTGAAAGTCAAGCAAGCAGCTTAGGACAAAAAGTAG
3400 . : . : . : . :
3329 GCGAGAGTAGTGAGCAAGTGTCTGAAGAAAAGACAAATGAAGCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-
307984 GCGAGAGTAGTGAGCAAGTGTCTGAAGAAAAGACAAATGAAGC