seq1 = pF1KB4165.tfa, 2478 bp
seq2 = pF1KB4165/gi568815582r_57659728.tfa (gi568815582r:57659728_57898243), 238516 bp

>pF1KB4165 2478
>gi568815582r:57659728_57898243 (Chr16)

(complement)

1-172  (100001-100172)   100% ->
173-315  (103103-103245)   100% ->
316-381  (125956-126021)   100% ->
382-525  (126558-126701)   100% ->
526-765  (126807-127046)   99% ->
766-939  (127544-127717)   100% ->
940-1087  (128289-128436)   100% ->
1088-1218  (128519-128649)   100% ->
1219-1330  (131259-131370)   100% ->
1331-1512  (132604-132785)   100% ->
1513-1617  (133997-134101)   100% ->
1618-1748  (135974-136104)   100% ->
1749-1872  (136708-136831)   99% ->
1873-2002  (137073-137202)   100% ->
2003-2232  (137289-137518)   100% ->
2233-2367  (137828-137962)   100% ->
2368-2478  (138408-138516)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCCCCTCTCGCAGGACGTGGAACCTGGGAGCCACGCCCTCGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCCCCTCTCGCAGGACGTGGAACCTGGGAGCCACGCCCTCGCTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCTGTGGAGAGTGGGCCGGGCCCCGGAGCCCGAGCCGGGGATGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCCTGTGGAGAGTGGGCCGGGCCCCGGAGCCCGAGCCGGGGATGGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCCGCCCCAGCCCCAGCCAGCCCGGCCGCCCGCCCTTTCCCACACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCCCGCCCCAGCCCCAGCCAGCCCGGCCGCCCGCCCTTTCCCACACACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCCGGGGAGGTTGAGAACTG         GGCGTGGAAAAGATACCCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100151 GGCCCGGGGAGGTTGAGAACTGGTG...CAGGGCGTGGAAAAGATACCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTCTGCGGTGACGAGGACTCCAGTGCCCGAAGTGCAGCTCGCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103122 AGTCTGCGGTGACGAGGACTCCAGTGCCCGAAGTGCAGCTCGCCCAGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAGCTCAGTGCCGAGCCCTTAGCGTGGACTGGGCTGGCCCCGGAAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103172 TAGCTCAGTGCCGAGCCCTTAGCGTGGACTGGGCTGGCCCCGGAAGCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACGGGCTCTACCTGACCCTGCAG         GTAGAACACCTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103222 CACGGGCTCTACCTGACCCTGCAGGTA...CAGGTAGAACACCTGAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCTGAGCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 125973 GAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCTGAGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    382         GGGGGCACCGACTTGGAGAAGCACCGGGACCTGCTGATGGTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126023 TG...CAGGGGGGCACCGACTTGGAGAAGCACCGGGACCTGCTGATGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126600 GAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126650 AGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AG         GAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126700 AGGTG...CAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126846 CTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126896 GCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTCAGTCGGCGCCTGCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 126946 GCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126996 GACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 G         TATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127046 GGTG...CAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127584 AGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127634 GTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAG         ATTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 127684 CTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGGTA...CAGATTGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128296 TGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128346 CAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 128396 AGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGTG...TAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128519 GCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128569 AACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAG         ATAGGCCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 128619 GCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGGTG...CAGATAGGCCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131269 CCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131319 CGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AG         GGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131369 AGGTG...CAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132643 AAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132693 GACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGAC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 132743 CGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTG...C

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1513   GTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133995 AGGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134045 AATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GATGGAG         GGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134095 GATGGAGGTG...CAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136008 CCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 136058 TACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1749       GGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136108 ...CAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TGTGCCCAGATGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136752 TGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAG         GTGTTTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 136802 CAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTG...CAGGTGTTTGAGTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137084 TGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CCCGCTCGCACGCGCTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137134 CCCGCTCGCACGCGCTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 ACAGGCCTCCGCACCACGG         GGAAGCTGAACCTGGTGGACTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 137184 ACAGGCCTCCGCACCACGGGTG...CAGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 GGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137311 GGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137361 GGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137411 GCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 CACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137461 CACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 TGGTACAG         GTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 137511 TGGTACAGGTG...TAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137861 CTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 TGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137911 TGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 AG         TGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137961 AGGTA...CAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 GCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138447 GCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCG

   2600     .    :    .    :
   2457 GAGGAAGCTGCAGCCCTCGGCC
        ||||||||||||||||||||--
 138497 GAGGAAGCTGCAGCCCTCGG