seq1 = pF1KB4219.tfa, 2823 bp
seq2 = pF1KB4219/gi568815587r_72477387.tfa (gi568815587r:72477387_72774207), 296821 bp

>pF1KB4219 2823
>gi568815587r:72477387_72774207 (Chr11)

(complement)

1-71  (100001-100071)   100% ->
72-144  (131882-131954)   100% ->
145-234  (165457-165546)   100% ->
235-323  (168982-169070)   100% ->
324-433  (176589-176698)   100% ->
434-489  (177560-177615)   100% ->
490-549  (182852-182911)   100% ->
550-703  (183628-183781)   100% ->
704-756  (183964-184016)   100% ->
757-831  (184227-184301)   100% ->
832-873  (184416-184457)   100% ->
874-939  (184968-185033)   100% ->
940-1070  (185294-185424)   100% ->
1071-1182  (188027-188138)   100% ->
1183-1222  (188615-188654)   100% ->
1223-1286  (188774-188837)   100% ->
1287-1359  (189264-189336)   100% ->
1360-1537  (189480-189657)   100% ->
1538-1650  (189895-190007)   100% ->
1651-1728  (190693-190770)   100% ->
1729-1851  (191642-191764)   99% ->
1852-1922  (192261-192331)   100% ->
1923-2045  (192729-192851)   100% ->
2046-2133  (193235-193322)   100% ->
2134-2181  (193584-193631)   100% ->
2182-2256  (194600-194674)   100% ->
2257-2356  (194825-194924)   100% ->
2357-2469  (195199-195311)   100% ->
2470-2508  (195694-195732)   100% ->
2509-2615  (195869-195975)   99% ->
2616-2823  (196614-196821)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCAGGCATGCGGCCACTCCATCCTCTGCAGGAGCCAGCAGTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCAGGCATGCGGCCACTCCATCCTCTGCAGGAGCCAGCAGTACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCAGCGCGACCGGCTGAGCC         GCGGGGCCAGCAGGTCTTCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100051 GGCAGCGCGACCGGCTGAGCCGTG...CAGGCGGGGCCAGCAGGTCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAAGCCGGACGAGCCGCCGCCGCCGCCGCAGCCATGCGCCGACAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131902 TCAAGCCGGACGAGCCGCCGCCGCCGCCGCAGCCATGCGCCGACAGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAG         GACGCCTTGCTGAGTCTGGGCTCTGTCATCGACATTTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131952 CAGGTA...CAGGACGCCTTGCTGAGTCTGGGCTCTGTCATCGACATTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGGCCTGCAACGTGCTGTCAAGGAGGCCCTGTCAGCTGTGCTCCCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165495 AGGCCTGCAACGTGCTGTCAAGGAGGCCCTGTCAGCTGTGCTCCCCCGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TG         GAAACTGTCTACACCTACCTACTGGATGGTGAGTCCCAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165545 TGGTA...TAGGAAACTGTCTACACCTACCTACTGGATGGTGAGTCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGGTGTGTGAGGACCCCCCACATGAGCTGCCCCAGGAGGGGAAAGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169021 CTGGTGTGTGAGGACCCCCCACATGAGCTGCCCCAGGAGGGGAAAGTCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324          GGAGGCTATCATCTCCCAGAAGCGGCTGGGCTGCAATGGGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169071 GTG...CAGGGAGGCTATCATCTCCCAGAAGCGGCTGGGCTGCAATGGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGGGCTTCTCAGACCTGCCAGGGAAGCCCTTGGCCAGGCTGGTGGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176630 TGGGCTTCTCAGACCTGCCAGGGAAGCCCTTGGCCAGGCTGGTGGCTCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGGCTCCTGATACCCAAG         TGCTGGTCATGCCGCTAGCGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 176680 CTGGCTCCTGATACCCAAGGTA...CAGTGCTGGTCATGCCGCTAGCGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CAAGGAGGCTGGGGCCGTGGCAGCTGTCATCTTG         GTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 177582 CAAGGAGGCTGGGGCCGTGGCAGCTGTCATCTTGGTA...CAGGTGCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GTGGCCAGCTGAGTGATAATGAGGAATGGAGCCTGCAGGCGGTGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182859 GTGGCCAGCTGAGTGATAATGAGGAATGGAGCCTGCAGGCGGTGGAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CAT         ACCCTGGTCGCCCTGCGGAGGGTGCAGGTCCTGCAGCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182909 CATGTG...CAGACCCTGGTCGCCCTGCGGAGGGTGCAGGTCCTGCAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GCGCGGGCCCAGGGAGGCTCCCCGAGCCGTCCAGAACCCCCCGGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183666 GCGCGGGCCCAGGGAGGCTCCCCGAGCCGTCCAGAACCCCCCGGAGGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CGGCGGAAGACCAGAAGGGCGGGGCGGCGTACACCGACCGCGACCGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183716 CGGCGGAAGACCAGAAGGGCGGGGCGGCGTACACCGACCGCGACCGCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ATCCTCCAACTGTGCG         GGGAACTCTACGACCTGGATGCCTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 183766 ATCCTCCAACTGTGCGGTG...CAGGGGAACTCTACGACCTGGATGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TTCCCTGCAGCTCAAAGTGCTCCAATAC         CTGCAGCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 183989 TTCCCTGCAGCTCAAAGTGCTCCAATACGTG...CAGCTGCAGCAGGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 CCCGGGCATCCCGCTGCTGCCTCCTGCTGGTGTCGGAGGACAATCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184240 CCCGGGCATCCCGCTGCTGCCTCCTGCTGGTGTCGGAGGACAATCTCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 CTTTCTTGCAAG         GTCATCGGAGACAAAGTGCTCGGGGAAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 184290 CTTTCTTGCAAGGTG...CAGGTCATCGGAGACAAAGTGCTCGGGGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 GGTCAGCTTTCCC         TTGACAGGATGCCTGGGCCAGGTGGTGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 184445 GGTCAGCTTTCCCGTG...TAGTTGACAGGATGCCTGGGCCAGGTGGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 AAGACAAGAAGTCCATCCAGCTGAAGGACCTCACCTCC         GAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 184996 AAGACAAGAAGTCCATCCAGCTGAAGGACCTCACCTCCGTA...CAGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    943 GATGTACAACAGCTGCAGAGCATGTTGGGCTGTGAGCTGCAGGCCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185297 GATGTACAACAGCTGCAGAGCATGTTGGGCTGTGAGCTGCAGGCCATGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    993 CTGTGTCCCTGTCATCAGCCGGGCCACTGACCAGGTGGTGGCCTTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185347 CTGTGTCCCTGTCATCAGCCGGGCCACTGACCAGGTGGTGGCCTTGGCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 GCGCCTTCAACAAGCTAGAAGGAGACTT         GTTCACCGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 185397 GCGCCTTCAACAAGCTAGAAGGAGACTTGTG...CAGGTTCACCGACGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1084 GACGAGCATGTGATCCAGCACTGCTTCCACTACACCAGCACCGTGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188040 GACGAGCATGTGATCCAGCACTGCTTCCACTACACCAGCACCGTGCTCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1134 CAGCACCCTGGCCTTCCAGAAGGAACAGAAACTCAAGTGTGAGTGCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 188090 CAGCACCCTGGCCTTCCAGAAGGAACAGAAACTCAAGTGTGAGTGCCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183         GCTCTTCTCCAAGTGGCAAAGAACCTCTTCACCCACCTGG  
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 188140 TG...CAGGCTCTTCTCCAAGTGGCAAAGAACCTCTTCACCCACCTGGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1223        ATGACGTCTCTGTCCTGCTCCAGGAGATCATCACGGAGGCCAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188657 G...CAGATGACGTCTCTGTCCTGCTCCAGGAGATCATCACGGAGGCCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1266 AAACCTCAGCAACGCAGAGAT         CTGCTCTGTGTTCCTGCTGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 188817 AAACCTCAGCAACGCAGAGATGTG...CAGCTGCTCTGTGTTCCTGCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1307 ATCAGAATGAGCTGGTGGCCAAGGTGTTCGACGGGGGCGTGGTGGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189284 ATCAGAATGAGCTGGTGGCCAAGGTGTTCGACGGGGGCGTGGTGGATGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1357 GAG         AGCTATGAGATCCGCATCCCGGCCGATCAGGGCATCGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189334 GAGGTG...CAGAGCTATGAGATCCGCATCCCGGCCGATCAGGGCATCGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1398 GGGACACGTGGCGACCACGGGCCAGATCCTGAACATCCCTGACGCATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189518 GGGACACGTGGCGACCACGGGCCAGATCCTGAACATCCCTGACGCATATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1448 CCCATCCGCTTTTCTACCGCGGCGTGGACGACAGCACCGGCTTCCGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189568 CCCATCCGCTTTTCTACCGCGGCGTGGACGACAGCACCGGCTTCCGCACG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1498 CGCAACATCCTCTGCTTCCCCATCAAGAACGAGAACCAGG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 189618 CGCAACATCCTCTGCTTCCCCATCAAGAACGAGAACCAGGGTG...CAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1539 GGTCATCGGTGTGGCCGAGCTGGTGAACAAGATCAATGGGCCATGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189896 GGTCATCGGTGTGGCCGAGCTGGTGAACAAGATCAATGGGCCATGGTTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1589 GCAAGTTCGACGAGGACCTGGCGACGGCCTTCTCCATCTACTGCGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189946 GCAAGTTCGACGAGGACCTGGCGACGGCCTTCTCCATCTACTGCGGCATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1639 AGCATCGCCCAT         TCTCTCCTATACAAAAAAGTGAATGAGGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 189996 AGCATCGCCCATGTG...TAGTCTCTCCTATACAAAAAAGTGAATGAGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1680 TCAGTATCGCAGCCACCTGGCCAATGAGATGATGATGTACCACATGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 190722 TCAGTATCGCAGCCACCTGGCCAATGAGATGATGATGTACCACATGAAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729         GTCTCCGACGATGAGTATACCAAACTTCTCCATGATGGGATC
        >>...>>>|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 190772 TG...TAGGTCTCCGATGATGAGTATACCAAACTTCTCCATGATGGGATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1771 CAGCCTGTGGCTGCCATTGACTCCAATTTTGCAAGTTTCACCTATACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191684 CAGCCTGTGGCTGCCATTGACTCCAATTTTGCAAGTTTCACCTATACCCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1821 TCGTTCCCTGCCCGAGGATGACACGTCCATG         GCCATCCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 191734 TCGTTCCCTGCCCGAGGATGACACGTCCATGGTG...CAGGCCATCCTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1862 GCATGCTGCAGGACATGAATTTCATCAACAACTACAAAATTGACTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192271 GCATGCTGCAGGACATGAATTTCATCAACAACTACAAAATTGACTGCCCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1912 ACCCTGGCCCG         GTTCTGTTTGATGGTGAAGAAGGGCTACCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 192321 ACCCTGGCCCGGTT...CAGGTTCTGTTTGATGGTGAAGAAGGGCTACCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1953 GGATCCCCCCTACCACAACTGGATGCACGCCTTTTCTGTCTCCCACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192759 GGATCCCCCCTACCACAACTGGATGCACGCCTTTTCTGTCTCCCACTTCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2003 GCTACCTGCTCTACAAGAACCTGGAGCTCACCAACTACCTCGA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 192809 GCTACCTGCTCTACAAGAACCTGGAGCTCACCAACTACCTCGAGTG...C

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2046   GGACATCGAGATCTTTGCCTTGTTTATTTCCTGCATGTGTCATGACCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193233 AGGGACATCGAGATCTTTGCCTTGTTTATTTCCTGCATGTGTCATGACCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2094 GGACCACAGAGGCACAAACAACTCTTTCCAGGTGGCCTCG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 193283 GGACCACAGAGGCACAAACAACTCTTTCCAGGTGGCCTCGGTA...CAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2135 AATCTGTGCTGGCTGCGCTCTACAGCTCTGAGGGCTCCGTCATGGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 193585 AATCTGTGCTGGCTGCGCTCTACAGCTCTGAGGGCTCCGTCATGGAGGTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2182       AGGCACCACTTTGCTCAGGCCATCGCCATCCTCAACACCCACGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193635 ...CAGAGGCACCACTTTGCTCAGGCCATCGCCATCCTCAACACCCACGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2226 CTGCAACATCTTTGATCATTTCTCCCGGAAG         GACTATCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 194644 CTGCAACATCTTTGATCATTTCTCCCGGAAGGTG...CAGGACTATCAGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2267 GCATGCTGGATCTGATGCGGGACATCATCTTGGCCACAGACCTGGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194835 GCATGCTGGATCTGATGCGGGACATCATCTTGGCCACAGACCTGGCCCAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2317 CATCTCCGCATCTTCAAGGACCTCCAGAAGATGGCTGAGG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 194885 CATCTCCGCATCTTCAAGGACCTCCAGAAGATGGCTGAGGGTG...CAGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2358 GGGCTACGACCGAAACAACAAGCAGCACCACAGACTTCTCCTCTGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195200 GGGCTACGACCGAAACAACAAGCAGCACCACAGACTTCTCCTCTGCCTCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2408 TCATGACCTCCTGTGACCTCTCTGACCAGACCAAGGGCTGGAAGACTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195250 TCATGACCTCCTGTGACCTCTCTGACCAGACCAAGGGCTGGAAGACTACG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2458 AGAAAGATCGCG         GAGCTGATCTACAAAGAATTCTTCTCCCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 195300 AGAAAGATCGCGGTA...CAGGAGCTGATCTACAAAGAATTCTTCTCCCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2499 GGGAGACCTG         GAGAAGGCCATGGGCAACAGGCCGATGGAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 195723 GGGAGACCTGGTA...CAGGAGAAGGCCATGGGCAACAGGCCGATGGAGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2540 TGATGGACCGGGAGAAGGCCTATATCCCTGAGCTGCAAATCAGCTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195900 TGATGGACCGGGAGAAGGCCTATATCCCTGAGCTGCAAATCAGCTTCATG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2590 GAGCACATTGCGATGCCCATCTACAA         GCTGTTGCAGGACCT
        ||||||||||| ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 195950 GAGCACATTGCAATGCCCATCTACAAGTG...CAGGCTGTTGCAGGACCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2631 GTTCCCCAAAGCGGCAGAGCTGTACGAGCGCGTGGCCTCCAACCGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196629 GTTCCCCAAAGCGGCAGAGCTGTACGAGCGCGTGGCCTCCAACCGTGAGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2681 ACTGGACCAAGGTGTCCCACAAGTTCACCATCCGCGGCCTCCCAAGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196679 ACTGGACCAAGGTGTCCCACAAGTTCACCATCCGCGGCCTCCCAAGTAAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2731 AACTCGCTGGACTTCCTGGATGAGGAGTACGAGGTGCCTGATCTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196729 AACTCGCTGGACTTCCTGGATGAGGAGTACGAGGTGCCTGATCTGGATGG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :
   2781 CACTAGGGCCCCCATCAATGGCTGCTGCAGCCTTGATGCTGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196779 CACTAGGGCCCCCATCAATGGCTGCTGCAGCCTTGATGCTGAG