seq1 = pF1KB4336.tfa, 3279 bp
seq2 = pF1KB4336/gi568815581f_38605633.tfa (gi568815581f:38605633_38825595), 219963 bp

>pF1KB4336 3279
>gi568815581f:38605633_38825595 (Chr17)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-189  (101318-101397)   100% ->
190-244  (101854-101908)   100% ->
245-354  (102131-102240)   100% ->
355-458  (103541-103644)   100% ->
459-552  (103850-103943)   100% ->
553-720  (106215-106382)   100% ->
721-819  (107059-107157)   100% ->
820-1036  (109980-110196)   100% ->
1037-1651  (110735-111349)   99% ->
1652-1833  (111800-111981)   100% ->
1834-1942  (112213-112321)   100% ->
1943-2009  (113885-113951)   100% ->
2010-2155  (114118-114263)   100% ->
2156-2353  (114740-114937)   100% ->
2354-2442  (115027-115115)   100% ->
2443-2792  (116246-116595)   100% ->
2793-2883  (117046-117136)   100% ->
2884-3240  (118988-119344)   100% ->
3241-3279  (119925-119963)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGAGATGGTAGGAGGCTGCTGCGTATGTTCGGACGAGAGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGAGATGGTAGGAGGCTGCTGCGTATGTTCGGACGAGAGGGGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGAGAACCCGCTGGTCTACTGCGATGGGCACGCGTGCAGCGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGAGAACCCGCTGGTCTACTGCGATGGGCACGCGTGCAGCGTGGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCACCAAG         CTTGCTATGGCATCGTTCAGGTGCCAACGGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCACCAAGGTA...CAGCTTGCTATGGCATCGTTCAGGTGCCAACGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCTGGTTCTGCCGGAAATGTGAATCTCAGGAGCGAGCAGCCAGGGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101350 CCCTGGTTCTGCCGGAAATGTGAATCTCAGGAGCGAGCAGCCAGGGTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190        AGGTGTGAGCTGTGCCCACACAAAGACGGGGCATTGAAGAGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101400 G...CAGAGGTGTGAGCTGTGCCCACACAAAGACGGGGCATTGAAGAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGATAATGGAG         GCTGGGCACACGTGGTGTGTGCCCTCTAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101897 CTGATAATGGAGGTG...CAGGCTGGGCACACGTGGTGTGTGCCCTCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATCCCCGAGGTGCAATTTGCCAACGTGCTCACCATGGAGCCCATCGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102160 ATCCCCGAGGTGCAATTTGCCAACGTGCTCACCATGGAGCCCATCGTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCAGTACGTGCCTCATGATCGCTTCAACAAG         ACCTGTTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102210 GCAGTACGTGCCTCATGATCGCTTCAACAAGGTC...CAGACCTGTTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TCTGCGAGGAGCAGGGCCGGGAGAGCAAGGCGGCCTCGGGAGCCTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103551 TCTGCGAGGAGCAGGGCCGGGAGAGCAAGGCGGCCTCGGGAGCCTGCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACCTGTAACCGCCATGGATGTCGACAAGCTTTCCACGTCACCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103601 ACCTGTAACCGCCATGGATGTCGACAAGCTTTCCACGTCACCTGGTG...

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    459    TGCCCAAATGGCAGGCTTGCTGTGTGAGGAAGAAGTGCTGGAGGTGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103847 TAGTGCCCAAATGGCAGGCTTGCTGTGTGAGGAAGAAGTGCTGGAGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACAACGTCAAGTACTGCGGCTACTGCAAATACCACTTCAGCAAGATG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103897 ACAACGTCAAGTACTGCGGCTACTGCAAATACCACTTCAGCAAGATGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    553       AAGACATCCCGGCACAGCAGCGGGGGAGGCGGAGGAGGCGCTGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103947 ...CAGAAGACATCCCGGCACAGCAGCGGGGGAGGCGGAGGAGGCGCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGGAGGAGGTGGCAGCATGGGGGGAGGTGGCAGTGGTTTCATCTCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106259 AGGAGGAGGTGGCAGCATGGGGGGAGGTGGCAGTGGTTTCATCTCTGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GGAGAAGCCGGTCAGCCTCACCATCCACGCAGCAGGAGAAGCACCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106309 GGAGAAGCCGGTCAGCCTCACCATCCACGCAGCAGGAGAAGCACCCCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CACCACGAGAGGGGCCAGAAGAAG         AGTCGAAAGGACAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 106359 CACCACGAGAGGGGCCAGAAGAAGGTA...CAGAGTCGAAAGGACAAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 ACGCCTTAAGCAGAAGCACAAGAAGCGGCCTGAGTCGCCCCCCAGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107076 ACGCCTTAAGCAGAAGCACAAGAAGCGGCCTGAGTCGCCCCCCAGCATCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCACCCCGCCCGTGGTCCCCACTGCTGACAAG         GTCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 107126 TCACCCCGCCCGTGGTCCCCACTGCTGACAAGGTA...CAGGTCTCCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TCGGCTTCCTCTTCCTCCCACCACGAGGCCAGCACGCAGGAGACCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109989 TCGGCTTCCTCTTCCTCCCACCACGAGGCCAGCACGCAGGAGACCTCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GAGCAGCAGGGAGTCAAAGGGGAAAAAGTCTTCCAGCCATAGCCTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110039 GAGCAGCAGGGAGTCAAAGGGGAAAAAGTCTTCCAGCCATAGCCTGAGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATAAAGGGAAGAAACTGAGCAGTGGGAAAGGTGTGAGCAGTTTTACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110089 ATAAAGGGAAGAAACTGAGCAGTGGGAAAGGTGTGAGCAGTTTTACCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCCTCCTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTGGGGGGCCCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110139 GCCTCCTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTGGGGGGCCCTTCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCCTGCAG         TCTCGTCCCTGCAGAGCTCCCCTGACTTCTCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 110189 GCCTGCAGGTG...CAGTCTCGTCCCTGCAGAGCTCCCCTGACTTCTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CATTCCCCAAGCTGGAGCAGCCAGAGGAGGACAAGTACTCCAAGCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110768 CATTCCCCAAGCTGGAGCAGCCAGAGGAGGACAAGTACTCCAAGCCCACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GCCCCCGCCCCTTCAGCCCCTCCTTCTCCCTCAGCTCCCGAGCCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110818 GCCCCCGCCCCTTCAGCCCCTCCTTCTCCCTCAGCTCCCGAGCCCCCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGCTGACCTTTTTGAGCAGAAGGTGGTCTTCTCTGGCTTTGGGCCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110868 GGCTGACCTTTTTGAGCAGAAGGTGGTCTTCTCTGGCTTTGGGCCCATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TGCGCTTCTCCACCACCACCTCCAGCTCAGGCCGGGCCCGGGCGCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110918 TGCGCTTCTCCACCACCACCTCCAGCTCAGGCCGGGCCCGGGCGCCCTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CCTGGGGACTATAAGTCTCCCCACGTCACGGGGTCTGGGGCCTCGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110968 CCTGGGGACTATAAGTCTCCCCACGTCACGGGGTCTGGGGCCTCGGCAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CACCCACAAACGGATGCCCGCACTGAGTGCCACCCCTGTGCCTGCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111018 CACCCACAAACGGATGCCCGCACTGAGTGCCACCCCTGTGCCTGCTGATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGACCCCTGAGACAGGCCTGAAGGAGAAGAAGCACAAAGCCAGCAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111068 AGACCCCTGAGACAGGCCTGAAGGAGAAGAAGCACAAAGCCAGCAAGAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AGCCGCCATGGGCCAGGCCGTCCCAAGGGCAGCCGGAACAAGGAGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111118 AGCCGCCATGGGCCAGGCCGTCCCAAGGGCAGCCGGAACAAGGAGGGCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGGGGGCCCAGCTGCCCCATCCTTGCCCAGTGCCCAGCTGGCTGGCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111168 TGGGGGCCCAGCTGCCCCATCCTTGCCCAGTGCCCAGCTGGCTGGCTTTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCGCCACTGCTGCCTCACCCTTCTCTGGAGGTTCCCTGGTCAGCTCTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 111218 CCGCCACTGCTGCCTCACCCTTCTCTGGAGGTTCCCTGGTCAGCTCCGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CTGGGAGGTCTGTCCTCCCGAACCTTTGGGCCTTCTGGGAGCTTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111268 CTGGGAGGTCTGTCCTCCCGAACCTTTGGGCCTTCTGGGAGCTTGCCCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CTTGAGCCTGGAGTCCCCCTTACTAGGGGCAG         GCATCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 111318 CTTGAGCCTGGAGTCCCCCTTACTAGGGGCAGGTT...CAGGCATCTACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CCAGTAATAAGGACCCCATCTCCCACAGTGGCGGGATGCTGCGGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111809 CCAGTAATAAGGACCCCATCTCCCACAGTGGCGGGATGCTGCGGGCTGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 TGCAGCACCCCTCTCTCCTCCAGCCTCCTGGGGCCCCCAGGGACCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111859 TGCAGCACCCCTCTCTCCTCCAGCCTCCTGGGGCCCCCAGGGACCTCGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CCTGCCCCGCCTCAGCCGCTCCCCGTTCACCAGCACCCTCCCCTCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111909 CCTGCCCCGCCTCAGCCGCTCCCCGTTCACCAGCACCCTCCCCTCCTCTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 CTGCTTCTATCTCCACCACTCAG         GTGTTTTCTCTGGCTGGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 111959 CTGCTTCTATCTCCACCACTCAGGTG...TAGGTGTTTTCTCTGGCTGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TCTACCTTTAGCCTCCCTTCTACCCACATCTTTGGAACCCCCATGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112231 TCTACCTTTAGCCTCCCTTCTACCCACATCTTTGGAACCCCCATGGGTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CGTTAATCCCCTCCTCTCCCAAGCTGAGAGCAGCCACACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 112281 CGTTAATCCCCTCCTCTCCCAAGCTGAGAGCAGCCACACAGGTA...AAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AGCCAGACCTGGAGGACTGCAGCTTCCGGTGTCGGGGGACCTCCCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113885 AGCCAGACCTGGAGGACTGCAGCTTCCGGTGTCGGGGGACCTCCCCTCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GAGAGTCTGTCTTCCAT         GTCCCCCATCAGCAGCCTCCCCGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 113935 GAGAGTCTGTCTTCCATGTG...CAGGTCCCCCATCAGCAGCCTCCCCGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 ACTCTTCGACCAGACAGCCTCTGCACCCTGTGGGGGCGGCCAGTTAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114142 ACTCTTCGACCAGACAGCCTCTGCACCCTGTGGGGGCGGCCAGTTAGACC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 CGGCGGCCCCAGGGACGACTAACATGGAGCAGCTTCTGGAGAAGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114192 CGGCGGCCCCAGGGACGACTAACATGGAGCAGCTTCTGGAGAAGCAGGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GACGGGGAGGCCGGCGTCAACA         TCGTGGAGATGCTGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 114242 GACGGGGAGGCCGGCGTCAACAGTG...CAGTCGTGGAGATGCTGAAGGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GCTGCACGCGCTGCAGAAGGAGAACCAGCGGCTGCAAGAGCAGATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114759 GCTGCACGCGCTGCAGAAGGAGAACCAGCGGCTGCAAGAGCAGATCCTGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 GCCTGACGGCCAAAAAGGAGCGGCTGCAGATTCTCAACGTGCAGCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114809 GCCTGACGGCCAAAAAGGAGCGGCTGCAGATTCTCAACGTGCAGCTCTCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 GTGCCCTTCCCTGCCCTGCCTGCTGCCCTGCCTGCCGCCAACGGCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114859 GTGCCCTTCCCTGCCCTGCCTGCTGCCCTGCCTGCCGCCAACGGCCCTGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CCCTGGGCCCTATGGCCTGCCTCCCCAAG         CCGGCAGCAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114909 CCCTGGGCCCTATGGCCTGCCTCCCCAAGGTG...CAGCCGGCAGCAGCG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 ACTCCTTGAGCACCAGCAAGAGCCCTCCGGGAAAGAGCAGCCTCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115039 ACTCCTTGAGCACCAGCAAGAGCCCTCCGGGAAAGAGCAGCCTCGGCCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 GACAACTCGCTGTCCACTTCTTCTGAG         GACCCACACTCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 115089 GACAACTCGCTGTCCACTTCTTCTGAGGTG...CAGGACCCACACTCAGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 CTGCCCGAGCCGCAGCAGCTCGTCGCTGTCCTTCCACAGCACGCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116260 CTGCCCGAGCCGCAGCAGCTCGTCGCTGTCCTTCCACAGCACGCCCCCAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 CGCTGCCCCTCCTCCAGCAGAGCCCTGCCACTCTGCCCCTGGCCCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116310 CGCTGCCCCTCCTCCAGCAGAGCCCTGCCACTCTGCCCCTGGCCCTGCCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 GGGGCCCCTGCCCCACTCCCGCCCCAGCCGCAGAACGGGTTGGGCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116360 GGGGCCCCTGCCCCACTCCCGCCCCAGCCGCAGAACGGGTTGGGCCGGGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 ACCCGGGGCAGCGGGGCTGGGGGCCATGCCCATGGCTGAGGGGCTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116410 ACCCGGGGCAGCGGGGCTGGGGGCCATGCCCATGGCTGAGGGGCTGTTGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 GGGGGCTGGCAGGCAGTGGGGGCCTGCCCCTCAATGGGCTCCTTGGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116460 GGGGGCTGGCAGGCAGTGGGGGCCTGCCCCTCAATGGGCTCCTTGGGGGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 TTGAATGGGGCCGCTGCCCCCAACCCCGCAAGCTTGAGCCAGGCTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116510 TTGAATGGGGCCGCTGCCCCCAACCCCGCAAGCTTGAGCCAGGCTGGCGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2757 GGCCCCCACGCTGCAGCTGCCAGGCTGTCTCAACAG         CCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 116560 GGCCCCCACGCTGCAGCTGCCAGGCTGTCTCAACAGGTG...CAGCCTTA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 CAGAGCAGCAGAGACATCTCCTTCAGCAGCAAGAGCAGCAGCTCCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117051 CAGAGCAGCAGAGACATCTCCTTCAGCAGCAAGAGCAGCAGCTCCAGCAA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 CTCCAGCAGCTCCTGGCCTCCCCGCAGCTGACCCCG         GAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 117101 CTCCAGCAGCTCCTGGCCTCCCCGCAGCTGACCCCGGTA...CAGGAACA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 CCAGACTGTTGTCTACCAGATGATCCAGCAGATCCAGCAGAAACGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118993 CCAGACTGTTGTCTACCAGATGATCCAGCAGATCCAGCAGAAACGGGAGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 TGCAGCGCCTGCAGATGGCTGGGGGCTCCCAGCTGCCCATGGCCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119043 TGCAGCGCCTGCAGATGGCTGGGGGCTCCCAGCTGCCCATGGCCAGCCTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2989 CTGGCAGGAAGCTCCACCCCGCTGCTGTCTGCGGGTACCCCTGGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119093 CTGGCAGGAAGCTCCACCCCGCTGCTGTCTGCGGGTACCCCTGGCCTGCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3039 GCCCACAGCGTCTGCTCCACCCCTGCTGCCCGCTGGAGCCCTAGTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119143 GCCCACAGCGTCTGCTCCACCCCTGCTGCCCGCTGGAGCCCTAGTGGCTC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3089 CCTCGCTTGGCAACAACACAAGTCTCATGGCCGCAGCAGCTGCAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119193 CCTCGCTTGGCAACAACACAAGTCTCATGGCCGCAGCAGCTGCAGCTGCA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3139 GCAGTAGCAGCAGCAGGCGGACCTCCAGTCCTCACTGCCCAGACCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119243 GCAGTAGCAGCAGCAGGCGGACCTCCAGTCCTCACTGCCCAGACCAACCC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3189 CTTCCTCAGCCTGTCGGGAGCAGAGGGCAGTGGCGGTGGCCCCAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119293 CTTCCTCAGCCTGTCGGGAGCAGAGGGCAGTGGCGGTGGCCCCAAAGGAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3239 GG         ACCGCTGACAAAGGAGCCTCAGCCAACCAGGAAAAAGGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119343 GGGTG...CAGACCGCTGACAAAGGAGCCTCAGCCAACCAGGAAAAAGGC