seq1 = pF1KB4351.tfa, 1080 bp
seq2 = pF1KB4351/gi568815576r_21669207.tfa (gi568815576r:21669207_21967410), 298204 bp

>pF1KB4351 1080
>gi568815576r:21669207_21967410 (Chr22)

(complement)

1-119  (99971-100089)   100% ->
120-302  (159565-159747)   100% ->
303-492  (161372-161561)   100% ->
493-609  (168283-168399)   100% ->
610-724  (178603-178717)   100% ->
725-856  (179023-179154)   100% ->
857-966  (194429-194538)   100% ->
967-1080  (198091-198204)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGCGCGGGCCCGGAGATGGTCCGCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99971 ATGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGCGCGGGCCCGGAGATGGTCCGCGGGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGTTCGACGTGGGGCCGCGCTACACCAACCTCTCGTACATCGGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100021 GGTGTTCGACGTGGGGCCGCGCTACACCAACCTCTCGTACATCGGCGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCCTACGGCATGGTGTG         CTCTGCTTATGATAATGTCAAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100071 GCGCCTACGGCATGGTGTGGTG...AAGCTCTGCTTATGATAATGTCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAGTTCGAGTAGCTATCAAGAAAATCAGCCCCTTTGAGCACCAGACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159587 AAAGTTCGAGTAGCTATCAAGAAAATCAGCCCCTTTGAGCACCAGACCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCCAGAGAACCCTGAGGGAGATAAAAATCTTACTGCGCTTCAGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159637 CTGCCAGAGAACCCTGAGGGAGATAAAAATCTTACTGCGCTTCAGACATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAACATCATTGGAATCAATGACATTATTCGAGCACCAACCATCGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159687 AGAACATCATTGGAATCAATGACATTATTCGAGCACCAACCATCGAGCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGAAAGATGT         ATATATAGTACAGGACCTCATGGAAACAGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 159737 ATGAAAGATGTGTA...CAGATATATAGTACAGGACCTCATGGAAACAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTTTACAAGCTCTTGAAGACACAACACCTCAGCAATGACCATATCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161402 TCTTTACAAGCTCTTGAAGACACAACACCTCAGCAATGACCATATCTGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATTTTCTCTACCAGATCCTCAGAGGGTTAAAATATATCCATTCAGCTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161452 ATTTTCTCTACCAGATCCTCAGAGGGTTAAAATATATCCATTCAGCTAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTTCTGCACCGTGACCTCAAGCCTTCCAACCTGCTGCTCAACACCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161502 GTTCTGCACCGTGACCTCAAGCCTTCCAACCTGCTGCTCAACACCACCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGATCTCAAG         ATCTGTGACTTTGGCCTGGCCCGTGTTGCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 161552 TGATCTCAAGGTC...TAGATCTGTGACTTTGGCCTGGCCCGTGTTGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCCAGACCATGATCACACAGGGTTCCTGACAGAATATGTGGCCACACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168314 ATCCAGACCATGATCACACAGGGTTCCTGACAGAATATGTGGCCACACGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGGTACAGGGCTCCAGAAATTATGTTGAATTCCAAG         GGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 168364 TGGTACAGGGCTCCAGAAATTATGTTGAATTCCAAGGTA...CAGGGCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACCAAGTCCATTGATATTTGGTCTGTAGGCTGCATTCTGGCAGAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178608 CACCAAGTCCATTGATATTTGGTCTGTAGGCTGCATTCTGGCAGAAATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTTCTAACAGGCCCATCTTTCCAGGGAAGCATTATCTTGACCAGCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178658 TTTCTAACAGGCCCATCTTTCCAGGGAAGCATTATCTTGACCAGCTGAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CACATTTTGG         GTATTCTTGGATCCCCATCACAAGAAGACCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 178708 CACATTTTGGGTA...TAGGTATTCTTGGATCCCCATCACAAGAAGACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAATTGTATAATAAATTTAAAAGCTAGGAACTATTTGCTTTCTCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179054 GAATTGTATAATAAATTTAAAAGCTAGGAACTATTTGCTTTCTCTTCCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACAAAAATAAGGTGCCATGGAACAGGCTGTTCCCAAATGCTGACTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179104 ACAAAAATAAGGTGCCATGGAACAGGCTGTTCCCAAATGCTGACTCCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 G         CTCTGGACTTATTGGACAAAATGTTGACATTCAACCCACA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179154 GGTA...TAGCTCTGGACTTATTGGACAAAATGTTGACATTCAACCCACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAAGAGGATTGAAGTAGAACAGGCTCTGGCCCACCCATATCTGGAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194469 CAAGAGGATTGAAGTAGAACAGGCTCTGGCCCACCCATATCTGGAGCAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATTACGACCCGAGTGACGAG         CCCATCGCCGAAGCACCATTC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 194519 ATTACGACCCGAGTGACGAGGTA...AAGCCCATCGCCGAAGCACCATTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAGTTCGACATGGAATTGGATGACTTGCCTAAGGAAAAGCTCAAAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198112 AAGTTCGACATGGAATTGGATGACTTGCCTAAGGAAAAGCTCAAAGAACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AATTTTTGAAGAGACTGCTAGATTCCAGCCAGGATACAGATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198162 AATTTTTGAAGAGACTGCTAGATTCCAGCCAGGATACAGATCT