seq1 = pF1KB4295.tfa, 711 bp
seq2 = pF1KB4295/gi568815592r_57090464.tfa (gi568815592r:57090464_57310380), 219917 bp

>pF1KB4295 711
>gi568815592r:57090464_57310380 (Chr6)

(complement)

1-155  (100001-100155)   100% ->
156-241  (102668-102753)   100% ->
242-398  (113775-113931)   100% ->
399-481  (115529-115611)   100% ->
482-574  (116447-116539)   100% ->
575-711  (119781-119917)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGGAGGAAGATATGGAAGTCGCCATAAAGATGGTGGTTGTAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGGAGGAAGATATGGAAGTCGCCATAAAGATGGTGGTTGTAGGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGCAGTTGGAAAATCAAGTATGATTCAGCGATATTGCAAAGGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAGCAGTTGGAAAATCAAGTATGATTCAGCGATATTGCAAAGGCATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTACAAAAGACTACAAGAAAACCATTGGAGTTGATTTTTTGGAGCGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTACAAAAGACTACAAGAAAACCATTGGAGTTGATTTTTTGGAGCGACAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTCA         AGTTAATGATGAAGATGTCAGACTAATGTTATGGGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTCAGTA...TAGAGTTAATGATGAAGATGTCAGACTAATGTTATGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACTGCAGGTCAGGAGGAATTTGATGCAATTACAAAGGCCTACTATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102704 CACTGCAGGTCAGGAGGAATTTGATGCAATTACAAAGGCCTACTATCGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242          GAGCCCAGGCTTGTGTGCTCGTGTTCTCTACCACAGATAGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102754 GTA...CAGGAGCCCAGGCTTGTGTGCTCGTGTTCTCTACCACAGATAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAATCTTTTGAAGCAGTTTCCAGTTGGAGAGAGAAAGTAGTAGCCGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113816 GAATCTTTTGAAGCAGTTTCCAGTTGGAGAGAGAAAGTAGTAGCCGAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGGAGATATACCAACTGTACTTGTGCAAAACAAGATTGATCTTCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113866 GGGAGATATACCAACTGTACTTGTGCAAAACAAGATTGATCTTCTGGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATTCTTGTATAAAGAA         TGAGGAAGCTGAGGCACTGGCAAAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113916 ATTCTTGTATAAAGAAGTA...CAGTGAGGAAGCTGAGGCACTGGCAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGGTTAAAGTTAAGATTCTACAGAACATCAGTGAAAGAAGATCTAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115554 AGGTTAAAGTTAAGATTCTACAGAACATCAGTGAAAGAAGATCTAAATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAATGAAG         TTTTTAAGTATTTGGCTGAAAAATACCTTCAGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 115604 GAATGAAGGTA...TAGTTTTTAAGTATTTGGCTGAAAAATACCTTCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AACTCAAACAACAAATAGCTGAGGATCCAGAACTAACGCATTCAAGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116480 AACTCAAACAACAAATAGCTGAGGATCCAGAACTAACGCATTCAAGTAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACAAGATTG         GTGTCTTTAATACATCTGGTGGAAGTCACTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 116530 AACAAGATTGGTA...CAGGTGTCTTTAATACATCTGGTGGAAGTCACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CGGTCAGAATTCAGGTACCCTCAATGGTGGAGATGTCATCAATCTTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119812 CGGTCAGAATTCAGGTACCCTCAATGGTGGAGATGTCATCAATCTTAGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCAACAAACAAAGGACCAAGAAAAACAGAAATCCTTTTAGCAGCTGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119862 CCAACAAACAAAGGACCAAGAAAAACAGAAATCCTTTTAGCAGCTGTAGC

    750     .
    706 ATACCC
        ||||||
 119912 ATACCC