seq1 = pF1KB4148.tfa, 1572 bp
seq2 = pF1KB4148/gi568815588r_73338245.tfa (gi568815588r:73338245_73579519), 241275 bp

>pF1KB4148 1572
>gi568815588r:73338245_73579519 (Chr10)

(complement)

1-85  (83631-83715)   100% ->
86-286  (100003-100203)   100% ->
287-411  (100897-101021)   100% ->
412-523  (104490-104601)   100% ->
524-669  (107907-108052)   100% ->
670-809  (108311-108450)   100% ->
810-887  (108556-108633)   100% ->
888-982  (108739-108833)   100% ->
983-1108  (111842-111967)   100% ->
1109-1186  (125031-125108)   100% ->
1187-1268  (132947-133028)   100% ->
1269-1366  (134698-134795)   100% ->
1367-1396  (139619-139648)   100% ->
1397-1572  (141100-141275)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCCCGGAGCCGGCCCGGGCTGCACCGCCCCCACCCCCGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  83631 ATGGCCGCCCCGGAGCCGGCCCGGGCTGCACCGCCCCCACCCCCGCCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCCCCCTCCCGGGGCTGACCGCGTCGTCAAAG         CTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  83681 GCCGCCCCCTCCCGGGGCTGACCGCGTCGTCAAAGGTG...CAGCTGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTTTCCCCCCAACACATCGCTTGACATCTGAAGAAGTATTTGATTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 CTTTCCCCCCAACACATCGCTTGACATCTGAAGAAGTATTTGATTTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGATACCCAGGGTTGATGTTCTGAAGAACCACTTGGTGAAAGAAGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 GGGATACCCAGGGTTGATGTTCTGAAGAACCACTTGGTGAAAGAAGGTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTAGATGAAGAAATTGCGCTTAGAATTATCAATGAGGGTGCTGCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100109 AGTAGATGAAGAAATTGCGCTTAGAATTATCAATGAGGGTGCTGCCATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCGGAGAGAGAAAACCATGATAGAAGTAGAAGCTCCAATCACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100159 TTCGGAGAGAGAAAACCATGATAGAAGTAGAAGCTCCAATCACAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     TGTGTGGTGACATCCATGGCCAATTTTTTGATCTGATGAAACTTTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100209 .CAGTGTGTGGTGACATCCATGGCCAATTTTTTGATCTGATGAAACTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGAAGTAGGAGGATCACCTGCTAATACACGATACCTTTTTCTTGGCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100943 TGAAGTAGGAGGATCACCTGCTAATACACGATACCTTTTTCTTGGCGATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGTGGACAGAGGTTATTTTAGTATAGAG         TGTGTCTTATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100993 ATGTGGACAGAGGTTATTTTAGTATAGAGGTA...CAGTGTGTCTTATAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTATGGGTTCTGAAGATTCTATACCCAAGCACATTATTTCTTCTGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104502 TTATGGGTTCTGAAGATTCTATACCCAAGCACATTATTTCTTCTGAGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAACCATGAATGCAGACACCTTACTGAATATTTTACCTTTAAGCAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104552 CAACCATGAATGCAGACACCTTACTGAATATTTTACCTTTAAGCAGGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524          GTAAAATTAAGTATTCGGAAAGAGTCTATGAAGCTTGTATG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104602 GTG...TAGGTAAAATTAAGTATTCGGAAAGAGTCTATGAAGCTTGTATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAAGCTTTTGATAGTTTGCCTCTTGCTGCACTTTTAAACCAACAGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107948 GAAGCTTTTGATAGTTTGCCTCTTGCTGCACTTTTAAACCAACAGTTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTGTGTTCATGGTGGACTTTCACCAGAAATACACACACTGGATGATATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107998 TTGTGTTCATGGTGGACTTTCACCAGAAATACACACACTGGATGATATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGAGA         TTAGATAGATTCAAAGAGCCACCTGCATTTGGACCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108048 GGAGAGTA...CAGTTAGATAGATTCAAAGAGCCACCTGCATTTGGACCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATGTGTGACTTGTTATGGTCCGATCCTTCTGAAGATTTTGGAAATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108347 ATGTGTGACTTGTTATGGTCCGATCCTTCTGAAGATTTTGGAAATGAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATCACAGGAACATTTTAGTCACAATACAGTTCGAGGATGTTCTTATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108397 ATCACAGGAACATTTTAGTCACAATACAGTTCGAGGATGTTCTTATTTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATAA         CTATCCAGCAGTGTGTGAATTTTTGCAAAACAATAAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108447 ATAAGTA...CAGCTATCCAGCAGTGTGTGAATTTTTGCAAAACAATAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTGTTATCGATTATTAGAGCTCATGAAGCTCAAGATGCAGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 108593 TTGTTATCGATTATTAGAGCTCATGAAGCTCAAGATGCAGGGTA...CAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTATAGAATGTACAGAAAAAGTCAAACTACAGGGTTCCCTTCATTAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108739 CTATAGAATGTACAGAAAAAGTCAAACTACAGGGTTCCCTTCATTAATAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CAATTTTTTCGGCACCTAATTACTTAGATGTCTACAATAATAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 108789 CAATTTTTTCGGCACCTAATTACTTAGATGTCTACAATAATAAAGGTA..

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983     CTGCTGTATTAAAGTATGAAAATAATGTGATGAATATTCGACAGTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108839 .CAGCTGCTGTATTAAAGTATGAAAATAATGTGATGAATATTCGACAGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TAACTGTTCTCCACATCCTTACTGGTTGCCTAATTTTATGGATGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111888 TAACTGTTCTCCACATCCTTACTGGTTGCCTAATTTTATGGATGTCTTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CGTGGTCTTTACCGTTTGTTGGAGAAAAAG         TGACAGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 111938 CGTGGTCTTTACCGTTTGTTGGAGAAAAAGGTA...TAGTGACAGAAATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TTGGTAAATGTTCTGAGTATTTGCTCTGATGATGAACTAATGACTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125042 TTGGTAAATGTTCTGAGTATTTGCTCTGATGATGAACTAATGACTGAAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGAAGACCAGTTTGATG         GTTCAGCTGCAGCCCGGAAAGAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 125092 TGAAGACCAGTTTGATGGTA...TAGGTTCAGCTGCAGCCCGGAAAGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCATAAGAAACAAAATTCGAGCAATTGGCAAGATGGCAAGAGTCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132971 TCATAAGAAACAAAATTCGAGCAATTGGCAAGATGGCAAGAGTCTTCTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GTTCTCAG         GGAGGAGAGTGAAAGTGTGCTGACACTCAAGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 133021 GTTCTCAGGTA...TAGGGAGGAGAGTGAAAGTGTGCTGACACTCAAGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CCTGACTCCCACAGGGATGTTGCCTAGTGGAGTGTTAGCTGGAGGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134731 CCTGACTCCCACAGGGATGTTGCCTAGTGGAGTGTTAGCTGGAGGACGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGACCCTGCAAAGTG         CCACAGTTGAGGCTATTGAGGCTGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 134781 AGACCCTGCAAAGTGGTA...CAGCCACAGTTGAGGCTATTGAGGCTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AAAG         CAATACGAGGATTCTCTCCACCACATAGAATCTGCAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139645 AAAGGTA...AAGCAATACGAGGATTCTCTCCACCACATAGAATCTGCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TTTTGAAGAGGCAAAGGGTTTGGATAGGATCAATGAGAGAATGCCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141137 TTTTGAAGAGGCAAAGGGTTTGGATAGGATCAATGAGAGAATGCCACCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GGAAAGATGCTGTACAGCAAGATGGTTTCAATTCTCTGAACACCGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141187 GGAAAGATGCTGTACAGCAAGATGGTTTCAATTCTCTGAACACCGCACAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .
   1534 GCCACTGAGAACCACGGGACGGGCAACCATACTGCCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141237 GCCACTGAGAACCACGGGACGGGCAACCATACTGCCCAG