seq1 = pF1KB4150.tfa, 381 bp
seq2 = pF1KB4150/gi568815593f_32488513.tfa (gi568815593f:32488513_32701081), 212569 bp

>pF1KB4150 381
>gi568815593f:32488513_32701081 (Chr5)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-195  (103051-103173)   100% ->
196-304  (110449-110557)   100% ->
305-381  (112493-112569)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTAAATCAAAGGAACTTGTTTCTTCAAGCTCTTCTGGCAGTGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTAAATCAAAGGAACTTGTTTCTTCAAGCTCTTCTGGCAGTGATTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACAGTGAGGTTGACAAAAAG         TTAAAGAGGAAAAAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 TGACAGTGAGGTTGACAAAAAGGTG...TAGTTAAAGAGGAAAAAGCAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGCTCCAGAAAAACCTGTAAAGAAACAAAAGACAGGTGAGACTTCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103070 TTGCTCCAGAAAAACCTGTAAAGAAACAAAAGACAGGTGAGACTTCGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCCTGTCATCTTCTAAACAGAGCAGCAGCAGCAGAGATGATAACATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103120 GCCCTGTCATCTTCTAAACAGAGCAGCAGCAGCAGAGATGATAACATGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAG         ATTGGGAAAATGAGGTACGTTAGTGTTCGCGATTTTA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103170 TCAGGTA...CAGATTGGGAAAATGAGGTACGTTAGTGTTCGCGATTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGGCAAAGTGCTAATTGATATTAGAGAATATTGGATGGATCCTGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110486 AAGGCAAAGTGCTAATTGATATTAGAGAATATTGGATGGATCCTGAAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAATGAAACCAGGAAGAAAAG         GTATTTCTTTAAATCCAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110536 GAAATGAAACCAGGAAGAAAAGGTG...TAGGTATTTCTTTAAATCCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACAATGGAGCCAGCTGAAGGAACAGATTTCTGACATTGATGATGCAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112512 ACAATGGAGCCAGCTGAAGGAACAGATTTCTGACATTGATGATGCAGTAA

    400     .
    374 GAAAACTG
        ||||||||
 112562 GAAAACTG