seq1 = pF1KB4334.tfa, 1419 bp
seq2 = pF1KB4334/gi568815583r_26447796.tfa (gi568815583r:26447796_26872962), 425167 bp

>pF1KB4334 1419
>gi568815583r:26447796_26872962 (Chr15)

(complement)

1-80  (100001-100080)   100% ->
81-172  (100191-100282)   100% ->
173-240  (100494-100561)   100% ->
241-461  (251429-251649)   100% ->
462-544  (289549-289631)   100% ->
545-682  (292507-292644)   100% ->
683-835  (305230-305382)   100% ->
836-1080  (311787-312031)   100% ->
1081-1419  (324829-325167)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGGCCTTGCGGGAGGAAGGCTTTTCGGCATCTTCTCGGCCCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGGCCTTGCGGGAGGAAGGCTTTTCGGCATCTTCTCGGCCCCGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGTGGCTGTGGTGTGCTGCGCCCAGAG         TGTGAACGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100051 GCTGGTGGCTGTGGTGTGCTGCGCCCAGAGGTA...CAGTGTGAACGATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCGGGAACATGTCCTTTGTGAAGGAGACGGTGGACAAGCTGTTGAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100202 CCGGGAACATGTCCTTTGTGAAGGAGACGGTGGACAAGCTGTTGAAAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACGACATTCGCCTAAGACCCGACTTCGGGG         GTCCCCCGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100252 TACGACATTCGCCTAAGACCCGACTTCGGGGGTA...CAGGTCCCCCGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTGCGTGGGGATGAACATCGACATCGCCAGCATCGACATGGTTTCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100504 CTGCGTGGGGATGAACATCGACATCGCCAGCATCGACATGGTTTCCGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAACATG         GATTATACCTTAACCATGTATTTTCAACAATAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100554 TCAACATGGTG...CAGGATTATACCTTAACCATGTATTTTCAACAATAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TGGAGAGATAAAAGGCTCGCCTATTCTGGGATCCCTCTCAACCTCACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251462 TGGAGAGATAAAAGGCTCGCCTATTCTGGGATCCCTCTCAACCTCACGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGACAATCGAGTGGCTGACCAGCTATGGGTGCCCGACACATATTTCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251512 TGACAATCGAGTGGCTGACCAGCTATGGGTGCCCGACACATATTTCTTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGACAAAAAGTCATTTGTGCATGGAGTGACAGTGAAAAACCGCATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251562 ATGACAAAAAGTCATTTGTGCATGGAGTGACAGTGAAAAACCGCATGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGTCTTCACCCTGATGGGACAGTGCTGTATGGGCTCAG         AAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 251612 CGTCTTCACCCTGATGGGACAGTGCTGTATGGGCTCAGGTC...CAGAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CACCACGACAGCAGCATGCATGATGGACCTCAGGAGATACCCCCTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289552 CACCACGACAGCAGCATGCATGATGGACCTCAGGAGATACCCCCTGGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGCAGAACTGCACTCTGGAAATTGAAAGCT         ATGGCTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 289602 AGCAGAACTGCACTCTGGAAATTGAAAGCTGTG...CAGATGGCTACACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACGGATGACATTGAGTTTTACTGGCGAGGCGGGGACAAGGCTGTTACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292518 ACGGATGACATTGAGTTTTACTGGCGAGGCGGGGACAAGGCTGTTACCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGTGGAAAGGATTGAGCTCCCGCAGTTCTCCATCGTGGAGCACCGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292568 AGTGGAAAGGATTGAGCTCCCGCAGTTCTCCATCGTGGAGCACCGTCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCTCGAGGAATGTTGTCTTCGCCACAG         GTGCCTATCCTCGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 292618 TCTCGAGGAATGTTGTCTTCGCCACAGGTG...TAGGTGCCTATCCTCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGTCACTGAGCTTTCGGTTGAAGAGGAACATTGGATACTTCATTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305244 CTGTCACTGAGCTTTCGGTTGAAGAGGAACATTGGATACTTCATTCTTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GACTTATATGCCCTCTATACTGATAACGATTCTGTCGTGGGTGTCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305294 GACTTATATGCCCTCTATACTGATAACGATTCTGTCGTGGGTGTCCTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGATCAATTATGATGCATCTGCTGCTAGAGTTGCCCTCG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 305344 GGATCAATTATGATGCATCTGCTGCTAGAGTTGCCCTCGGTA...TAGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATCACAACTGTGCTGACAATGACAACCATCAACACCCACCTTCGGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311789 ATCACAACTGTGCTGACAATGACAACCATCAACACCCACCTTCGGGAGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTTGCCCAAAATCCCCTATGTCAAAGCCATTGACATGTACCTTATGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311839 CTTGCCCAAAATCCCCTATGTCAAAGCCATTGACATGTACCTTATGGGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCTTCGTCTTTGTGTTCCTGGCCCTTCTGGAGTATGCCTTTGTCAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311889 GCTTCGTCTTTGTGTTCCTGGCCCTTCTGGAGTATGCCTTTGTCAACTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATTTTCTTTGGAAGAGGCCCTCAAAGGCAGAAGAAGCTTGCAGAAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311939 ATTTTCTTTGGAAGAGGCCCTCAAAGGCAGAAGAAGCTTGCAGAAAAGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AGCCAAGGCAAAGAATGACCGTTCAAAGAGCGAAAGCAACCGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 311989 AGCCAAGGCAAAGAATGACCGTTCAAAGAGCGAAAGCAACCGGGTA...T

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1081   GTGGATGCTCATGGAAATATTCTGTTGACATCGCTGGAAGTTCACAAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324827 AGGTGGATGCTCATGGAAATATTCTGTTGACATCGCTGGAAGTTCACAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAAATGAATGAGGTCTCAGGCGGCATTGGCGATACCAGGAATTCAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324877 GAAATGAATGAGGTCTCAGGCGGCATTGGCGATACCAGGAATTCAGCAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ATCCTTTGACAACTCAGGAATCCAGTACAGGAAACAGAGCATGCCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324927 ATCCTTTGACAACTCAGGAATCCAGTACAGGAAACAGAGCATGCCTCGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AAGGGCATGGGCGATTCCTGGGGGACAGAAGCCTCCCGCACAAGAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324977 AAGGGCATGGGCGATTCCTGGGGGACAGAAGCCTCCCGCACAAGAAGACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CATCTACGGAGGAGGTCTTCACAGCTCAAAATTAAAATACCTGATCTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 325027 CATCTACGGAGGAGGTCTTCACAGCTCAAAATTAAAATACCTGATCTAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CGATGTGAATGCCATAGACAGATGGTCCAGGATCGTGTTTCCATTCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 325077 CGATGTGAATGCCATAGACAGATGGTCCAGGATCGTGTTTCCATTCACTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TTTCTCTTTTCAACTTAGTTTACTGGCTGTACTATGTTAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 325127 TTTCTCTTTTCAACTTAGTTTACTGGCTGTACTATGTTAAC