seq1 = pF1KB4237.tfa, 2451 bp
seq2 = pF1KB4237/gi568815575f_70345202.tfa (gi568815575f:70345202_70602266), 257065 bp

>pF1KB4237 2451
>gi568815575f:70345202_70602266 (ChrX)

1-357  (100001-100357)   100% ->
358-408  (103712-103762)   100% ->
409-533  (104158-104282)   100% ->
534-703  (104489-104658)   100% ->
704-840  (104968-105104)   100% ->
841-985  (105438-105582)   100% ->
986-1145  (106666-106825)   100% ->
1146-1302  (108436-108592)   100% ->
1303-1405  (109013-109115)   100% ->
1406-1520  (133949-134063)   100% ->
1521-1697  (146906-147082)   100% ->
1698-1773  (147320-147395)   100% ->
1774-1819  (150207-150252)   100% ->
1820-1870  (153319-153369)   100% ->
1871-1972  (153975-154076)   100% ->
1973-2145  (154676-154848)   100% ->
2146-2255  (155270-155379)   100% ->
2256-2347  (155697-155788)   100% ->
2348-2451  (156962-157065)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACAAGCACCAGCACTGCTGTAAGTGCCCTGAGTGCTATGAGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACAAGCACCAGCACTGCTGTAAGTGCCCTGAGTGCTATGAGGTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCCTGGCCGCCCTGCGGCGCCTCGAGCCTCCGGGCTACGGCGACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCCTGGCCGCCCTGCGGCGCCTCGAGCCTCCGGGCTACGGCGACTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTCCCCGACCCTTACGGGCCAGGTGGGGGCAACGGCGCCAGCGCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGTCCCCGACCCTTACGGGCCAGGTGGGGGCAACGGCGCCAGCGCGGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TATGGGGGCTACAGCTCGCAGACCTTGCCCTCGCAGGCGGGGGCCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TATGGGGGCTACAGCTCGCAGACCTTGCCCTCGCAGGCGGGGGCCACCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACCCCTCGCACCAAGGCCAAGCTCATCCCCACCGGCCGGGATGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACCCCTCGCACCAAGGCCAAGCTCATCCCCACCGGCCGGGATGTGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGTGCCTCCTAAGCCAGTCCCGGGCAAGAGCACCCCCAAACTCAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGTGCCTCCTAAGCCAGTCCCGGGCAAGAGCACCCCCAAACTCAACGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCGGCCCCAGCTGGTGGCCAGAGTGCACCTGTACCAACCGGGACTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCGGCCCCAGCTGGTGGCCAGAGTGCACCTGTACCAACCGGGACTGGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAGCAG         GTGAATGGCAGTGATGGCATGTTCAAATATGAGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGAGCAGGTA...TAGGTGAATGGCAGTGATGGCATGTTCAAATATGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAATCGTACTTGAGAGG         GGCAACTCTGGCCTGGGCTTCAGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103746 AAATCGTACTTGAGAGGGTG...CAGGGCAACTCTGGCCTGGGCTTCAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCGCAGGTGGCATCGACAATCCCCATGTCCCTGATGACCCTGGCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104182 ATCGCAGGTGGCATCGACAATCCCCATGTCCCTGATGACCCTGGCATCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TATTACCAAGATTATCCCTGGTGGAGCAGCTGCCATGGATGGGAGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104232 TATTACCAAGATTATCCCTGGTGGAGCAGCTGCCATGGATGGGAGGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 G         GGTGAATGACTGTGTGCTGCGGGTGAATGAGGTGGACGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104282 GGTG...CAGGGTGAATGACTGTGTGCTGCGGGTGAATGAGGTGGACGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCGGAGGTGGTACACAGCCGGGCGGTGGAGGCGCTGAAGGAGGCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104529 TCGGAGGTGGTACACAGCCGGGCGGTGGAGGCGCTGAAGGAGGCAGGCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGTGGTGCGATTGGTGGTGCGGAGGCGACAGCCTCCACCCGAGACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104579 TGTGGTGCGATTGGTGGTGCGGAGGCGACAGCCTCCACCCGAGACCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGGAGGTCAACCTGCTCAAAGGGCCCAAAG         GCCTGGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104629 TGGAGGTCAACCTGCTCAAAGGGCCCAAAGGTG...CAGGCCTGGGTTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGCATTGCTGGGGGTATTGGCAACCAGCACATCCCAGGAGACAACAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104979 AGCATTGCTGGGGGTATTGGCAACCAGCACATCCCAGGAGACAACAGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTACATCACCAAGATCATTGAGGGGGGTGCTGCTCAGAAGGATGGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105029 CTACATCACCAAGATCATTGAGGGGGGTGCTGCTCAGAAGGATGGACGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TACAGATTGGGGACCGGCTGCTGGCG         GTGAACAACACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105079 TACAGATTGGGGACCGGCTGCTGGCGGTG...TAGGTGAACAACACCAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGCAGGATGTGAGGCACGAGGAAGCTGTGGCCTCACTGAAGAACACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105453 CTGCAGGATGTGAGGCACGAGGAAGCTGTGGCCTCACTGAAGAACACATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGATATGGTGTATTTGAAGGTGGCCAAGCCAGGCAGCCTCCACCTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105503 TGATATGGTGTATTTGAAGGTGGCCAAGCCAGGCAGCCTCCACCTCAACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACATGTACGCTCCCCCTGACTACGCCAGCA         CTTTTACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105553 ACATGTACGCTCCCCCTGACTACGCCAGCAGTA...CAGCTTTTACTGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTGGCTGACAACCACATAAGCCATAATTCCAGCCTGGGTTATCTCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106677 TTGGCTGACAACCACATAAGCCATAATTCCAGCCTGGGTTATCTCGGGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TGTGGAGAGCAAGGTCAGCTACCCTGCTCCTCCTCAGGTTCCCCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106727 TGTGGAGAGCAAGGTCAGCTACCCTGCTCCTCCTCAGGTTCCCCCCACCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCTACTCTCCTATTCCCAGGCACATGCTGGCTGAGGAGGACTTCACCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106777 GCTACTCTCCTATTCCCAGGCACATGCTGGCTGAGGAGGACTTCACCAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1146         AGAGCCTCGCAAGATCATCCTGCACAAAGGCTCCACAGGCCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106827 TA...CAGAGAGCCTCGCAAGATCATCCTGCACAAAGGCTCCACAGGCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGGCTTCAACATCGTAGGAGGAGAGGATGGAGAAGGCATTTTTGTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108478 GGGCTTCAACATCGTAGGAGGAGAGGATGGAGAAGGCATTTTTGTCTCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCATCCTGGCAGGAGGCCCAGCTGACCTGAGTGGGGAGCTGCGCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108528 TCATCCTGGCAGGAGGCCCAGCTGACCTGAGTGGGGAGCTGCGCAGGGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GACCGGATCTTATCG         GTGAATGGAGTGAATCTGAGGAATGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 108578 GACCGGATCTTATCGGTG...CAGGTGAATGGAGTGAATCTGAGGAATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AACTCATGAGCAGGCTGCAGCTGCTCTGAAACGGGCCGGCCAGTCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109039 AACTCATGAGCAGGCTGCAGCTGCTCTGAAACGGGCCGGCCAGTCAGTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCATTGTGGCCCAGTACAGACCTGAAG         AATACAGTCGCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 109089 CCATTGTGGCCCAGTACAGACCTGAAGGTA...CAGAATACAGTCGCTTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAATCGAAGATACATGACTTACGAGAACAAATGATGAACAGCAGCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133963 GAATCGAAGATACATGACTTACGAGAACAAATGATGAACAGCAGCATGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CTCTGGGTCTGGGTCCCTCCGAACAAGTGAAAAGAGGTCCTTGTATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134013 CTCTGGGTCTGGGTCCCTCCGAACAAGTGAAAAGAGGTCCTTGTATGTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 G         GGCCCTGTTTGATTATGATCGGACTCGGGACAGCTGCCTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134063 GGTA...CAGGGCCCTGTTTGATTATGATCGGACTCGGGACAGCTGCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CCAAGCCAGGGGCTCAGCTTCTCTTATGGTGACATTCTGCATGTCATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146946 CCAAGCCAGGGGCTCAGCTTCTCTTATGGTGACATTCTGCATGTCATTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TGCCTCTGATGATGAGTGGTGGCAGGCAAGGCTGGTGACCCCACACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146996 TGCCTCTGATGATGAGTGGTGGCAGGCAAGGCTGGTGACCCCACACGGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AAAGTGAGCAGATCGGTGTGATCCCCAGTAAGAAGAG         GGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 147046 AAAGTGAGCAGATCGGTGTGATCCCCAGTAAGAAGAGGTG...CAGGGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GAAAAGAAAGAAAGAGCTCGATTGAAAACTGTGAAGTTCCATGCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147324 GAAAAGAAAGAAAGAGCTCGATTGAAAACTGTGAAGTTCCATGCCAGGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GGGGATGATTGAGTCTAACAGG         GACTTCCCGGGGTTAAGTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 147374 GGGGATGATTGAGTCTAACAGGGTA...CAGGACTTCCCGGGGTTAAGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ACGATTATTATGGAGCAAAGAACCTGA         AAGGACAAGAGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 150226 ACGATTATTATGGAGCAAAGAACCTGAGTA...CAGAAGGACAAGAGGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GCTATTTTGTCATATGAGCCAGTGACACGGCAAGAAA         TTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 153333 GCTATTTTGTCATATGAGCCAGTGACACGGCAAGAAAGTA...TAGTTCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CTATGCAAGGCCTGTGATCATCCTGGGCCCAATGAAGGACCGAGTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153979 CTATGCAAGGCCTGTGATCATCCTGGGCCCAATGAAGGACCGAGTCAATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 ATGACCTGATCTCCGAATTTCCACATAAATTTGGATCCTGTGTGCCAC  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 154029 ATGACCTGATCTCCGAATTTCCACATAAATTTGGATCCTGTGTGCCACGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1973        ATACTACCCGGCCTCGACGTGATAATGAGGTGGATGGACAAGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154079 A...CAGATACTACCCGGCCTCGACGTGATAATGAGGTGGATGGACAAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CTACCACTTTGTGGTGTCCCGAGAACAAATGGAGAAAGATATTCAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154719 CTACCACTTTGTGGTGTCCCGAGAACAAATGGAGAAAGATATTCAGGACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 ACAAGTTCATCGAGGCGGGCCAATTTAATGATAACCTCTATGGGACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154769 ACAAGTTCATCGAGGCGGGCCAATTTAATGATAACCTCTATGGGACCAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 ATCCAGTCAGTGCGGGCAGTTGCAGAGAGG         GGCAAGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 154819 ATCCAGTCAGTGCGGGCAGTTGCAGAGAGGGTA...CAGGGCAAGCACTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CATCTTAGATGTTTCCGGCAATGCTATCAAGAGACTGCAGCAAGCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155281 CATCTTAGATGTTTCCGGCAATGCTATCAAGAGACTGCAGCAAGCACAAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TTTACCCCATTGCCATTTTCATCAAGCCCAAGTCCATTGAAGCCCTTAT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 155331 TTTACCCCATTGCCATTTTCATCAAGCCCAAGTCCATTGAAGCCCTTATG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256         GGAAATGAACCGAAGGCAGACATATGAACAAGCAAATAAGAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155381 TA...CAGGGAAATGAACCGAAGGCAGACATATGAACAAGCAAATAAGAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CTATGACAAAGCCATGAAACTGGAGCAGGAATTTGGAGAGTACTTTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155739 CTATGACAAAGCCATGAAACTGGAGCAGGAATTTGGAGAGTACTTTACAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348          CCATTGTACAGGGTGACTCACTGGAAGAGATTTATAACAAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155789 GTA...TAGCCATTGTACAGGGTGACTCACTGGAAGAGATTTATAACAAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 ATCAAACAAATCATTGAGGACCAGTCTGGGCACTACATTTGGGTCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157003 ATCAAACAAATCATTGAGGACCAGTCTGGGCACTACATTTGGGTCCCATC

   2600     .    :
   2439 CCCTGAAAAACTC
        |||||||||||||
 157053 CCCTGAAAAACTC