seq1 = pF1KB4159.tfa, 435 bp
seq2 = pF1KB4159/gi568815586r_16451225.tfa (gi568815586r:16451225_16700860), 249636 bp

>pF1KB4159 435
>gi568815586r:16451225_16700860 (Chr12)

(complement)

1-206  (100001-100206)   100% ->
207-332  (140323-140448)   100% ->
333-435  (149534-149636)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCTCAGTCCAGCCAGACACCAAGCCGAAAGGTTGTGCTGGCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCTCAGTCCAGCCAGACACCAAGCCGAAAGGTTGTGCTGGCTGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGAAAGATCAAGGACCGGTATCTTCTAAAGGCACTGGACAAATACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGAAAGATCAAGGACCGGTATCTTCTAAAGGCACTGGACAAATACTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGAAGACTGCCTGAAGTGTGCCTGCTGTGACTGTCGCTTGGGAGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGAAGACTGCCTGAAGTGTGCCTGCTGTGACTGTCGCTTGGGAGAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCTCCACCCTGTACACTAAAGCTAATCTTATCCTTTGTCGCAGAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCTCCACCCTGTACACTAAAGCTAATCTTATCCTTTGTCGCAGAGACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTGAG         GCTCTTTGGTGTAACGGGAAACTGCGCTGCCTGTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTGAGGTA...TAGGCTCTTTGGTGTAACGGGAAACTGCGCTGCCTGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTAAGCTCATCCCTGCCTTTGAGATGGTGATGCGTGCCAAGGACAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140358 GTAAGCTCATCCCTGCCTTTGAGATGGTGATGCGTGCCAAGGACAATGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACCACCTGGACTGCTTTGCATGTCAGCTTTGTAATCAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 140408 TACCACCTGGACTGCTTTGCATGTCAGCTTTGTAATCAGAGGTA...CAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATTTTGTGTTGGAGACAAATTTTTCCTAAAGAATAACATGATCCTTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149534 ATTTTGTGTTGGAGACAAATTTTTCCTAAAGAATAACATGATCCTTTGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGACGGACTACGAGGAAGGTTTAATGAAAGAAGGTTATGCACCCCAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149584 AGACGGACTACGAGGAAGGTTTAATGAAAGAAGGTTATGCACCCCAGGTT

    450 
    433 CGC
        |||
 149634 CGC