seq1 = pF1KB4262.tfa, 531 bp
seq2 = pF1KB4262/gi568815581r_46239503.tfa (gi568815581r:46239503_46458397), 218895 bp

>pF1KB4262 531
>gi568815581r:46239503_46458397 (Chr17)

(complement)

1-148  (100001-100148)   100% ->
149-259  (105468-105578)   99% ->
260-531  (118624-118895)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAACATTTTTGAAAAGCTCTTTAAAAGTCTACTTGGGAAAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAACATTTTTGAAAAGCTCTTTAAAAGTCTACTTGGGAAAAAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGCGGATTCTTATATTGAGTTTGGATACAGCTGGAAAAACCACCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGCGGATTCTTATATTGAGTTTGGATACAGCTGGAAAAACCACCATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTATAAATTGAAGCTGGGGGAGACTGTGCCTGCCGTCCCTACAGTAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100101 TGTATAAATTGAAGCTGGGGGAGACTGTGCCTGCCGTCCCTACAGTAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149        GTTTCTGTGTGGAGACAGTAGAATATAAAAATAACACCTTCGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100151 A...TAGGTTTCTGTGTGGAGACAGTAGAATATAAAAATAACACCTTCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTCTGGGATGTTGGCAGCCACTTCAAAATCAGACCTCTGTGGCAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105511 TGTCTGGGATGTTGGCAGCCACTTCAAAATCAGACCTCTGTGGCAGCATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTTCCAGAACACAAAAG         GTGCCAGAAGCCCAGGAAGCACA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 105561 TTTTCCAGAACACAAAAGGTA...CAGGTGCCAGAAGCCCAGGAAGCACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CATCAAGGCTCACTTGCCAGCGGGGTGCTGCCAATAAAATGTAGTCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118647 CATCAAGGCTCACTTGCCAGCGGGGTGCTGCCAATAAAATGTAGTCACGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAATTTGGAATGTGGAAAGGAGGTAGAAGTCATCCTTTCCTCCCCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118697 GGAATTTGGAATGTGGAAAGGAGGTAGAAGTCATCCTTTCCTCCCCCATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAGCAGGTGTGCAGGCTCTGGTGGTCAGCTGGACTCCATACTCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118747 GCAGCAGGTGTGCAGGCTCTGGTGGTCAGCTGGACTCCATACTCCCCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGTCACCAGCCTGGGGACCGTGGGGCTGCAAGGACCTCAGCAGCGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118797 CAGTCACCAGCCTGGGGACCGTGGGGCTGCAAGGACCTCAGCAGCGGTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    483 CCCAAGTTTCCTGACTTCTTCCATCCTCTGGAAATCAGCTGTGGTAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118847 CCCAAGTTTCCTGACTTCTTCCATCCTCTGGAAATCAGCTGTGGTAAAG